2020年2月21日,華大智造在加利福尼亞州圣何塞宣布,從今年4月份開始,其基于新型CoolMPS? 化學技術(shù)的測序儀和測序試劑將正式在美國啟用。
這項新型測序技術(shù)將全面提升華大智造DNBSEQ系列測序系統(tǒng)的性能、質(zhì)量、實用性和性價比,更好地推動科學研究。DNBSEQ系列測序系統(tǒng)采用了陣列芯片技術(shù)、DNA納米球制備技術(shù)和基于CoolMPS? 抗體識別的測序方法等核心專利技術(shù),這些技術(shù)的結(jié)合將重新定義大規(guī)模平行測序(MPS, Massively Parallel Sequencing)。目前,華大智造已申請超過700項國內(nèi)國際專利,持續(xù)創(chuàng)新為行業(yè)提供準確度更高,性能更好的測序平臺。
近日一篇發(fā)表在bioRxiv的預印文章(doi:https://doi.org/10.1101/2019.12.20.885517)對華大智造DNBSEQ?的工作原理進行了全面的概述。研究表明,與基于PCR的測序儀相比,在PCR-Free的DNBSEQ?平臺上,個人全基因組插入缺失錯誤降低了55%。
bioRxiv 預印文章對華大智造DNBSEQ?工作原理進行了全面的概述
根據(jù)計劃,華大智造將在2020年第2季度在美國市場推出DNBSEQ家族的G系列測序儀,在第3季度推出T系列測序儀,并將逐步推出其新型CoolMPS?高通量測序試劑盒以及文庫制備試劑盒系列,以全面滿足用戶的全基因組測序、全外顯子組測序、RNA測序、宏基因組學測序以及單細胞測序等應用需求。
2019年華大智造首席科學家Rade Drmanac博士在AGBT會議上發(fā)布了首個基于堿基特異性抗體的測序化學技術(shù)CoolMPS?。在此后與全球各地的伙伴合作測試過程中,CoolMPS? 技術(shù)展現(xiàn)了優(yōu)異的性能和測序質(zhì)量,包括單端測序400個堿基的能力(bioRxiv,doi:https://doi.org/10.1101/2020.02.19.953307)及其在各種應用中的兼容性。華大智造的合作伙伴將在第20屆基因組生物學技術(shù)進展會(AGBT)上分享相關(guān)應用情況及信息。
CoolMPS?技術(shù)是一種基于抗體的獨特化學方法,在其測序過程中引入了未標記的核苷酸和四種熒光標記的抗體,以識別摻入的堿基。在這一新過程中,在每個測序循環(huán)中都添加了天然的無標記堿基,可有效避免DNA“疤痕”積聚對后續(xù)讀取準確性的影響,實現(xiàn)更準確和更長的測序。這一技術(shù)已經(jīng)在中國、美國和歐洲等國家和地區(qū)申請了專利。
CoolMPS高通量測序試劑套裝
它的優(yōu)點可以總結(jié)為以下幾點:首先,它信號強,每個抗體能標記多個熒光,堿基檢查信號更強,相同拷貝數(shù)的DNB用CoolMPS可以獲得更高的信號和更好的信噪比,從而使測序更準確。其次,它沒有非天然堿基帶來的熒光淬滅,因為熒光分子標記在抗體上,測序過程中無多余化學鍵的殘留, 所以準確性更高。再者,它的反應更完全,即DNA聚合酶結(jié)合天然堿基的效率更高,測序讀長更長。
華大智造首席科學官Rade Drmanac博士表示:“華大智造有基于DNBSEQ?核心技術(shù)的測序儀和領先的大規(guī)模平行測序化學技術(shù),而美國擁有全球領先的基因組學市場,我們很高興能夠?qū)⑽覀兊臏y序儀和測序技術(shù)帶入美國,從而更廣泛地推動先進的基因組學應用”。同時他還表示,“華大智造致力于推動MPS技術(shù)的發(fā)展,推動合作伙伴、客戶和整個行業(yè)充分了解人類和其他物種的基因組和細胞,提升全人類的健康水平?!?/span>
華大智造自2016年中旬向市場推出首臺測序儀至今,在全球市場的接受程度不斷提升。截止目前,全球裝機量已超過1,600多臺,并為全球38個國家和地區(qū)的460多家客戶提供服務,包括2019年9月實現(xiàn)交付的超高通量測序儀DNBSEQ-T7?;谌A大智造測序儀數(shù)據(jù)發(fā)表的高水平論文,也已經(jīng)超過了800篇。