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在第五期智造微課中，性能大升級(jí)的MGISEQ-200線上亮相，引發(fā)了極為火爆的“大批圍觀”。聚焦升級(jí)版MGISEQ-200的性能特色、應(yīng)用場(chǎng)景和抗疫表現(xiàn)，本期微課回顧為大家進(jìn)行一一梳理。

MGISEQ-200升級(jí)亮點(diǎn)速覽

1. 通量更靈活

升級(jí)版MGISEQ-200通量愈顯靈活。其中，大載片（FCL，有效reads數(shù)：500M）可滿足批量樣本集中交付，降低單樣成本；小載片（FCS，有效reads數(shù)：75-100M）可實(shí)現(xiàn)緊急樣本快速測(cè)序，降低開機(jī)成本。

2. 速度更快

配備優(yōu)化后的生化反應(yīng)，MGISEQ-200為測(cè)序提速。其中，小載片測(cè)序（FCS，SE50）最快僅需6小時(shí)。面對(duì)ICU樣本或突發(fā)疫情等情況時(shí)，升級(jí)版MGISEQ-200的優(yōu)勢(shì)更為明顯，可在第一時(shí)間獲取未知致病原檢測(cè)結(jié)果。

3. 讀長(zhǎng)更長(zhǎng)

MGISEQ-200的大小載片（FCL/FCS）均支持PE150，數(shù)據(jù)量產(chǎn)出穩(wěn)定，可以解鎖更多應(yīng)用，包括：靶向捕獲/多重測(cè)序、RNA測(cè)序和WES測(cè)序等。

4. 質(zhì)量更高

經(jīng)過結(jié)構(gòu)化大數(shù)據(jù)訓(xùn)練的軟件算法，升級(jí)版MGISEQ-200在堿基識(shí)別上更準(zhǔn)確，配合優(yōu)化后的生化試劑，能提供更高質(zhì)量的數(shù)據(jù)。以人細(xì)胞系標(biāo)準(zhǔn)樣本NA12878為例，使用MGISEQ-200 PE100讀長(zhǎng)進(jìn)行測(cè)序，Read1 Q30≥90%，Read2 Q30≥85%以上，Mapping Rate、Duplication Rate、變異檢出等性能均表現(xiàn)優(yōu)秀。

適配更多應(yīng)用，滿足更多測(cè)序需求

基于MGISEQ-200測(cè)序平臺(tái)，華大智造提供自動(dòng)化的產(chǎn)品組合，包括：自動(dòng)化樣本制備系統(tǒng)，高通量測(cè)序儀和生信分析加速器。基于同一套硬件系統(tǒng)，可拓展多種不同應(yīng)用，不僅適配華大智造的產(chǎn)品，也支持第三方文庫(kù)制備試劑盒和第三方分析軟件。

MGISEQ-200助力抗疫，身手不凡

基于MGISEQ-200，某地疾控中心成功在兩天內(nèi)完成當(dāng)?shù)厥桌鹿诓±龢颖镜牟《净蜩b定和組裝，第一時(shí)間獲取了全長(zhǎng)29.9Kb的病毒基因組序列，在戰(zhàn)“疫”中充分展現(xiàn)了中國(guó)速度。

泰國(guó)疾控中心使用MGISEQ-200對(duì)疑似病例樣本進(jìn)行深度測(cè)序和精準(zhǔn)檢測(cè)，解決了低病毒載量下qPCR檢測(cè)Ct值處于臨界值的問題。

韓國(guó)科學(xué)家團(tuán)隊(duì)利用MGISEQ-200，對(duì)新冠病毒感染的Vero細(xì)胞總RNA進(jìn)行了分析，并結(jié)合以往研究給出了新冠病毒轉(zhuǎn)錄組和表觀轉(zhuǎn)錄組的高清圖譜。