近日,上海序禎達生物科技有限公司(以下簡稱:序禎達生物)實驗室在華大智造DNBSEQ-T7平臺上完成了Olink Explore HT產(chǎn)品的適配驗證,實驗及測序后的數(shù)據(jù)經(jīng)過Olink Proteomics(以下簡稱:Olink)官方驗證,得到了100%樣本通過QC的好成績,標志著Olink蛋白組學與DNBSEQ平臺兼容取得了新進展,也意味著DNBSEQ-T7平臺成功拓展蛋白組學應(yīng)用。通過序禎達生物、Olink、華大智造三方的合作,為終端用戶帶來了更多的選擇和更好的使用體驗。
圖1. Olink Explore HT檢測實驗流程圖(測序平臺:DNBSEQ-T7)
驗證內(nèi)容
本次驗證采用了66例健康男性及66例健康女性的血漿樣本,通過Explore HT標準實驗流程進行了實驗并完成了文庫構(gòu)建,使用MGIEasy Olink文庫環(huán)化套裝將文庫環(huán)化后上機DNBSEQ-T7平臺進行測序(測序策略:SE66,測序時間約5小時),同時在其原有測序平臺上機測序,通過比較NPX值的分布情況對不同平臺的產(chǎn)出效果進行對比,結(jié)果如下:
圖2. 不同測序平臺NPX值分布的對比
Olink Explore HT文庫在DNBSEQ-T7與原有平臺的NPX值分析對比結(jié)果顯示兩個平臺的結(jié)果具有極高的一致性。
此外,驗證還選擇了12例已知的在性別間顯著差異表達的蛋白來驗證DNBSEQ-T7平臺產(chǎn)出的結(jié)果。其中包括了一些在生殖發(fā)育中承擔重要作用的蛋白, 如INSL3、EDDM3B 和 TEX101。結(jié)果發(fā)現(xiàn)這12種蛋白的濃度在男女樣本的濃度均與經(jīng)驗結(jié)果一致,同時在DNBSEQ-T7及原有平臺上檢測這些蛋白時獲得了高度一致的結(jié)果(如下圖)。
圖3. 部分男女間差異蛋白在DNBSEQ-T7的NPX值以及不同平臺的檢測結(jié)果比較
關(guān)于三方合作的序禎達生物Olink蛋白組學平臺
從2021年序禎達生物與Olink建立合作伙伴關(guān)系,并成為Olink在中國的首批合作實驗室之一,序禎達生物開始采用Olink專有的鄰位延伸分析技術(shù)(Proximity Extension Assay, PEA),賦能端對端的多組學臨床研究,以加速中國精準醫(yī)學發(fā)展進程。2023年,序禎達生物與華大智造簽署了戰(zhàn)略合作協(xié)議,拓展了原有測序模式的可及性。
序禎達生物也是國內(nèi)首家可提供Olink Explore、Target、Flex及Focus全系列產(chǎn)品的服務(wù)商,是國內(nèi)首家通過Olink Target 48/96和Olink Explore質(zhì)控標準的一致性驗證的服務(wù)商,一直以來致力于提供滿足國際標準的高質(zhì)量的檢測數(shù)據(jù)和服務(wù)。在Olink項目經(jīng)驗方面,已成功滿足超過23種樣本的檢測服務(wù),Olink Explore平臺檢測樣本數(shù)也已達數(shù)萬例,無論是檢測經(jīng)驗還是交付質(zhì)量,均處于國內(nèi)領(lǐng)先地位。
序禎達生物創(chuàng)始人兼首席執(zhí)行官孫樂樂博士表示:“序禎達生物是一家專業(yè)提供測序技術(shù)服務(wù)和多組學研究解決方案的服務(wù)型平臺企業(yè),多年來一直追求卓越的質(zhì)量控制標準,擁有多臺高通量測序儀,在測序服務(wù)方面一直走在行業(yè)前列。序禎達生物也是Olink國內(nèi)首家服務(wù)商,2022年成為首家通過Olink Target 48/96和Olink Explore一致性驗證的中國服務(wù)商,今年年初,又率先通過了Olink Explore HT檢測的國內(nèi)外實驗室一致性驗證評估且獲得了國內(nèi)首家官方認證,是Olink國內(nèi)的具備國際質(zhì)量的服務(wù)商。很榮幸在序禎達生物的平臺可以見證Olink Explore數(shù)據(jù)能在華大智造的DNBSEQ-T7上產(chǎn)出且通過官方的QC認證,未來,多組學、測序?qū)⒂懈嗟目赡苄裕屛覀児餐诖??!?/span>
華大智造副總裁、中國區(qū)總經(jīng)理彭歡歡表示:“此前,我們對DNBSEQ-T7的性能進行了全面升級,通量更高、速度更快、數(shù)據(jù)質(zhì)量更佳,全方位賦能多組學研究發(fā)展。此次適配,將助力序禎達生物為其客戶提供更優(yōu)質(zhì)、更高效、更專業(yè)的技術(shù)檢測服務(wù),為蛋白組技術(shù)及應(yīng)用的發(fā)展注入強大動力?!?/span>