MGISP-100自動化樣本制備系統(tǒng)專注于高通量測序領(lǐng)域的文庫構(gòu)建,實(shí)現(xiàn)建庫功能一體化,目前已支持40余種華大智造及第三方建庫試劑盒的自動化操作。其中,基于MGISP-100自動化樣本制備系統(tǒng),MGIEasy 通用文庫轉(zhuǎn)換試劑盒 (App-A)只需通過文庫接頭轉(zhuǎn)換和測序引物替換兩個(gè)步驟,即可實(shí)現(xiàn)將第三方建庫試劑盒構(gòu)建的線性dsDNA 文庫轉(zhuǎn)換成兼容華大智造測序平臺的單鏈環(huán)狀DNA文庫。再搭配Make DNB自動化流程,從而得到可直接在DNBSEQ平臺上測序的DNA納米球。
DNBSEQ平臺獨(dú)特的滾環(huán)擴(kuò)增(RCA)技術(shù),相比PCR指數(shù)擴(kuò)增,有效避免了擴(kuò)增錯(cuò)誤指數(shù)級累積的問題,同時(shí)具備低標(biāo)簽跳躍、低擴(kuò)增偏好性等優(yōu)勢。制備DNBSEQ平臺獨(dú)特的環(huán)狀文庫需要經(jīng)過酶切打斷、末端修復(fù)、接頭連接、產(chǎn)物純化、PCR擴(kuò)增、環(huán)化消化等多個(gè)步驟。在華大智造MGISP自動化平臺制備DNBSEQ文庫,相比手工操作,大幅度縮短實(shí)驗(yàn)時(shí)間,提高文庫制備穩(wěn)定性。
華大智造App-A+Make DNB在MGISP-100上運(yùn)行的自動化腳本已經(jīng)經(jīng)過嚴(yán)格和重復(fù)的測試,最大程度上保證了自動化建庫的穩(wěn)定性和重復(fù)性,同時(shí)實(shí)現(xiàn)了非DNBSEQ平臺文庫與DNBSEQ測序平臺的兼容。
操作步驟
在MGISP-100上進(jìn)行自動化文庫轉(zhuǎn)換,主要經(jīng)過PCR文庫制備-自動化Pooling-環(huán)化消化-Make DNB四個(gè)自動化操作步驟,一次最多可支持16個(gè)樣本,全程高度自動化,運(yùn)行僅需4.5-5小時(shí)左右。在此期間,實(shí)驗(yàn)人員只需做一些簡單的質(zhì)控和看護(hù)工作,大概耗時(shí)0.5小時(shí)。若全程手工操作,處理單個(gè)或多個(gè)樣本需要的人工時(shí)間在2小時(shí)以上。
基于MGISP-100的文庫轉(zhuǎn)換(APP-A)+DNB制備自動化操作流程
MGISP-100:APP-A+Make DNB自動化流程操作臺面
結(jié)果展示
結(jié)果顯示,MGISP-100自動化樣本制備系統(tǒng)在AC-PCR產(chǎn)物及產(chǎn)出文庫總量方面,與手工表現(xiàn)一致甚至更好。MGISP-100搭配APP系列產(chǎn)品快速、有效地實(shí)現(xiàn)批量線性文庫自動化無損轉(zhuǎn)為DNBSEQ平臺通用文庫,并可在DNBSEQ平臺進(jìn)行高通量測序,為線性文庫用戶提供更多測序選擇,大大提高了測序平臺的適配性和兼容性,同時(shí)驗(yàn)證了MGISP系列建庫儀的通用性與穩(wěn)定性。