《你問我答》欄目搜集了華大智造客戶的常問問題,并為大家整理出了不同產(chǎn)品的FAQ,后續(xù)將陸續(xù)發(fā)布,幫助您更好地使用我們的產(chǎn)品。
文章導(dǎo)覽:
Q1:DNBelab-D4 的功能包括什么?
Q2:DNBelab-D4 的通量是多少?
Q3:DNBelab-D4 的運(yùn)行時(shí)長有多久?
Q4:DNBelab-D4 是否含有定量功能?
Q5:DNBelab-D4 手工如何操作?
Q6:DNBelab-D4 如何防止氣溶膠和交叉污染?
Q1:DNBelab-D4 的功能包括什么?
DNBelab-D4 可完成酶切打斷、接頭連接、PCR、磁珠純化、片段篩選、核酸定量、DNB制備等建庫步驟。用戶在 DNBelab-D4 上投入核酸(DNA和/或RNA),中間所有建庫步驟全自動完成后,隨后取出建庫產(chǎn)物(雙鏈DNA文庫或DNB),同時(shí) DNBelab-D4 給出建庫產(chǎn)物濃度和建議投入量。
Q2:DNBelab-D4 的通量是多少?
DNBelab-D4 一次運(yùn)行1張樣本制備卡,1張樣本制備卡有4個通道,通常支持至多4個樣本/運(yùn)行的建庫流程。
Q3:DNBelab-D4 的運(yùn)行時(shí)長有多久?
在完成手工加封閉液、建庫試劑和樣本(預(yù)計(jì)耗時(shí)15分鐘內(nèi))并將樣本制備卡放入DNBelab-D4(以下簡稱為D4) 后,D4開始自動運(yùn)行建庫流程。
D4的運(yùn)行時(shí)長視建庫方案有所不同,以DNBelab-D4RS 酶切DNA文庫制備試劑套裝V2.0(940-001198-00)為例,該試劑套裝的建庫方案為包含PCR的通用建庫流程(包含酶切打斷、末端修復(fù)、加A尾、磁珠純化、接頭連接、磁珠純化、PCR、磁珠純化、DNB制備,DNB定量),可應(yīng)用于簡單基因組組裝、mNGS等應(yīng)用,D4運(yùn)行時(shí)長為3小時(shí)20分鐘(包含內(nèi)置自動定量)。
通常,針對相同的建庫方案,D4的運(yùn)行時(shí)長不會長于手工建庫時(shí)長。
Q4:DNBelab-D4 是否含有定量功能?
DNBelab-D4 內(nèi)置定量模塊,采用熒光染料,可全自動地完成雙鏈DNA文庫定量或DNB定量,在結(jié)果頁面給出核酸濃度的結(jié)果。
Q5:DNBelab-D4 手工如何操作?
采用 DNBelab-D4(以下簡稱為D4)的標(biāo)準(zhǔn)建庫試劑盒,用戶需在樣本制備卡上手工加封閉液、建庫試劑和樣本,預(yù)計(jì)耗時(shí)在15分鐘內(nèi)。隨后將樣本制備卡放入D4,后續(xù)所有建庫步驟均由D4自動完成,在D4結(jié)果頁面顯示各通道的建庫產(chǎn)物定量結(jié)果。將樣本制備卡從儀器中取出,用戶需手工將建庫產(chǎn)物從樣本制備卡中取出并去除封閉液。隨后可根據(jù)測序要求進(jìn)行文庫混合。
Q6:DNBelab-D4 如何防止氣溶膠和交叉污染?
DNBelab-D4 采用獨(dú)特的全封閉體系,在建庫過程中所有液滴始終被封閉液包裹,包括實(shí)驗(yàn)過程中產(chǎn)生的所有廢液也被封閉液包裹并保留在樣本制備卡上,與外界空氣完全隔離,相當(dāng)于全流程“無開蓋”。各反應(yīng)體系之間相互獨(dú)立,從而完全避免了氣溶膠產(chǎn)生,杜絕外源污染和樣本交叉串?dāng)_。目前已在 mNGS、tNGS、腫瘤小panel 等測序應(yīng)用進(jìn)行交叉污染驗(yàn)證,結(jié)果均表明 DNBelab-D4 在建庫流程可實(shí)現(xiàn)“零污染建庫”。
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