在DNA聚合酶的催化下，將測(cè)序引物錨定分子和熒光探針在DNB上進(jìn)行聚合，洗脫掉未結(jié)合的探針后，在激光的作用下熒光信號(hào)被激發(fā)，隨后利用高分辨率成像系統(tǒng)對(duì)光信號(hào)進(jìn)行采集、讀取和識(shí)別，從而獲得當(dāng)前待測(cè)堿基的序列信息，然后加入再生洗脫試劑，去除熒光基團(tuán)，進(jìn)入下一個(gè)循環(huán)的檢測(cè)。

華大智造優(yōu)化了大量的反應(yīng)條件，從上萬(wàn)個(gè)酶突變體中篩選得到最優(yōu)秀的測(cè)序酶，使生化反應(yīng)時(shí)間可以縮短到1分鐘以內(nèi)。

在完成一鏈測(cè)序后，加入具有鏈置換功能的DNA聚合酶進(jìn)行DNA二鏈合成反應(yīng)，在持續(xù)的延伸過(guò)程中，當(dāng)遇到雙鏈結(jié)構(gòu)的時(shí)候，在DNA聚合酶的解旋作用下，完成邊解旋邊復(fù)制的反應(yīng)，形成大量的單鏈DNA作為二鏈測(cè)序的模板（圖5-中），然后雜交二鏈測(cè)序引物，開始二鏈的cPAS測(cè)序。

利用DNA聚合酶的鏈置換特性，實(shí)現(xiàn)了DNB的雙端測(cè)序，而且重新合成的二鏈拷貝數(shù)更多，能夠獲得更強(qiáng)的熒光信號(hào)，有效的提高了測(cè)序的準(zhǔn)確性。

旨在根據(jù)各個(gè)通道的光信號(hào)強(qiáng)度完成堿基識(shí)別并計(jì)算每個(gè)堿基的質(zhì)量得分。通過(guò)對(duì)已有數(shù)據(jù)模型的訓(xùn)練，建立信號(hào)的特征和測(cè)序錯(cuò)誤的對(duì)應(yīng)關(guān)系，在進(jìn)行堿基識(shí)別的時(shí)候，根據(jù)每個(gè)堿基的信號(hào)特征輸出預(yù)估的錯(cuò)誤率。 質(zhì)量得分根據(jù)phred-33質(zhì)量得分標(biāo)準(zhǔn)。

華大智造自主開發(fā)的Sub-pixel Registration算法，使圖像配準(zhǔn)精確度達(dá)到了亞像素級(jí)別，大大提高了堿基識(shí)別的準(zhǔn)確度。

此外，通過(guò)GPU加速的方法，在更高精度的算法條件下實(shí)現(xiàn)了200倍以上的加速，在提高識(shí)別準(zhǔn)確率的同時(shí)實(shí)現(xiàn)了圖像處理和堿基識(shí)別的實(shí)時(shí)化，數(shù)據(jù)處理速度處于同行業(yè)領(lǐng)先水平。