1月28日,華大智造“移動(dòng)核酸檢測(cè)+基因測(cè)序”雙平臺(tái)在??谕度胧褂?。雙平臺(tái)分兩個(gè)實(shí)驗(yàn)室運(yùn)行,分別是方艙實(shí)驗(yàn)室與測(cè)序?qū)嶒?yàn)室,這兩個(gè)實(shí)驗(yàn)室可以單獨(dú)使用,也可共同“奮戰(zhàn)”。不僅能為海口市提供大規(guī)模核酸檢測(cè),還幫助??谑衅平獠《救蚪M序列,為當(dāng)?shù)卮汗?jié)疫情防控提供支持。
新冠病毒傳播范圍越廣,發(fā)生變異的機(jī)率就越大。在保證大范圍核酸檢測(cè)的同時(shí),破解病毒全基因組序列,監(jiān)控病毒變異顯得非常重要。1月20日,國(guó)務(wù)院聯(lián)防聯(lián)控機(jī)制印發(fā)《關(guān)于進(jìn)一步做好當(dāng)前新冠肺炎疫情防控工作的通知》,要求各地要對(duì)核酸檢測(cè)能力再摸底、再提升,同時(shí)完善病毒基因測(cè)序能力布局。
華大智造積極響應(yīng)國(guó)家號(hào)召,將方艙實(shí)驗(yàn)室與基因測(cè)序平臺(tái)結(jié)合,形成了“移動(dòng)核酸檢測(cè)+基因測(cè)序”雙平臺(tái),雙平臺(tái)分兩個(gè)實(shí)驗(yàn)室運(yùn)行,分別是方艙實(shí)驗(yàn)室與測(cè)序?qū)嶒?yàn)室。當(dāng)中方艙實(shí)驗(yàn)室可以靈活布置到車站、港口、社區(qū)等場(chǎng)所,滿足大通量的檢測(cè)需求。測(cè)序?qū)嶒?yàn)室可以監(jiān)控病毒變異,為后續(xù)疫情防控工作提供有效依據(jù)。

??谑屑部刂行奈⑸餀z驗(yàn)科副科長(zhǎng)李平介紹,方艙實(shí)驗(yàn)室占地34平方米,里面分為試劑準(zhǔn)備區(qū)、標(biāo)本制備區(qū)、擴(kuò)增分析區(qū)和高壓消毒區(qū)。通過(guò)基因擴(kuò)增方法,可以完成一站式核酸檢測(cè),大大提高檢測(cè)效率,可以有效應(yīng)對(duì)大規(guī)模人群的核酸檢測(cè)需要。
方艙實(shí)驗(yàn)室每個(gè)班次需4人至5人操作,不混樣檢每日檢測(cè)6000人次,混樣(10混1)每日檢測(cè)6萬(wàn)人次。檢測(cè)高通量得益于配備了由華大智造自主研發(fā)的全自動(dòng)MGISTP-7000分杯處理系統(tǒng)、自動(dòng)化設(shè)備MGISP-960以及實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)MGI ZLIMS組合而成的一站式平臺(tái)。可以實(shí)現(xiàn)全自動(dòng)化樣本條碼掃描、錄入和分裝程序,自動(dòng)化提取核酸并實(shí)時(shí)監(jiān)控管理核酸檢測(cè)全過(guò)程。
海口“移動(dòng)核酸檢測(cè)+基因測(cè)序”雙平臺(tái)
1.高通量,日通量:6000(不混樣),6萬(wàn)(混樣:10混1)——方艙實(shí)驗(yàn)室
先進(jìn)的自動(dòng)化設(shè)備和系統(tǒng)代替了人工。配備了全自動(dòng)MGISTP-7000分杯處理系統(tǒng)、自動(dòng)化設(shè)備MGISP-960以及實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)MGI ZLIMS。
2.監(jiān)控病毒變異——測(cè)序?qū)嶒?yàn)室
綁定了華大智造自主研發(fā)的基因測(cè)序平臺(tái),能破解病毒全基因組序列,配備了自動(dòng)化樣本制備系統(tǒng)MGISP-100、高通量基因測(cè)序儀MGISEQ-200、PFI病原感染快速鑒定系統(tǒng)。
3.更快速——方艙實(shí)驗(yàn)室
集裝箱改造而成,方便車載運(yùn)輸,可根據(jù)疫情防控所需,靈活布置到車站、港口、社區(qū)等場(chǎng)所。大大減少了樣本運(yùn)送流轉(zhuǎn)的時(shí)間, 減少了患者的流動(dòng),較好的控制疫情。
4.安全可靠——方艙實(shí)驗(yàn)室
符合加強(qiáng)型二級(jí)生物安全實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)。整體負(fù)壓,該實(shí)驗(yàn)室設(shè)置試劑準(zhǔn)備間、樣本處理間、檢測(cè)間三個(gè)主檢測(cè)功能區(qū)。同時(shí)配套進(jìn)、出更衣室及高壓消殺設(shè)備和空調(diào)及機(jī)電室。人員單向流,各實(shí)驗(yàn)區(qū)之間采用傳遞窗及緩沖間隔離,防止氣溶膠污染。
測(cè)序?qū)嶒?yàn)室里面裝備了華大智造自主研發(fā)的基因測(cè)序平臺(tái)。該基因測(cè)序平臺(tái)可以“連線”方艙實(shí)驗(yàn)室,里面配備了華大智造自動(dòng)化樣本制備系統(tǒng)MGISP-100、高通量基因測(cè)序儀MGISEQ-200、PFI病原感染快速鑒定系統(tǒng)。樣本在方艙實(shí)驗(yàn)室被確定為陽(yáng)性樣本后,可以通過(guò)基因測(cè)序平臺(tái)快速、準(zhǔn)確、全面地將病毒進(jìn)行分類鑒定,同時(shí)提供完整的病毒基因序列信息。
新冠疫情爆發(fā)至今,華大智造對(duì)于破解病毒全基因組序列,監(jiān)控病毒變異的研究早已積累了豐富的經(jīng)驗(yàn)。早在2019年12月,在最早一批提交至全球共享流感病毒數(shù)據(jù)庫(kù)GISAID發(fā)布的13例新型冠狀病毒基因組序列數(shù)據(jù)中,有5例數(shù)據(jù)來(lái)自華大智造高通量測(cè)序儀,這為研究分析新型冠狀病毒的進(jìn)化來(lái)源、致病病理機(jī)制提供了第一手資料。
新冠疫情爆發(fā),華大智造緊急部署2臺(tái)DNBSEQ-T7超高通量測(cè)序儀運(yùn)達(dá)武漢,配合MGISEQ-2000,第一時(shí)間獲得病毒的全基因組序列,為后續(xù)疫情防控、試劑盒開(kāi)發(fā)、疫苗研發(fā)提供了有效依據(jù)。
中國(guó)疾控中心周刊
2020年12月,華大智造高通量測(cè)序儀——MGISEQ-200助力海關(guān)發(fā)現(xiàn)了海外變種的新冠毒株。國(guó)家疾控將此境外輸入性病例定義為中國(guó)監(jiān)測(cè)到的首例英國(guó)變種VUI-202012/01病毒株。