結(jié)核分枝桿菌測(cè)序組合產(chǎn)品

900-000608-00,900-000611-00 |
DNBSEQ-G99ARS,DNBSEQ-G99RS 基因測(cè)序儀 |
940-001601-00,940-001599-00 |
ATOPlex MTB 建庫(kù)試劑盒套裝(96 RXN,576 RXN) |
940-001654-00 |
DNBSEQ 一步法DNB制備試劑盒 V4.0(4 RXN) |
940-001269-00 |
DNBSEQ-G99RS 高通量測(cè)序試劑套裝(G99 FCL PE150) |
970-000397-00 |
MTB-Explorer軟件(16人份) |
900-000070-00 |
MGISP-100RS 自動(dòng)化樣本制備系統(tǒng)(標(biāo)配) |
900-000560-00 |
DNBSEQ-G99ARS 基因測(cè)序儀(高配) |
940-000027-00 |
MGIEasy Fast酶切DNA文庫(kù)制備試劑套裝(96 RXN) |
940-000029-00 |
MGIEasy Fast酶切DNA文庫(kù)制備試劑套裝(16 RXN) |
1000026466 |
DNBSEQ 一步法 DNB制備試劑盒(OS_DB)(4 RXN) |
940-000410-00 |
DNBSEQ-G99RS 高通量測(cè)序試劑套裝(G99 FCL PE150) |
970-000385-00 |
MTB-Explorer軟件 |
ATOPlex 結(jié)核分枝桿菌擴(kuò)增測(cè)序方案
僅需單管內(nèi)2步擴(kuò)增即可實(shí)現(xiàn)靶區(qū)域擴(kuò)增建庫(kù),全流程速度快,支持15種抗結(jié)核藥物耐藥預(yù)測(cè)、174種分枝桿菌鑒定。
結(jié)核分枝桿菌 WGS 測(cè)序方案
可對(duì)結(jié)核分枝桿菌單菌樣本進(jìn)行快速、準(zhǔn)確測(cè)序和基因組組裝、實(shí)現(xiàn)結(jié)核分枝桿菌的基因組組裝、分型鑒定、耐藥預(yù)測(cè)和進(jìn)化溯源分析,為結(jié)核分枝桿菌感染的精準(zhǔn)鑒定、監(jiān)測(cè)預(yù)警、溯源分析和精準(zhǔn)防控提供工具支撐。
產(chǎn)品特點(diǎn)
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建庫(kù)操作簡(jiǎn)便
基于自主研發(fā)的ATOPlex多重PCR建庫(kù)平臺(tái),僅需單管內(nèi)2步擴(kuò)增即可實(shí)現(xiàn)靶區(qū)域擴(kuò)增建庫(kù)。 |
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樣本無(wú)需培養(yǎng)
靶向測(cè)序的高靈敏度支持痰液、灌洗液等混合樣本;無(wú)需培養(yǎng)。 |
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軟件分析功能全
-覆蓋WHO發(fā)布的《結(jié)核耐藥相關(guān)變異目錄》1所收錄的一、二級(jí)1,200余個(gè)變異位點(diǎn);擴(kuò)增區(qū)域大小達(dá)到25.9 Kb -涵蓋目錄收錄的15種一線、二線抗結(jié)核藥物耐藥信息;52個(gè)基因或基因片段的變異信息 -支持結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群(MTBC)鑒定,spoligotype分型鑒定;174種分枝桿菌鑒定 -進(jìn)化溯源分析 |
產(chǎn)品名稱 |
ATOPlex 結(jié)核分枝桿菌擴(kuò)增測(cè)序組合產(chǎn)品 |
結(jié)核分枝桿菌 WGS 測(cè)序組合產(chǎn)品 |
預(yù)期用途 |
MTBC鑒定和分型,分枝桿菌鑒定,變異檢測(cè),耐藥預(yù)測(cè),進(jìn)化溯源分析 |
結(jié)核菌株鑒定,基因組組裝,變異檢測(cè),耐藥信息預(yù)測(cè),進(jìn)化溯源 |
適用樣本類型 |
痰液、灌洗液、培養(yǎng)單菌等類型樣本 |
結(jié)核分枝桿菌單菌 |
推薦樣本投入量 |
培養(yǎng)單菌提取DNA≥1 ng;痰液、灌洗液樣本提取1 ng~10 ng |
DNA≥10ng |
從核酸到報(bào)告的周期 |
DNBSEQ-G99:24樣本 ~26h;DNBSEQ-E25:8樣本 ~30h |
20小時(shí) |
推薦測(cè)序讀長(zhǎng) |
PE150+10+10 |
PE150+10+10 |
推薦測(cè)序數(shù)據(jù)量 |
3 M Reads/樣本 |
5M Reads |
樣本報(bào)告
軟件功能模塊
軟件包含序列檢測(cè)、突變與耐藥、譜系分型等模塊,對(duì)單次分析的所有樣本生成匯總報(bào)告,同時(shí)為任一樣本提供單樣本報(bào)告,點(diǎn)擊即可打開(kāi)。
耐藥報(bào)告示例
匯總報(bào)告展示所有樣本對(duì)應(yīng)的突變與耐藥信息,分別展示突變數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)結(jié)果,耐藥相關(guān)突變,不確定顯著性突變、耐藥不相關(guān)突變的信息、覆蓋和頻率信息。
匯總變異數(shù)據(jù)
耐藥相關(guān)突變
不確定顯著性突變、耐藥不相關(guān)突變
進(jìn)化溯源和樣本間SNP距離分析
匯總報(bào)告將為所有測(cè)序樣本自動(dòng)構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)(左)和SNP距離分析熱圖(右)。