在植物生物學(xué)的領(lǐng)域中,細(xì)胞間的異質(zhì)性研究已成為解鎖植物生長發(fā)育復(fù)雜機(jī)制的關(guān)鍵鑰匙。華大智造DNBelab C系列單細(xì)胞一站式平臺包含從樣本保存、樣本制備、文庫制備、上機(jī)測序到數(shù)據(jù)分析的全流程工具,在多個熱門研究領(lǐng)域具有廣泛的應(yīng)用,尤其在植物領(lǐng)域取得了顯著成果。開泰生物擁有成熟和穩(wěn)定的原生質(zhì)體制備方案,搭配DNBelab C-TaiM 4單細(xì)胞液滴生成儀和DNBSEQ-T7超高通量測序平臺,為水稻莖部組織的單細(xì)胞研究提供了高效、精準(zhǔn)、全面的解決方案。
華大智造DNBelab C系列單細(xì)胞一站式平臺
01材料與方法
02實驗流程
開泰生物植物單細(xì)胞的實測數(shù)據(jù)展示
1.高數(shù)據(jù)產(chǎn)出:
在DNBelab C-TaiM 4的精準(zhǔn)單細(xì)胞捕捉與DNBSEQ-T7的高通量測序平臺雙重賦能下,對兩個水稻樣本提原生質(zhì)體進(jìn)行單細(xì)胞實驗,從質(zhì)控數(shù)據(jù)結(jié)果顯示:兩個樣本生物學(xué)重復(fù)較好,并展現(xiàn)出了極高的產(chǎn)出量和良好的質(zhì)量,細(xì)胞捕獲數(shù)均在8,000左右,基因檢出數(shù)都在1,900左右,充分驗證了該實驗方案的穩(wěn)定性和可靠性。
2.細(xì)胞分群和鑒定:
細(xì)胞聚類分群后,通過已發(fā)表文章查找Marker基因、搜索水稻數(shù)據(jù)庫,注釋鑒定出9種細(xì)胞群,完成了水稻莖單細(xì)胞圖譜構(gòu)建,細(xì)胞類型詳見UMAP圖。
測評總結(jié)
在開泰生物基于DNBelab C-TaiM 4平臺進(jìn)行的植物水稻莖部組織的單細(xì)胞檢測的研究中,無論從水稻莖部組織原生質(zhì)體的質(zhì)量、單細(xì)胞測序?qū)嶒灲Y(jié)果數(shù)據(jù)的穩(wěn)定性和可重復(fù)性、還是基因的檢出數(shù)方面均表現(xiàn)優(yōu)異。作為支持該研究的核心技術(shù)平臺,DNBelab C系列產(chǎn)品以其強(qiáng)大的兼容性和高效性為科研工作者提供穩(wěn)定和可靠的數(shù)據(jù)產(chǎn)出,極大地提升了科研工作的效率和準(zhǔn)確性。
開泰生物作為華大智造DNBelab C系列高通量單細(xì)胞RNA文庫制備認(rèn)證服務(wù)商,長期專注于高通量單細(xì)胞多組學(xué)的技術(shù)研發(fā)與服務(wù),在植物單細(xì)胞的研究中具有豐富經(jīng)驗,尤其是植物原生質(zhì)體制備。目前成功解離了近千例植物組織樣本,建立20+植物、30+組織部位的原生質(zhì)體制備體系。