基因測(cè)序儀業(yè)務(wù) SEQ ALL
核心技術(shù)
熱門應(yīng)用
組學(xué)研究
文檔下載
已發(fā)表文章
用戶成功案例
在線數(shù)據(jù)集
多功能中心
客戶中心
在線支持
關(guān)于智造
專題推薦
版權(quán)所有?2025 深圳華大智造科技股份有限公司 隱私政策法律聲明
互聯(lián)網(wǎng)藥品信息服務(wù)資格證書[(粵)-非經(jīng)營(yíng)性-2024-0050] 粵ICP備16117185號(hào)粵公網(wǎng)安備號(hào) 44030802000485
生信分析加速器
產(chǎn)品概述
MegaBOLT生信分析加速器系列產(chǎn)品(包括MegaBOLT、ZBOLT、ZBOLT Pro)，是華大智造自研專注于高通量測(cè)序領(lǐng)域的生物信息分析硬件加速系統(tǒng)。
支持胚系突變(Germline)與體細(xì)胞突變(Somatic)的全基因組(WGS)、全外顯子組(WES)、Panel靶向測(cè)序數(shù)據(jù)，較經(jīng)典算法提速百倍。
產(chǎn)品集成ZMART生信應(yīng)用市場(chǎng)，支持超過(guò)百款增值應(yīng)用，可靈活配置更多拓展功能應(yīng)用。MegaBOLT快速、集成、易用、經(jīng)濟(jì)，可大幅降低計(jì)算費(fèi)用，省時(shí)省心，助力您的業(yè)務(wù)高效開展。
支持胚系突變(Germline)與體細(xì)胞突變(Somatic)的全基因組(WGS)、全外顯子組(WES)、Panel靶向測(cè)序數(shù)據(jù)，較經(jīng)典算法提速百倍。
產(chǎn)品集成ZMART生信應(yīng)用市場(chǎng)，支持超過(guò)百款增值應(yīng)用，可靈活配置更多拓展功能應(yīng)用。MegaBOLT快速、集成、易用、經(jīng)濟(jì)，可大幅降低計(jì)算費(fèi)用，省時(shí)省心，助力您的業(yè)務(wù)高效開展。
產(chǎn)品主要有桌面工作站及機(jī)架式服務(wù)器兩種，適應(yīng)各種規(guī)模場(chǎng)地的多種場(chǎng)景需求
-
實(shí)驗(yàn)室 -
醫(yī)院 -
研究院所 -
公司企業(yè)
快速
MegaBOLT基于基于SOAPnuke、Minimap2、BWA、GATK HaplotypeCaller + Mutect2等算法，結(jié)合多流水線及高度并行技術(shù)，實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)處理大幅提速。
| 計(jì)算時(shí)間比較 | 經(jīng)典算法 | MegaBOLT | ||
| ZBOLT | ZBOLT Pro | |||
| 胚系WGS 30X Basic | 26.26h | 0.69h | 0.24h | 0.11h |
| 胚系WGS 30X Full | 27.20h | 0.80h | 0.27h | 0.12h |
| 胚系WES 100X Basic | 4.27h | 0.10h | 0.04h | 0.02h |
| 胚系WES 100X Full | 4.37h | 0.13h | 0.04h | 0.02h |
|
體細(xì)胞WGS 40X Tumor + 40X Normal |
46.44h | 3.66h | 1.47h | 0.42h |
|
體細(xì)胞WES 400X Tumer + 400X Normal |
7.64h | 0.36h | 0.14h | 0.06h |
* Basic: 包含從質(zhì)控后的干凈數(shù)據(jù)至變異結(jié)果步驟，取多個(gè)任務(wù)平均時(shí)間
* Full: 包含從原始數(shù)據(jù)至變異結(jié)果及額外的數(shù)據(jù)質(zhì)控、結(jié)果報(bào)告等步驟，取多個(gè)任務(wù)平均時(shí)間包含從原始數(shù)據(jù)至變異結(jié)果及額外的數(shù)據(jù)質(zhì)控、結(jié)果報(bào)告等步驟，取多個(gè)任務(wù)平均時(shí)間
* MegaBOLT按同時(shí)投遞6個(gè)相同任務(wù)，ZBOLT按同時(shí)投遞12個(gè)相同任務(wù)，ZBOLT Pro按同時(shí)投遞32個(gè)相同任務(wù)，求平均運(yùn)行時(shí)間計(jì)算
* Full: 包含從原始數(shù)據(jù)至變異結(jié)果及額外的數(shù)據(jù)質(zhì)控、結(jié)果報(bào)告等步驟，取多個(gè)任務(wù)平均時(shí)間包含從原始數(shù)據(jù)至變異結(jié)果及額外的數(shù)據(jù)質(zhì)控、結(jié)果報(bào)告等步驟，取多個(gè)任務(wù)平均時(shí)間
* MegaBOLT按同時(shí)投遞6個(gè)相同任務(wù)，ZBOLT按同時(shí)投遞12個(gè)相同任務(wù)，ZBOLT Pro按同時(shí)投遞32個(gè)相同任務(wù)，求平均運(yùn)行時(shí)間計(jì)算
多任務(wù)調(diào)度系統(tǒng)加速
MegaBOLT結(jié)合自主研發(fā)的多任務(wù)調(diào)度系統(tǒng)，可實(shí)現(xiàn)單機(jī)多任務(wù)并發(fā)計(jì)算，計(jì)算性能再進(jìn)一步提升38%~52%。當(dāng)僅有單個(gè)任務(wù)需要分析時(shí)，可使用單任務(wù)極速模式，提升性能13%~30%。
Germline
-
WGS 30X NA12878 DNBSEQ
-
WES 100X NA12878 DNBSEQ
* 按同時(shí)投遞6個(gè)相同任務(wù)，求平均運(yùn)行時(shí)間計(jì)算
精度
01、精度表現(xiàn)
經(jīng)加速后的分析精度表現(xiàn)依舊堅(jiān)挺。MegaBOLT另有深度學(xué)習(xí)變異檢測(cè)模塊MegaBOLT-DV，經(jīng)過(guò)算法優(yōu)化及測(cè)序平臺(tái)針對(duì)性神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型訓(xùn)練，結(jié)合PCR-Free文庫(kù)制備技術(shù)及華大智造DNBSEQTM測(cè)序，可實(shí)現(xiàn)人全基因組變異檢測(cè)SNP 99.9%，Indel 99%超高精度。此外，新增加了機(jī)器學(xué)習(xí)模塊MegaBOLT-RC，在不額外增加大量計(jì)算情況下可顯著提高精度。
02、深度學(xué)習(xí)超高精度，助力減少測(cè)序費(fèi)用
使用深度學(xué)習(xí)變異檢測(cè)模塊，可使分析精度保持不變的情況下，大幅降低測(cè)序深度，節(jié)省測(cè)序成本。
15X PCR-Free數(shù)據(jù)的深度學(xué)習(xí)變異檢測(cè)結(jié)果相比30X PCR數(shù)據(jù)的經(jīng)典算法變異檢測(cè)結(jié)果，SNP接近且INDEL較好。
15X PCR-Free數(shù)據(jù)的深度學(xué)習(xí)變異檢測(cè)結(jié)果相比30X PCR數(shù)據(jù)的經(jīng)典算法變異檢測(cè)結(jié)果，SNP接近且INDEL較好。
經(jīng)典算法
MegaBOLT-DV
集成
MegaBOLT通過(guò)集成自主研發(fā)的實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)ZLIMS，可實(shí)現(xiàn)測(cè)序+分析一站式全自動(dòng)調(diào)度運(yùn)行?？膳c華大智造DNBSEQ? 或其他廠商測(cè)序儀聯(lián)合使用，測(cè)序與分析緊密結(jié)合，無(wú)需人工發(fā)起計(jì)算任務(wù)，自動(dòng)運(yùn)行一氣呵成。
- 實(shí)驗(yàn)室儀器設(shè)備管理與實(shí)時(shí)監(jiān)控
- 樣本實(shí)驗(yàn)信息記錄與追溯
- 數(shù)據(jù)傳輸及管理
- 分析任務(wù)調(diào)度及計(jì)算
- 分析結(jié)果與報(bào)告的管理及可視化展示
-
易于使用采用web端設(shè)計(jì)，操作方式簡(jiǎn)單便捷。用戶可直接在網(wǎng)頁(yè)上提交任務(wù)并查看結(jié)果報(bào)告，無(wú)須生物信息技術(shù)背景，輕松安排計(jì)算任務(wù)。
-
經(jīng)濟(jì)MegaBOLT大幅提升計(jì)算效率，嚴(yán)格控制計(jì)算硬件成本，這使得性價(jià)比直線上升。 使得一臺(tái)MegaBOLT/ZBOLT/ZBOLT Pro達(dá)到數(shù)十臺(tái)常規(guī)計(jì)算機(jī)的生信分析能力，節(jié)省大量硬件費(fèi)用。
核心技術(shù):
異構(gòu)計(jì)算 實(shí)現(xiàn)高速序列分析
異構(gòu)計(jì)算 實(shí)現(xiàn)高速序列分析
MegaBOLT完成從測(cè)序數(shù)據(jù)FASTQ輸入，至變異檢測(cè)結(jié)果VCF/gVCF，及比對(duì)結(jié)果BAM的輸出。
內(nèi)部采用多流水線計(jì)算結(jié)構(gòu)，并對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行細(xì)粒度流水操作，除此之外，還對(duì)全流程進(jìn)行了深度流水線化及并行化改造，實(shí)現(xiàn)WGS/WES流程的高速分析。
內(nèi)部采用多流水線計(jì)算結(jié)構(gòu)，并對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行細(xì)粒度流水操作，除此之外，還對(duì)全流程進(jìn)行了深度流水線化及并行化改造，實(shí)現(xiàn)WGS/WES流程的高速分析。
已發(fā)表文章
相關(guān)材料
-
MegaBOLT產(chǎn)品介紹
-
MegaBOLT報(bào)告案例
-
MegaBOLT網(wǎng)頁(yè)數(shù)據(jù)說(shuō)明和腳本
