文庫(kù)制備是測(cè)序?qū)嶒?yàn)流程中非常關(guān)鍵的一環(huán)。在高通量測(cè)序技術(shù)飛速發(fā)展的今天，無(wú)論是臨床應(yīng)用還是科研領(lǐng)域都強(qiáng)烈呼喚自動(dòng)化平臺(tái)技術(shù)能夠?yàn)楦咄繙y(cè)序提供更多助益。10月10日，我們特別邀請(qǐng)到上海瑞金醫(yī)院轉(zhuǎn)化中心分子病理平臺(tái)的副主任技師朱勇梅老師，以及深圳華大生命科學(xué)研究院的生物信息副研究員梅俊譜老師，在華大智造舉辦的用戶(hù)分享會(huì)（建庫(kù)儀專(zhuān)場(chǎng)）中，共同探討了自動(dòng)化建庫(kù)在分子病理檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室和前沿科學(xué)研究實(shí)驗(yàn)室中的應(yīng)用及展望。

MGISP-100

讓分子病理檢測(cè)走向更廣闊的天地

“MGISP-100具有醫(yī)療器械注冊(cè)證，能夠滿(mǎn)足臨床應(yīng)用的資質(zhì)要求。我們引入MGISP-100后，只需要把樣本試劑放上機(jī)器、調(diào)試好參數(shù)后即可進(jìn)行自動(dòng)化建庫(kù)全流程。我們明顯體會(huì)到了一個(gè)非常輕松便捷的檢測(cè)流程。基于自動(dòng)化移液技術(shù)的樣本制備系統(tǒng)，能夠自動(dòng)完成建庫(kù)全流程，并且結(jié)果穩(wěn)定均一，同時(shí)可以有效進(jìn)行污染防控?！?/span>

——上海瑞金醫(yī)院轉(zhuǎn)化中心分子病理平臺(tái)，朱勇梅

上海瑞金醫(yī)院轉(zhuǎn)化中心分子病理平臺(tái)主要承擔(dān)血液惡性腫瘤相關(guān)的分子檢測(cè)，檢測(cè)能力接軌國(guó)際。近年來(lái)，高通量測(cè)序技術(shù)在血液惡性腫瘤中具有廣泛應(yīng)用，能夠有效篩選出高危白血病患者，使得高?；颊邫z出率提高至8%，患者可以盡早進(jìn)行干細(xì)胞移植術(shù)以改善預(yù)后。應(yīng)用高通量測(cè)序技術(shù)可以監(jiān)測(cè)腫瘤克隆演進(jìn)、開(kāi)展分子靶向藥物臨床試驗(yàn)，提高分子檢測(cè)工作效率。

然而，高通量測(cè)序的臨床需求非常多，每年大概有30%至50%的樣本增長(zhǎng)量。并且高通量測(cè)序建庫(kù)步驟繁復(fù)，檢測(cè)人員手工操作會(huì)花費(fèi)大量時(shí)間。同時(shí)，手工建庫(kù)對(duì)每個(gè)樣本進(jìn)行單獨(dú)操作，更容易帶來(lái)樣本間的誤差問(wèn)題，以及存在交叉污染的風(fēng)險(xiǎn)問(wèn)題。針對(duì)這些問(wèn)題，自動(dòng)化建庫(kù)儀的引入，為我們提供了一個(gè)行之有效的解題思路。

通過(guò)整合測(cè)序?qū)嶒?yàn)在樣本前處理過(guò)程中的酶反應(yīng)、磁珠純化、PCR反應(yīng)等建庫(kù)步驟，華大智造MGISP-100支持全流程的高度自動(dòng)化操作，中途無(wú)需人工介入，省時(shí)省力，能夠做到微量移液以及精準(zhǔn)的溫度控制：在選擇需要運(yùn)行的流程后，機(jī)器自動(dòng)工作3.5小時(shí)后，即可完成自動(dòng)化建庫(kù)。朱勇梅表示，“MGISP-100自動(dòng)化建庫(kù)和手工建庫(kù)的產(chǎn)量都是可比的，同時(shí)對(duì)于不同基因位點(diǎn)的突變檢測(cè)結(jié)果也是相當(dāng)穩(wěn)定的。”

此外，MGISP-100還可以根據(jù)應(yīng)用需要，按照實(shí)驗(yàn)條件調(diào)整設(shè)備腳本，例如根據(jù)插入片段、選擇連接后篩選條件，根據(jù)環(huán)境溫度、調(diào)整氣干時(shí)間，根據(jù)投入量、選擇對(duì)應(yīng)的PCR循環(huán)數(shù)等，不僅可以用于DNA文庫(kù)構(gòu)建，還可以用于RNA轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)構(gòu)建，能夠靈活滿(mǎn)足臨床應(yīng)用的多元化需求。

MGISP-100/960

解放科學(xué)研究的“生產(chǎn)力”

“時(shí)空組學(xué)相關(guān)成果需要海量測(cè)序數(shù)據(jù)的支持。一個(gè)成人有2*1013個(gè)細(xì)胞，相應(yīng)會(huì)產(chǎn)生大量組織和樣本的處理需求，高通量測(cè)序以及自動(dòng)化的建庫(kù)處理對(duì)前沿科研具有十分重要的意義?！?/strong>