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結(jié)核分枝桿菌測(cè)序組合產(chǎn)品

基于華大智造自主研發(fā)的試劑、高通量測(cè)序平臺(tái)以及分析軟件,覆蓋從樣本到結(jié)果全流程,組合產(chǎn)品搭配DNBSEQ-G99ARS平臺(tái),12小時(shí)可完成PE150測(cè)序,獨(dú)有的DNBSEQ?測(cè)序技術(shù),為下游分析提供高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù)保障;靶向MTB耐藥和鑒定區(qū)域進(jìn)行快速、精準(zhǔn)的測(cè)序;配套軟件實(shí)現(xiàn)MTBC鑒定和分型,分枝桿菌鑒定,變異檢測(cè),耐藥預(yù)測(cè),進(jìn)化溯源分析,自動(dòng)生成報(bào)告;為MTB的變異監(jiān)測(cè)和耐藥研究提供強(qiáng)有力的工具支撐。


結(jié)核分枝桿菌測(cè)序組合產(chǎn)品

ATOPlex 結(jié)核分枝桿菌擴(kuò)增測(cè)序組合產(chǎn)品

貨號(hào):
900-000608-00,900-000611-00
DNBSEQ-G99ARS,DNBSEQ-G99RS 基因測(cè)序儀
940-001601-00,940-001599-00
ATOPlex MTB 建庫(kù)試劑盒套裝(96 RXN,576 RXN)
940-001654-00
DNBSEQ 一步法DNB制備試劑盒 V4.0(4 RXN)
940-001269-00
DNBSEQ-G99RS 高通量測(cè)序試劑套裝(G99 FCL PE150)
970-000397-00
MTB-Explorer軟件(16人份)
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結(jié)核分枝桿菌 WGS 測(cè)序組合產(chǎn)品

貨號(hào):
900-000070-00
MGISP-100RS 自動(dòng)化樣本制備系統(tǒng)(標(biāo)配)
900-000560-00
DNBSEQ-G99ARS 基因測(cè)序儀(高配)
940-000027-00
MGIEasy Fast酶切DNA文庫(kù)制備試劑套裝(96 RXN)
940-000029-00
MGIEasy Fast酶切DNA文庫(kù)制備試劑套裝(16 RXN)
1000026466
DNBSEQ 一步法 DNB制備試劑盒(OS_DB)(4 RXN)
940-000410-00
DNBSEQ-G99RS 高通量測(cè)序試劑套裝(G99 FCL PE150)
970-000385-00
MTB-Explorer軟件
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推薦方案

ATOPlex 結(jié)核分枝桿菌擴(kuò)增測(cè)序方案
僅需單管內(nèi)2步擴(kuò)增即可實(shí)現(xiàn)靶區(qū)域擴(kuò)增建庫(kù),全流程速度快,支持15種抗結(jié)核藥物耐藥預(yù)測(cè)、174種分枝桿菌鑒定。



結(jié)核分枝桿菌 WGS 測(cè)序方案
可對(duì)結(jié)核分枝桿菌單菌樣本進(jìn)行快速、準(zhǔn)確測(cè)序和基因組組裝、實(shí)現(xiàn)結(jié)核分枝桿菌的基因組組裝、分型鑒定、耐藥預(yù)測(cè)和進(jìn)化溯源分析,為結(jié)核分枝桿菌感染的精準(zhǔn)鑒定、監(jiān)測(cè)預(yù)警、溯源分析和精準(zhǔn)防控提供工具支撐。



產(chǎn)品特點(diǎn)


建庫(kù)操作簡(jiǎn)便
建庫(kù)操作簡(jiǎn)便

基于自主研發(fā)的ATOPlex多重PCR建庫(kù)平臺(tái),僅需單管內(nèi)2步擴(kuò)增即可實(shí)現(xiàn)靶區(qū)域擴(kuò)增建庫(kù)。

全流程速度快
全流程速度快
搭配DNBSEQ-G99ARS測(cè)序儀,從核酸到報(bào)告全流程最快24 h完成;適配DNBSEQ-E25測(cè)序儀,從核酸到報(bào)告全流程最快30 h完成。
樣本無(wú)需培養(yǎng)
樣本無(wú)需培養(yǎng)

靶向測(cè)序的高靈敏度支持痰液、灌洗液等混合樣本;無(wú)需培養(yǎng)。

軟件分析功能全
軟件分析功能全

-覆蓋WHO發(fā)布的《結(jié)核耐藥相關(guān)變異目錄》1所收錄的一、二級(jí)1,200余個(gè)變異位點(diǎn);擴(kuò)增區(qū)域大小達(dá)到25.9 Kb

-涵蓋目錄收錄的15種一線、二線抗結(jié)核藥物耐藥信息;52個(gè)基因或基因片段的變異信息

-支持結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群(MTBC)鑒定,spoligotype分型鑒定;174種分枝桿菌鑒定

-進(jìn)化溯源分析

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性能參數(shù)

產(chǎn)品名稱 ATOPlex 結(jié)核分枝桿菌擴(kuò)增測(cè)序組合產(chǎn)品
結(jié)核分枝桿菌 WGS 測(cè)序組合產(chǎn)品
預(yù)期用途
MTBC鑒定和分型,分枝桿菌鑒定,變異檢測(cè),耐藥預(yù)測(cè),進(jìn)化溯源分析
結(jié)核菌株鑒定,基因組組裝,變異檢測(cè),耐藥信息預(yù)測(cè),進(jìn)化溯源
適用樣本類型
痰液、灌洗液、培養(yǎng)單菌等類型樣本
結(jié)核分枝桿菌單菌
推薦樣本投入量

培養(yǎng)單菌提取DNA≥1 ng;痰液、灌洗液樣本提取1 ng~10 ng

DNA≥10ng
從核酸到報(bào)告的周期
DNBSEQ-G99:24樣本 ~26h;DNBSEQ-E25:8樣本 ~30h
20小時(shí)
推薦測(cè)序讀長(zhǎng)
PE150+10+10
PE150+10+10
推薦測(cè)序數(shù)據(jù)量

3 M Reads/樣本

5M Reads



樣本報(bào)告


軟件功能模塊


軟件包含序列檢測(cè)、突變與耐藥、譜系分型等模塊,對(duì)單次分析的所有樣本生成匯總報(bào)告,同時(shí)為任一樣本提供單樣本報(bào)告,點(diǎn)擊即可打開(kāi)。


耐藥報(bào)告示例


匯總報(bào)告展示所有樣本對(duì)應(yīng)的突變與耐藥信息,分別展示突變數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)結(jié)果,耐藥相關(guān)突變,不確定顯著性突變、耐藥不相關(guān)突變的信息、覆蓋和頻率信息。




匯總變異數(shù)據(jù)




耐藥相關(guān)突變





不確定顯著性突變、耐藥不相關(guān)突變




進(jìn)化溯源和樣本間SNP距離分析


匯總報(bào)告將為所有測(cè)序樣本自動(dòng)構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)(左)和SNP距離分析熱圖(右)。


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