單細(xì)胞組學(xué)已廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)科研和臨床前研究,通過單細(xì)胞測(cè)序可以有效研究組織的異質(zhì)性,發(fā)現(xiàn)新的細(xì)胞群和細(xì)胞亞群,極大的促進(jìn)了我們對(duì)細(xì)胞特性、狀態(tài)、多樣性和功能的理解。本文將與您分享如何基于便攜式單細(xì)胞系統(tǒng)DNBelab C4開展單細(xì)胞組學(xué)研究,以及基于該系統(tǒng)能夠開展開哪些應(yīng)用。
一、為什么需要單細(xì)胞組學(xué)研究?
組織包含各種細(xì)胞類型及細(xì)胞中間態(tài),若使用群體測(cè)序方法,只可以得到組織細(xì)胞類型的基因表達(dá)均值,無法體現(xiàn)特定或少量細(xì)胞類型的基因表達(dá)信息。而單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)可以檢測(cè)單個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)譜,能夠有效開展組織異質(zhì)性研究,提升研究分析的精準(zhǔn)度。
二、便攜式單細(xì)胞系統(tǒng)DNBelab C4
由于單細(xì)胞組學(xué)研究較大程度依賴相關(guān)儀器,且研究成本較高,因此在一定程度上限制了單細(xì)胞領(lǐng)域的科研探索以及應(yīng)用轉(zhuǎn)化。
在此背景下,華大智造推出了便攜式單細(xì)胞系統(tǒng)DNBelab C4 ,DNBelab C4 小巧輕便,無需電源,重量不到220g,操作簡(jiǎn)單,可隨時(shí)開始單細(xì)胞建庫(kù),同時(shí)可有效降低單細(xì)胞建庫(kù)成本。
該系統(tǒng)擁有:
1. 低雙胞率
2. 穩(wěn)定的基因檢測(cè)能力
3. 高效捕獲轉(zhuǎn)錄本及稀有細(xì)胞類型
可支持手工建庫(kù)或使用MGISP系列自動(dòng)化建庫(kù),基于DNBSEQ測(cè)序平臺(tái)檢測(cè),能夠獲得更高質(zhì)量數(shù)據(jù)。對(duì)于已在其他測(cè)序平臺(tái)上開展的研究項(xiàng)目,也可支持多平臺(tái)數(shù)據(jù)整合分析。
三、DNBelab C4可支持的應(yīng)用
DNBelab C系列細(xì)胞組學(xué)產(chǎn)品,包含DNBelab C便攜式單細(xì)胞系統(tǒng)、DNBelab C系列單細(xì)胞文庫(kù)制備套裝以及DNBelab C系列單細(xì)胞分析工具包?;诒銛y式單細(xì)胞系統(tǒng)DNBelab C4,可以支持High-throughput 3' scRNA-seq、High-throughput scATAC-seq等,同時(shí)在Multi-omics approaches等領(lǐng)域也已經(jīng)開展相關(guān)探索及開發(fā)。
近期一項(xiàng)研究[1] 利用DNBelab C4便攜式單細(xì)胞系統(tǒng),對(duì)食蟹猴的主要組織器官(肺、腎臟、肝、胰腺、大腦、主動(dòng)脈、甲狀腺、腮腺和血液)進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,建立了食蟹猴單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù),鑒定出44種食蟹猴的主要細(xì)胞類型,在國(guó)際上首次完成構(gòu)建非人靈長(zhǎng)類單細(xì)胞圖譜。
四、千萬(wàn)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組計(jì)劃
在2019年華大智造拉脫維亞基地開幕儀式上正式啟動(dòng)“1000萬(wàn)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組計(jì)劃(10 Million Single-cell Transcriptome Project, scT10M)”,該計(jì)劃將利用DNBSEQ平臺(tái)以及DNBelab C系列等高通量、高精準(zhǔn)度的單細(xì)胞測(cè)序研究工具和策略,對(duì)人類和其他物種開展單細(xì)胞測(cè)序和分析,并與科學(xué)界共享數(shù)據(jù)和研究成果。scT10M計(jì)劃的合作伙伴已包括英國(guó)、德國(guó)、丹麥等國(guó)家的科學(xué)家,目前開放招募合作,如有興趣可與我們聯(lián)系(郵箱 P_sc10M@genomics.cn)。
參考文獻(xiàn):
【1】Single-cell atlas of a non-human primate reveals new pathogenic mechanisms of COVID-19
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