隨著高通量測序技術(shù)的飛速發(fā)展，更加精準的檢測手段不斷在腫瘤領(lǐng)域拓展應(yīng)用場景，迭代傳統(tǒng)的檢測技術(shù)?；诎殡S診斷行業(yè)的不斷成熟，精準診療的應(yīng)用有所延伸。從早篩到MRD檢測、伴隨診斷，腫瘤精準診斷覆蓋了全周期。突變+甲基化的聯(lián)合檢測或可提高腫瘤檢測效率，也是目前國內(nèi)外在技術(shù)創(chuàng)新上主要探索的方向，而聯(lián)合檢測的結(jié)果判讀還需要更多的底層生物學(xué)研究和核心工具的支撐。

近期，ABclonal推出平末端建庫試劑盒（BK0088)，搭載華大智造G99測序平臺后，測序速度全面提升，而且G99平臺下機數(shù)據(jù)的Q30、 捕獲效率與dup率等優(yōu)異質(zhì)量表現(xiàn)，展現(xiàn)出在ctDNA檢測腫瘤突變（液體活檢）方面的應(yīng)用潛力。G99靈活簡單的特點和優(yōu)異的檢測性能為腫瘤的精準檢測提供工具的支撐并開啟更多可能的應(yīng)用場景。

本次測評中，ABclonal分別在華大智造G99測序平臺及A測序平臺上機測序，并基于現(xiàn)有平臺的生信算法進行分析，結(jié)果表明：兩款測序平臺的數(shù)據(jù)產(chǎn)出質(zhì)量高且突變檢出結(jié)果高度一致。

材料與方法

建庫方案：ABclonal選用ctDNA標準樣品，采用平末端建庫試劑盒（BK0088)和內(nèi)部Panel進行建庫

測序平臺：華大智造G99測序平臺和A測序平臺

測評數(shù)據(jù)

（1）穩(wěn)定優(yōu)異的連接效率和優(yōu)異的文庫產(chǎn)量   

圖1 接頭連接效率（灰色 BK0088, 黑色 Competitor2） 圖2 ctDNA建庫產(chǎn)量

圖1中，毛細電泳檢測單一片段進行接頭連接效率，分別投入5ng（ 1% VAF），10ng （0.2% VAF），40ng （ 0.1% VAF）樣品，ABclonal SWP技術(shù)(BK0088試劑盒）在不同DNA起始量的連接效率均達到80%以上，在低起始量投入下，SWP技術(shù)會高于傳統(tǒng)TA連接建庫技術(shù)的連接效率。

圖2中，測試5ng（ 1% VAF），10ng （0.2% VAF），40ng （ 0.1% VAF）樣品，等比混合進行雜交捕獲，分別在G99測序平臺和A測序平臺上進行測序，測序下機后進行相關(guān)數(shù)據(jù)分析；不同投入量ctDNA樣品，在相同的循環(huán)數(shù)和條件下，BK0088 SWP試劑的產(chǎn)量優(yōu)異

（來源：ABclonal整理， Competitor和Competitor2分別表示SWP技術(shù)同類型試劑盒和傳統(tǒng)TA連接試劑盒）

（2）測序數(shù)據(jù)產(chǎn)出質(zhì)量好，平臺間一致性高

從G99和A平臺的下機數(shù)據(jù)來看，Q30值都比較高，這表明數(shù)據(jù)產(chǎn)出質(zhì)量高；平均測序深度，mapping比例，捕獲效率表現(xiàn)一致性好。圖3 A平臺測試數(shù)據(jù)

圖4 G99平臺測試數(shù)據(jù)

圖5 G99與A平臺測試數(shù)據(jù)

（來源：ABclonal整理， Competitor和Competitor2分別為SWP技術(shù)同類型試劑盒和傳統(tǒng)TA連接試劑盒）

測試總結(jié)

BK0088建庫試劑盒搭載華大智造G99雙端測序平臺后，測序速度提升明顯；而且， G99平臺下機數(shù)據(jù)Q30, 捕獲效率與dup率等表現(xiàn)優(yōu)異，在ctDNA檢測腫瘤突變（液體活檢）上展示出較好的應(yīng)用前景。