DNBSEQ-G99自上市以來,憑借著測序速度快、雙載臺靈活上機(jī)及操作簡單等優(yōu)勢,成為了病原微生物領(lǐng)域“新秀”,無論是病原宏基因組測序(mNGS)還是靶向測序(tNGS),亦或是二者的聯(lián)合應(yīng)用(mNGS+tNGS),G99都是“量身定制”的機(jī)型選擇。隨著2023年獲批國家藥品監(jiān)督管理局(NMPA)醫(yī)療器械注冊證,G99全方位解鎖臨床應(yīng)用領(lǐng)域。
為了更好地滿足臨床檢測需求,瑞因邁拓采用基于DNBSEQ平臺的自研、自產(chǎn)試劑盒,在G99上進(jìn)行了病原宏基因組測序和靶向測序聯(lián)合方案的性能測試。結(jié)果顯示,G99測序平臺的下機(jī)數(shù)據(jù)量、數(shù)據(jù)質(zhì)控、運(yùn)行穩(wěn)定性等性能表現(xiàn)優(yōu)秀,檢測結(jié)果整體符合率達(dá)100%,且極致提升了交付速率,全流程檢測時間(樣本預(yù)處理到分析報告)僅需12個小時。
01檢測方案
核酸提?。?/strong>
瑞因邁拓核酸提取或純化試劑(DNA&RNA)
文庫制備:
瑞因邁拓DNA&RNA建庫試劑盒
瑞因邁拓多重PCR建庫試劑盒
上機(jī)測序:
DNBSEQ-G99 SE75(SE75讀長為G99自定義測序模式)
數(shù)據(jù)分析:
瑞因邁拓感之君??病原微生物測序數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)
02檢測流程
宏基因組和靶向擴(kuò)增分別同時建庫并共同pooling上機(jī)測序
03測試結(jié)果
① 下機(jī)數(shù)據(jù)量:
測試結(jié)果顯示,G99 的3個run下機(jī)數(shù)據(jù)量均達(dá)到了80M以上(平均116M),具備良好的產(chǎn)出性能和穩(wěn)定性。
② QC質(zhì)控:
3個run的Q30值均大于90%,數(shù)據(jù)質(zhì)量優(yōu)秀。
③ 質(zhì)控品的穩(wěn)定性:
陰陽性質(zhì)控品在不同批次中均能穩(wěn)定檢出。
④ 重復(fù)性驗(yàn)證:
宏基因組陽性質(zhì)控品分析結(jié)果一致性高,靶向下機(jī)數(shù)據(jù)量CV值小于10%,表明G99測序平臺重復(fù)性較好,穩(wěn)定性高。
⑤ 結(jié)果準(zhǔn)確性:
G99平臺宏基因組測序項目和靶向測序項目與臨床驗(yàn)證數(shù)據(jù)結(jié)果的陽性符合率、陰性符合率均為100%,整體符合率100%。
⑥ 檢測時長:
采用G99平臺檢測,TAT由常規(guī)的18.5小時縮短到11.5小時,極大的提高了檢測效率,“速度王者”當(dāng)之無愧。
基于G99測序平臺和瑞因邁拓文庫構(gòu)建及分析的產(chǎn)品方案,可實(shí)現(xiàn)12小時內(nèi)極速獲取準(zhǔn)確的檢測結(jié)果,為高通量測序技術(shù)在病原微生物領(lǐng)域的應(yīng)用提供更佳的選擇。瑞因邁拓多款產(chǎn)品已上架華大智造智一匯線上信息共享平臺,智一匯作為華大智造DNBSEQ生態(tài)圈的方案展示平臺,致力于豐富基于MGI平臺的應(yīng)用方案,為合作伙伴和客戶提供展示及瀏覽咨詢的渠道。