文庫制備是測序實驗流程中非常關鍵的一環(huán)，隨著基因測序的應用持續(xù)深化和廣泛，對高通量、高質量、高度自動化的測序需求與日俱增。傳統(tǒng)的手工操作會花費大量時間，更容易帶來樣本間的誤差及交叉污染的風險問題。針對這些問題，自動化設備的引入可以有效解決其制備流程復雜、操作繁瑣、耗時長、操作專業(yè)度高等一系列問題。

華大智造的自動化樣本制備系統(tǒng)MGISP-960整合了溫控模塊、擴增模塊、振蕩模塊、磁力架模塊等多種功能模塊，具有很高的準確性和可靠性。在批量文庫制備過程中，引入自動化設備和技術，成為越來越多高通量、交付型實驗室的選擇。

近日，華大智造攜手翌圣生物，在高通量測序建庫試劑、國際市場拓展等方向達成戰(zhàn)略合作，并在自動化建庫設備達成聯(lián)合品牌推廣合作共識。雙方將攜手一起為行業(yè)帶來更加高效、高品質的組合產品，全面推動腫瘤、病原、遺傳、科研等領域的發(fā)展。為了提升效率和質量，翌圣生物的RNA建庫試劑盒在MGISP-960進行了自動化建庫適配。

本文將針對翌圣生物的測序文庫構建產品預混版RNA建庫試劑盒Hieff NGS?Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit(Premixed version)在華大智造MGISP-960高通量樣本制備系統(tǒng)上的適配情況做出測評。

測評方案

翌圣生物的預混版RNA建庫試劑盒Hieff NGS? Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit(Premixed version)包含RNA片段化試劑，反轉錄試劑，常規(guī)和鏈特異性ds-cDNA合成試劑以及文庫擴增試劑（表1）；且此試劑盒可銜接mRNA純化試劑盒或rRNA去除試劑盒構建測序文庫。此試劑盒各模塊Buffer和Enzyme已提前預混，簡化試劑準備的同時也減少了自動化設備分裝混勻的步驟，使得全流程自動化程度更高；且所有試劑都經(jīng)過嚴格的質量控制和功能驗證，最大程度地保證了文庫構建的穩(wěn)定性和重復性。

翌圣生物的預混版RNA建庫試劑盒基于華大智造MGISP-960高通量樣本制備系統(tǒng)，每輪實驗（96 samples/run）建庫全流程（含mRNA捕獲）時間由手工建庫的7.5h縮短為自動化建庫的6h，其中5.5h為自動化運行時間，手工操作時間僅為0.5h（圖1）。

圖1 預混版RNA建庫試劑盒基于MGISP-960的自動化建庫全流程（含mRNA捕獲）

測評結果

1. 穩(wěn)定的文庫產出

自動化文庫產出約為手工文庫產出的80%，滿足后續(xù)測序需求；且基于翌圣預混版RNA建庫試劑盒，文庫產出波動控制在10%以內（CV值為8%），相對手工建庫具有更好的穩(wěn)定性（圖2）。

圖2 預混版RNA建庫試劑盒基于MGISP-960的自動化建庫及手工建庫的文庫產出

2. 一致的文庫峰型

自動化文庫峰型一致，且片段大小均符合預設標準（300~400bp）。

圖3 預混版RNA建庫試劑盒基于MGISP-960的自動化文庫峰圖

3. 優(yōu)秀的下機數(shù)據(jù)表現(xiàn)

以翌圣生物的預混版RNA建庫試劑盒構建RNA文庫，起始量1000ng human total RNA，12cycles，采用DNBSEQ-T7測序平臺，PE150測序模式，統(tǒng)一截取1G的下機數(shù)據(jù)進行分析，得到Q30>92%、比對率＞98 %、rRNA比例<1%等優(yōu)秀指標（表2）。

4. 一致的分析結果

文庫的5’及3’端在測序結果中有較高的基因覆蓋度，分別為30%和50%，文庫的基因中間區(qū)域捕獲均勻；且手工文庫和自動化文庫的基因覆蓋度表現(xiàn)高度一致（圖4）。

圖4 預混版RNA建庫試劑盒基于MGISP-960自動化建庫和手工建庫的基因覆蓋度

對14例樣本的測序結果進行聚類分析，顯示同批次的自動化文庫和手工文庫均有較高的關聯(lián)性（圖5）。

圖5 14例樣本的文庫分析結果相關性

測評結論基于MGISP-960高通量樣本制備系統(tǒng)使用翌圣生物的預混版RNA建庫試劑盒Hieff NGS? Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit(Premixed version)，僅用6小時即可完成完整的RNA文庫建庫流程。相比手工建庫，華大智造的MGISP-960高通量樣本制備系統(tǒng)效率更高、數(shù)據(jù)表現(xiàn)穩(wěn)定，可生成高度均一的文庫。同時作為開放、可拓展的建庫設備，華大智造的MGISP系列產品可適配不同類型的第三方試劑，為大規(guī)模檢測的科研應用提供卓越的自動化建庫實驗平臺。

華大智造持續(xù)深耕拓展實驗室自動化業(yè)務，已經(jīng)逐步形成了樣本前處理、核酸提取、移液工作站等全方位、全流程的自動化產品線布局。華大智造一直以來堅持以科技創(chuàng)新為本，積極搭建開放創(chuàng)新的應用生態(tài)建設，助力生命科學行業(yè)逐步實現(xiàn)從硬件、工具到生態(tài)平臺的躍遷。