DNBSEQ-G99自上市以來(lái),憑借著測(cè)序速度快、雙載臺(tái)靈活上機(jī)及操作簡(jiǎn)單等優(yōu)勢(shì),成為了病原微生物領(lǐng)域“新秀”,無(wú)論是病原宏基因組測(cè)序(mNGS)還是靶向測(cè)序(tNGS),亦或是二者的聯(lián)合應(yīng)用(mNGS+tNGS),G99都是“量身定制”的機(jī)型選擇。隨著2023年獲批國(guó)家藥品監(jiān)督管理局(NMPA)醫(yī)療器械注冊(cè)證,G99全方位解鎖臨床應(yīng)用領(lǐng)域。
為了更好地滿(mǎn)足臨床檢測(cè)需求,瑞因邁拓采用基于DNBSEQ平臺(tái)的自研、自產(chǎn)試劑盒,在G99上進(jìn)行了病原宏基因組測(cè)序和靶向測(cè)序聯(lián)合方案的性能測(cè)試。結(jié)果顯示,G99測(cè)序平臺(tái)的下機(jī)數(shù)據(jù)量、數(shù)據(jù)質(zhì)控、運(yùn)行穩(wěn)定性等性能表現(xiàn)優(yōu)秀,檢測(cè)結(jié)果整體符合率達(dá)100%,且極致提升了交付速率,全流程檢測(cè)時(shí)間(樣本預(yù)處理到分析報(bào)告)僅需12個(gè)小時(shí)。
01檢測(cè)方案
核酸提?。?/strong>
瑞因邁拓核酸提取或純化試劑(DNA&RNA)
文庫(kù)制備:
瑞因邁拓DNA&RNA建庫(kù)試劑盒
瑞因邁拓多重PCR建庫(kù)試劑盒
上機(jī)測(cè)序:
DNBSEQ-G99 SE75(SE75讀長(zhǎng)為G99自定義測(cè)序模式)
數(shù)據(jù)分析:
瑞因邁拓感之君??病原微生物測(cè)序數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)
02檢測(cè)流程
宏基因組和靶向擴(kuò)增分別同時(shí)建庫(kù)并共同pooling上機(jī)測(cè)序
03測(cè)試結(jié)果
① 下機(jī)數(shù)據(jù)量:
測(cè)試結(jié)果顯示,G99 的3個(gè)run下機(jī)數(shù)據(jù)量均達(dá)到了80M以上(平均116M),具備良好的產(chǎn)出性能和穩(wěn)定性。
② QC質(zhì)控:
3個(gè)run的Q30值均大于90%,數(shù)據(jù)質(zhì)量?jī)?yōu)秀。
③ 質(zhì)控品的穩(wěn)定性:
陰陽(yáng)性質(zhì)控品在不同批次中均能穩(wěn)定檢出。
④ 重復(fù)性驗(yàn)證:
宏基因組陽(yáng)性質(zhì)控品分析結(jié)果一致性高,靶向下機(jī)數(shù)據(jù)量CV值小于10%,表明G99測(cè)序平臺(tái)重復(fù)性較好,穩(wěn)定性高。
⑤ 結(jié)果準(zhǔn)確性:
G99平臺(tái)宏基因組測(cè)序項(xiàng)目和靶向測(cè)序項(xiàng)目與臨床驗(yàn)證數(shù)據(jù)結(jié)果的陽(yáng)性符合率、陰性符合率均為100%,整體符合率100%。
⑥ 檢測(cè)時(shí)長(zhǎng):
采用G99平臺(tái)檢測(cè),TAT由常規(guī)的18.5小時(shí)縮短到11.5小時(shí),極大的提高了檢測(cè)效率,“速度王者”當(dāng)之無(wú)愧。
基于G99測(cè)序平臺(tái)和瑞因邁拓文庫(kù)構(gòu)建及分析的產(chǎn)品方案,可實(shí)現(xiàn)12小時(shí)內(nèi)極速獲取準(zhǔn)確的檢測(cè)結(jié)果,為高通量測(cè)序技術(shù)在病原微生物領(lǐng)域的應(yīng)用提供更佳的選擇。瑞因邁拓多款產(chǎn)品已上架華大智造智一匯線(xiàn)上信息共享平臺(tái),智一匯作為華大智造DNBSEQ生態(tài)圈的方案展示平臺(tái),致力于豐富基于MGI平臺(tái)的應(yīng)用方案,為合作伙伴和客戶(hù)提供展示及瀏覽咨詢(xún)的渠道。