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破解疫情困局,實現(xiàn)精準檢測!華大智造新冠病毒整體檢測平臺加快疑似樣本檢測速度

時間:2020-02-06作者:華大智造閱讀數(shù):7767分享

華大集團聯(lián)合創(chuàng)始人兼董事長汪建在春節(jié)期間親歷武漢疫情防控一線后提出:“在注重臨床搶救的同時,把精準檢測和診斷視為同等重要:快速建成萬例通量的檢測中心?!?/span>


在此背景下,2月5日,在武漢市新型肺炎防控指揮部部署下,每日可檢測萬人份樣本的新型冠狀病毒應急檢測實驗室——“火眼”實驗室正式啟動試運行。該實驗室的投入使用將在極大程度上緩解新冠病毒診斷壓力,有利于破解疫情困局。華大智造新冠病毒高通量自動化設備和測序儀在經(jīng)過疫情檢測一線“實戰(zhàn)”考驗后,也將在“火眼”實驗室投入使用。


武漢“火眼”實驗室正式投入試運營


華大智造新冠病毒檢測平臺:自動化核酸提取+高通量測序雙管齊下


在疫情防控進入攻堅階段之際,高通量精準檢測可為發(fā)熱病人確診、高危人群排查、疑似病例甄別、陽性感染者“早發(fā)現(xiàn)、早隔離、早診斷、早治療”提供精準判斷依據(jù)。


目前一線應用的新冠病毒檢測技術(shù)PCR方法可對病毒進行篩查,適用于對患者樣本中是否存在新冠病毒進行診斷;而高通量測序技術(shù)則更為全面,除了可以用來診斷新冠病毒是否存在之外,還可以對病毒進化來源、致病病理機制和病毒變異情況進行研究與分析。更為關(guān)鍵的是,它還能檢測出包括新冠病毒在內(nèi)的所有病原體以及病原體的全基因序列,這對重癥患者的診斷和治療具有重要意義。為實現(xiàn)高通量精準檢測,急需構(gòu)建高通量病毒核酸檢測和配套測序能力。



應對一線疫情檢測需求,華大智造提供2019-nCoV檢測平臺,不僅可針對實時定量反轉(zhuǎn)錄酶聯(lián)反應法(RT-PCR)提供一站式自動化核酸提取平臺,還可針對高通量測序需求提供通量靈活的基因測序儀。


據(jù)了解,這些檢測設備和系統(tǒng)除了在武漢“火眼”實驗室應用外,也已在中國國家疾控中心和各地疾控部門實現(xiàn)不同程度的應用,為加快疑似病例的檢測與確診,有效緩解各地疑似樣本的積壓情況提供了有力的工具支撐。


病毒核酸自動化提取:一站式樣本處理實驗室,加速病毒檢測


當前,在新型冠狀病毒檢測中,疑似樣本的病毒核酸提取大多采用人工操作,這已成為制約樣本檢測提速的最大“瓶頸”,也加大了一線醫(yī)務人員病毒感染的潛在風險。


為實現(xiàn)病毒核酸自動化提取,華大智造2019-nCoV檢測平臺可提供MGISP-100及MGISP-960兩種自動化樣本制備系統(tǒng),同時可配套病毒RNA的提取試劑和耗材。該系統(tǒng)在樣本處理過程中具有通量靈活、快速自動、強大拓展性等特點,上機后完全無人工干預,可在1小時實現(xiàn)自動化核酸提取,一站到位,安全防控。



其中,MGISP-100是全球首個獲得臨床二類醫(yī)療器械證的自動化樣本制備系統(tǒng),可提取8-32樣本/40-80分鐘,每次可減少醫(yī)務人員約2個小時的手工操作時間,適用中小型實驗室。


MGISP-960則為高通量自動化樣本制備系統(tǒng),已獲得NMPA認證,其自動化程度更高,每小時可提取36-96樣本,1人可同時操作2臺,操作效率大幅提升,適用于企業(yè)、臨檢、醫(yī)院等領(lǐng)域的中高通量用戶。為滿足目前大規(guī)模人群、高通量篩查的緊急需求,MGISP-960的通量還可升級為192樣本/80分鐘。




此外,該平臺還配置了紫外和HEPA高效空氣過濾系統(tǒng),可用于每天殺菌消毒和清潔,并可適配目前主流的新型冠狀病毒核酸檢測試劑盒(熒光PCR法),以及第三方磁珠提取試劑盒和文庫構(gòu)建流程。


高通量測序:有效提高陽性率,監(jiān)測可能存在的變異


除了提供病毒核酸自動化提取設備外,華大智造2019-nCoV檢測平臺還可提供高通量測序方法及多款設備。



目前,新型冠狀病毒溯源、流行、變異規(guī)律、變異監(jiān)測、分子流行病學、人類感染的發(fā)病機理等尚待進一步明確。病毒在傳播過程中可能會發(fā)生變異,并在一定程度上將影響RT-PCR的敏感性,采用高通量測序方法則可彌補這一缺點,并監(jiān)測到可能的病毒變異。部分病毒含量較低的樣本,在低于RT-PCR最低檢出限時,采用高通量測序方法則可以提高陽性檢出率,避免漏檢和錯檢;對于疑似感染、多重感染或繼發(fā)感染病原,采用高通量測序方法則可進行并發(fā)檢測,提供更多可能感染的病原信息。


從快速測定未知病原,到快速鑒定已知序列,再到陽性樣本的結(jié)果確認以及可能存在的序列變異動態(tài)監(jiān)控,都可以采用高通量測序方法有效應對。華大智造2019-nCoV檢測平臺包含多款基因測序儀,均已通過國家藥品監(jiān)督管理局審批上市,可用于臨床鑒別診斷包括新型冠狀病毒在內(nèi)的其他冠狀病毒和呼吸道病原感染,快速檢測病毒序列,并為監(jiān)測可能存在的病毒變異提供工具和平臺支撐。


根據(jù)樣本數(shù)量、測序數(shù)據(jù)量和運行通量的需求,華大智造高通量測序平臺可提供多平臺適配,包括DNBSEQ-G系列(MGISEQ-200、MGISEQ-2000/2000FAST),以及DNBSEQ-T系列(DNBSEQ-T7)等多款機型,以用于疫情防控。



面對不明發(fā)熱、不明病因、無法確診的個別樣本檢測需求時,可選用DNBSEQ-G系列基因測序儀(MGISEQ-200、MGISEQ-2000FAST等機型),它能在24小時內(nèi)快速鑒定,為進一步進行序列分析和病毒演變提供數(shù)據(jù)支持。


面對多例疑似樣本檢測需求,可選擇MGISEQ-2000平臺,其單次運行支持32個樣本同時上機。面對大量疑似樣本快速鑒定需求時,可直接選用DNBSEQ-T7。作為目前全世界日通量最高的測序儀,DNBSEQ-T7可在5-6小時內(nèi)支持128例樣本同時上機測序(測序策略:SE50),從樣本到數(shù)據(jù)分析結(jié)果,不超過20小時。


雙管齊下,對癥施“測”。應對疫情發(fā)展,華大智造將全力投入,通過技術(shù)、設備和人員支撐,為各地疫情防控實現(xiàn)高通量精準檢測提供保障。


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