9月13日，華大智造宣布其DNBSEQ-G400（該產(chǎn)品在境內(nèi)銷售名稱為MGISEQ-2000）高通量基因測序平臺以及無分隔長片段stLFR(single tube long fragment reads)技術(shù)將支持非洲生物基因組項目(African BioGenome Project) 開展首個植物物種的測序工作，促進非洲大陸生物多樣性保護和經(jīng)濟社會及科學進步。

據(jù)了解，非洲生物基因組項目于2021年正式啟動，隸屬于地球生物基因組計劃(EBP)，也是萬種植物基因組計劃(10KP)的合作項目。該項目計劃對當?shù)?05,000個特有物種，包括植物、動物、真菌、原生生物和其他真核生物等基因組進行測序，由109名非洲科學家(其中87人在非洲工作)和22個非洲組織共同開展。

作為非洲生物基因組項目的設(shè)備供應(yīng)商，華大智造為來自基因組學、生物信息學、生物多樣性和農(nóng)業(yè)領(lǐng)域的非洲研究人員和決策者構(gòu)建非洲特有物種的參考基因組提供前沿的測序技術(shù)平臺，助力動植物育種者創(chuàng)建有韌性、可持續(xù)的糧食系統(tǒng)。同時這項工作將為改善非洲公共衛(wèi)生，加強農(nóng)業(yè)水平，保護生物多樣性提供可靠的信息支撐。

SAMRC基因組學平臺主任Craig Kinnear教授（中）及團隊科學家

南非醫(yī)學研究理事會 (SAMRC) 基因組學平臺主任Craig Kinnear教授說: “近年來，伴隨著先進技術(shù)的日益涌現(xiàn)，植物基因組學在保護植物物種多樣性方面發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。感謝華大智造創(chuàng)新工具和南非醫(yī)學研究理事會的支持，讓我們能夠立足非洲，造福非洲，向著組建非洲動植物參考基因組庫的目標更近了一步?！?/span>

華大智造歐非區(qū)負責人侯勇博士表示:“我們很自豪地看到南非醫(yī)學研究理事會(SAMRC)的團隊利用華大智造的核心技術(shù)對非洲生物基因組項目的首批植物物種進行測序。這是我們高效創(chuàng)新的stLFR技術(shù)在非洲的首次應(yīng)用，我們期待著此技術(shù)讓當?shù)馗嗟目茖W家和研究人員受益，推進基因組學研究?！?/span>

值得一提的是，9月12日Nature Biotechnology發(fā)文報道了非洲生物基因組項目開放研究院（African BioGenome Project (AfricaBP) Open Institute for Genomics and Bioinformatics）的成功實施。這一開創(chuàng)性的基因組和生物信息學知識交流平臺由非洲生物基因組項目與非洲當?shù)貦C構(gòu)共同策劃，旨在為全非洲建立可公開訪問的線上研討會平臺，通過開展生物多樣性基因組學和生物信息學課程，增進非洲科學家間的學術(shù)交流。

非洲生物基因組項目創(chuàng)始人、聯(lián)合主席、英國劍橋大學臨床醫(yī)學院生物信息學家ThankGod Echezona Ebenezer博士表示：“自非洲大陸自由貿(mào)易協(xié)定(AfCTA)生效后，及時建立非洲基因組學和生物信息學開放研究所具有重要意義。有了這樣一個信息共享交流平臺，非洲國家級科學機構(gòu)、本土和國際合作伙伴及各組織都可以通過對此平臺的支持，來為建立聯(lián)合的基因組和生物信息學基礎(chǔ)設(shè)施，推動非洲生物經(jīng)濟的可持續(xù)發(fā)展做出貢獻?！?/span>

非洲各地科學家自主申請并參加Open Institute 南非研討會合影留念

8月21日至25日，Open Institute在非洲南部舉辦了為期5天的研討會，華大智造作為主要贊助商之一，在南非比勒陀利亞農(nóng)業(yè)研究理事會(ARC)的生物技術(shù)平臺上向科學家們展示了如何利用最新的stLFR和DNBSEQ技術(shù)構(gòu)建高質(zhì)量的參考基因組。10月9日至10日，華大智造還將在摩洛哥舉辦的北非研討會上進行展示。

參加Open Institute 南非研討會的科學家們

華大智造自主研發(fā)的stLFR（無分隔長片段）技術(shù)基于獨有的DNA分子共標簽技術(shù)，通過將來源于同一DNA長片段的短讀測序片段標記上相同分子標簽，可基于高精度短讀測序獲取橫跨 300kb 基因組區(qū)域的信息。結(jié)合華大智造核心DNBSEQ測序技術(shù)，stLFR技術(shù)能夠?qū)崿F(xiàn)高質(zhì)量變異檢測，二倍體基因組定相，結(jié)構(gòu)變異解析和基因組從頭組裝等應(yīng)用。

stLFR 技術(shù)適用于多種應(yīng)用方向，包括遺傳疾病和癌癥研究，孕前或產(chǎn)前基因檢測，農(nóng)業(yè)育種研究和宏基因組分析等。在動植物基因組研究方面，stLFR 可實現(xiàn)高質(zhì)量的全基因組組裝，僅需少量的起始 DNA 樣本 (<10ng) 便可達到scaffold N50 > 106bp 水平。目前基于華大智造stLFR 技術(shù)累計發(fā)表的高質(zhì)量文章超過50篇，文章發(fā)表于包括 Nucleic Acids Research, Nature ecology & evolution, Genome Research等頂級期刊。

未來，華大智造將持續(xù)打造創(chuàng)新的生命數(shù)字化產(chǎn)品，加速基因組測序進程，加強推進多樣性物種研究和保護的承諾。