2019年10月26日,“百萬微生態(tài)”國際合作計劃(MMHP)在深圳第14屆國際基因組學大會(ICG-14)上正式啟動,來自中國、瑞典、丹麥、法國、拉托維亞等多國科學家將合作開展微生物宏基因組研究,致力于在未來三至五年內(nèi)對100萬份來自腸道、口腔、皮膚、生殖道等器官的微生物組樣品進行測序分析,繪制人體微生物組圖譜,構(gòu)建起全球最大的人體微生物組數(shù)據(jù)庫。
在啟動儀式上,瑞典卡羅林斯卡醫(yī)學院轉(zhuǎn)化微生物組研究中心主任Lars Engstrand教授、上海瑞金醫(yī)院-中國國家代謝疾病臨床研究中心劉瑞欣研究員、華大集團首席執(zhí)行官兼華大生命科學研究院院長徐訊發(fā)表致辭,并和華大智造總裁余德健及華大生命科學研究院執(zhí)行院長侯勇等共同宣布計劃啟動。瑞典皇家工程院院士Mathias Uhlén教授、中國國家代謝疾病臨床研究中心主任寧光院士發(fā)來祝賀。
多國聯(lián)合開展“百萬微生態(tài)”研究
據(jù)悉,“百萬微生態(tài)”國際合作計劃(MMHP)也是目前全球規(guī)模最大的國際微生態(tài)研究計劃,由瑞典卡羅林斯卡醫(yī)學院、中國國家代謝疾病臨床研究中心、丹麥哥本哈根大學、丹麥技術(shù)大學、法國國家農(nóng)業(yè)科學院宏基因組研究所、拉脫維亞分子生物學研究所和深圳華大生命科學研究院等機構(gòu)聯(lián)合發(fā)起,旨在通過華大智造獨家提供的DNBSEQTM微生物宏基因組測序技術(shù),繪制不同種族、年齡、性別以及健康狀態(tài)下的人體微生物圖譜,建立大規(guī)模人群水平的微生態(tài)研究基線,從而推動人體微生態(tài)領(lǐng)域的前沿轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究。
對此,上海瑞金醫(yī)院-中國國家代謝疾病臨床研究中心劉瑞欣研究員說:“通過更大規(guī)模的研究人體微生物組在正常與病理狀態(tài)、疾病治療前后的變化、解析其對人體代謝與健康作用機制,可在未來為代謝性疾病、腫瘤、生殖健康和新生兒等多領(lǐng)域的新療法提供更多可能” 。
作為計劃發(fā)起方之一,瑞典卡羅林斯卡醫(yī)學院轉(zhuǎn)化微生物組研究中心(CTMR)主任Lars Engstrand教授在啟動儀式上表示:“百萬微生態(tài)’計劃將完成百萬樣本規(guī)模的人體微生物組圖譜,這將為當前微生態(tài)領(lǐng)域研究奠定堅實的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)”。
據(jù)悉,作為宏基因組研究領(lǐng)先的基礎(chǔ)科研機構(gòu),華大生命科學研究院將為該項目中20萬份樣本提供相應(yīng)的科研平臺和分析資源。華大集團首席執(zhí)行官兼華大生命科學研究院院長徐訊博士表示,與個體基因組一樣,人體微生物組與個體健康密切相關(guān)。盡管目前全球?qū)W者在該領(lǐng)域發(fā)表了大量科研論文,然而作為當今生命科學最熱門的研究領(lǐng)域之一,國際上卻缺乏大規(guī)模、標準化的人體微生物組開放數(shù)據(jù)庫及研究共享框架,極大地限制了該領(lǐng)域的研究和交流。通過多國合作實施“百萬微生態(tài)”這一超大規(guī)模研究計劃,構(gòu)建起全球最大人體微生物組數(shù)據(jù)庫,將有力地促進該領(lǐng)域的基礎(chǔ)研究和國際交流,對后續(xù)產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用也具有重要意義。
華大智造提供高通量測序技術(shù)支持
目前,依托華大智造測序技術(shù)和平臺,“百萬微生態(tài)”國際合作計劃(MMHP)已完成首批1萬個樣本的宏基因組測序。該批數(shù)據(jù)由中國國家代謝疾病臨床研究中心、瑞典卡羅琳斯卡醫(yī)學院、法國國家農(nóng)業(yè)科學院宏基因組研究所及華大生命科學研究院等多家科研機構(gòu)聯(lián)合開展的微生態(tài)分析得出,其數(shù)據(jù)質(zhì)量獲得了各國科學家一致好評,這也為后續(xù)10萬和100萬樣本的人體微生物組圖譜的繪制奠定了堅實基礎(chǔ)。該項目數(shù)據(jù)將嚴格遵循國際數(shù)據(jù)安全管理規(guī)定進行存儲和研究使用。
據(jù)了解,今年6月瑞典卡羅林斯卡醫(yī)學院轉(zhuǎn)化微生物組研究中心與華大智造達成戰(zhàn)略合作,引進其高通量測序平臺??_林斯卡醫(yī)學院是世界頂尖醫(yī)學院之一,負責評審每年的諾貝爾生理學或醫(yī)學獎,其轉(zhuǎn)化微生物組研究中心涵蓋生物學、臨床和流行病學的研究。該研究中心主任Lars Engstrand教授表示,通過華大智造的測序平臺,他和團隊將原來的微生物組學研究從16SrRNA基因擴增子測序升級到了Shotgun宏基因組測序,“我們還將華大智造的DNBSEQTM技術(shù)與其他測序技術(shù)進行了全面對比,其產(chǎn)出的數(shù)據(jù)質(zhì)量令我們感到驚喜,這正是我們最想要的平臺?!?/span>
“微生態(tài)”研究應(yīng)用新的里程碑
近年來,隨著基因組學相關(guān)技術(shù)的迅速發(fā)展,微生物組研究已成為全球生命科學研究的熱點。2008年,歐盟發(fā)起了“人類腸道宏基因組計劃”(MetaHIT),其一系列研究成果先后在《自然》等國際頂級雜志發(fā)表,這為國際微生物組研究合作開創(chuàng)了先河。華大作為唯一加入該計劃的非歐盟國家機構(gòu),在研究平臺和技術(shù)中發(fā)揮了重要作用。
此次由瑞典卡羅林斯卡醫(yī)學院、中國國家代謝疾病臨床研究中心與華大等機構(gòu)共同發(fā)起的國際“百萬微生態(tài)”研究計劃,將人體微生物組從腸道拓展到更多共生部位,同時樣本規(guī)模提升到百萬級,將成為繼MetaHIT之后國際微生物組研究合作的又一個里程碑。
據(jù)了解,“百萬微生態(tài)”國際合作計劃還公布了其公共郵箱(mmhp@genomics.cn),歡迎更多相關(guān)領(lǐng)域機構(gòu)進一步交流與合作,以共同推動微生態(tài)領(lǐng)域的研究和應(yīng)用。