近日,北京大學神經(jīng)科學研究所的科學家們在Science Advances 雜志發(fā)表了題為Development of a CRISPR-SaCas9 system for projection-and function-specific gene editing in the rat brain的研究論文。該研究基于CRISPR-SaCas9技術,結合腺相關病毒和細胞標記技術,以功能特異性模式實現(xiàn)基因編輯,在實驗大鼠的腦中實現(xiàn)了特定記憶的精準刪除。
在研究中,研究人員對基因編輯靶點和潛在的脫靶位點進行擴增建庫并使用基因測序儀MGISEQ-200對擴增產(chǎn)物進行深度測序。測序數(shù)據(jù)分析結果顯示:潛在脫靶位點相對于基因編輯靶點在indel發(fā)生率方面至少低兩個數(shù)量級(圖1),同時在單細胞水平上對基因編輯后靶點區(qū)域的indel信息進行了驗證(圖2)。與以往的相關研究報道一致,SaCas9對DNA錯配有較高的抗性,在體內(nèi)能夠保證高的靶點特異性。
圖1 基因編輯靶點和潛在脫靶位點序列及indel發(fā)生率
圖2 基因編輯靶點序列及基因編輯后測序結果展示
作為一款小型化的桌面型基因測序儀,MGISEQ-200小巧、靈活,應用廣泛,支持基于雜交捕獲或多重PCR擴增的靶向測序、小型基因組測序、低深度全基因組測序等多種應用。目前,通過MGISEQ-200獲得測序數(shù)據(jù)并由此展開深入探討的相關研究已陸續(xù)見刊。其中,基于MGISEQ-200深度測序的新冠病毒轉錄組結構研究于4月份登上了Cell雜志,為全球科學家的后續(xù)研究提供參考和依據(jù)。
小貼士1 MGISEQ-200發(fā)表的文章(精選)
[1] 一例基孔肯雅病毒和寨卡病毒混合感染病例的發(fā)現(xiàn).華南預防醫(yī)學.
DOI: 10.13217/j.scjpm.2019.0481
[2] Devolopment of a CRISPR-SaCas9 system for projection and function-specific geneediting in the rat brain. Science Advances.
DOI: 10.1126/sciadv.aay6687
[3] Thearchitecture of SARS-CoV-2 transcriptome. Cell.
DOI: 10.1016/j.cell.2020.04.011
小貼士2 MGISEQ-200操作演示(請點擊鏈接觀看)
【注:MGISEQ-200已在海外部分國家和地區(qū)更名為DNBSEQ-G50】