國務院聯(lián)防聯(lián)控機制指出,今年10月以來,我國流感、肺炎支原體感染活動逐步增強,預計流感將出現(xiàn)全國冬春季流行高峰,肺炎支原體感染未來一段時間在部分地區(qū)仍將持續(xù)高發(fā)。各地要統(tǒng)籌做好新冠、流感和諾如病毒胃腸炎等重點傳染病監(jiān)測,密切跟蹤疫情形勢變化。
近日,廣州醫(yī)科大學附屬市八醫(yī)院傳染病研究所基于華大智造呼吸道微生物基因組測序產(chǎn)品組合,對樣本進行精準的流感病毒亞型識別,獲得了完整的流感病毒基因組序列,成功對流感病毒進行測序和溯源。
此次流感溯源研究采用MGIEasy呼吸道微生物基因組建庫試劑盒套裝對40例流感陽性樣本進行文庫構(gòu)建,在MGISEQ-2000上進行測序,搭配華大智造自主研發(fā)的FluTrack軟件進行數(shù)據(jù)處理,對樣本全基因組的8個片段進行比對。結(jié)果表明,40例樣本中,36例樣本(占比90%)的流感基因片段比對率超過95%,表現(xiàn)出優(yōu)異的基因組測序覆蓋度。
作為較易發(fā)生突變、而且傳染性較強的高發(fā)病率病毒,流感病毒不僅難以辨別于普通感冒,還會與新型冠狀病毒的交叉流行帶來疊加效應負擔。利用高通量測序技術(shù)對流感病毒變異進行追蹤,對新型流感病毒做出預警,對流感流行趨勢進行監(jiān)測非常重要。
采用華大智造推出的呼吸道微生物基因組測序產(chǎn)品組合,能夠?qū)颖具M行精準的流感病毒亞型識別,獲得完整的流感病毒基因組序列,有助于疾控部門或科研機構(gòu)對流感病毒的追蹤和溯源等工作的高效開展和快速推動。
圖1:華大智造呼吸道微生物基因組測序產(chǎn)品組合
其中,MGIEasy呼吸道微生物基因組建庫試劑盒套裝是華大智造采用ATOPlex多重PCR技術(shù)開發(fā)而成,能夠?qū)仔土鞲泻鸵倚土鞲胁《救蚪M進行高效地擴增和文庫制備;搭配華大智造DNBSEQ測序平臺完成測序,并使用MGI FluTrack基礎(chǔ)分析系統(tǒng),可實現(xiàn)對流感病毒的分型、基因組組裝和溯源研究。
圖2:華大智造呼吸道微生物基因組測序產(chǎn)品組合提供多種通量方案
華大智造呼吸道微生物基因組測序產(chǎn)品組合,自動化程度高,數(shù)據(jù)質(zhì)量優(yōu)異,軟件功能強大,能夠為流感的變異監(jiān)測和流行病學調(diào)查提供強大的工具支撐。
未來,秉承“創(chuàng)新智造引領(lǐng)生命科技”的理念,在公共衛(wèi)生應用領(lǐng)域,華大智造將持續(xù)致力于滿足病原微生物全基因組測序、靶向測序和宏基因組測序全流程等應用場景的需求,為公共衛(wèi)生事件的監(jiān)測和預警提供更自動、更便捷、更高效的國產(chǎn)化核心工具。