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環(huán)球網(wǎng)報道:瑞典抗疫,得到中國超高通量測序儀加持

時間:2021-02-06作者:華大智造閱讀數(shù):3343分享

“這是我們從中國空運過來的超級測序儀,它的測序通量是其他測序儀的8倍。”自新冠疫情發(fā)生以來,最早提出所謂“群體免疫”、反對采取封鎖等限制措施的瑞典,日前被該國媒體瑞典國家電視臺(SVT)曝出仍存在新冠陽性樣本測序率低的問題,加上在英國發(fā)現(xiàn)的變異新冠病毒正在這個北歐國家迅速傳播,該國對新冠病毒基因測序量提出了更高的要求。值得一提的是,SVT電視臺稱,被認為是瑞典少數(shù)可以進行病毒全基因組測序的專業(yè)化實驗室所使用的設(shè)備,正是來自中國企業(yè)——華大智造。


圖片來源:瑞典國家電視臺(SVT)


SVT電視臺稱,目前瑞典只對1%的新冠陽性樣本進行了測序,但瑞典各大區(qū)(省)已被要求將測序量增加到10%。瑞典公共衛(wèi)生局也啟動一項調(diào)研,以全面了解哪些地區(qū)和實驗室能夠進行突變新冠病毒監(jiān)測。


SVT電視臺記者在采訪瑞典國家疫情中心、卡羅林斯卡醫(yī)學(xué)院教授Lars Engstrand時問道:“我們正冒著病毒在看不見的情況下進行著不受控制的突變的風(fēng)險,是不是因為我們開始大規(guī)模測序的時間太晚了?” Lars Engstrand教授則回答說:“今天的步伐的確太慢了,有可能發(fā)生我們無法預(yù)見的風(fēng)險。我們必須增加病毒的全基因測序,許多人也有同樣的認可。至于究竟可能是10%、20%或30%的陽性樣品需要測序,這個要根據(jù)實際情況來制定。”


該電視臺稱,目前瑞典只有少數(shù)高度專業(yè)化的實驗室可以進行病毒全基因組測序和監(jiān)測,卡羅林斯卡大學(xué)國家疫情中心的實驗室就是其中之一,而該實驗室所使用的高通量基因測序儀來自于中國基因測序設(shè)備制造企業(yè)華大智造。


 


Lars Engstrand教授分享,高通量測序能夠獲取病毒的全部序列,精準(zhǔn)鑒定變異,對病毒進行追溯和監(jiān)測;通過對病毒宿主(人)進行多個組學(xué)維度的測序,還可以幫助我們更好地理解發(fā)病機制,為臨床診療和疫苗開發(fā)提供重要的參考。對于突然爆發(fā)的不明原因的新型傳染病,高通量測序作為一種成熟的基因檢測技術(shù),在準(zhǔn)確性、全面性、周期、通量、易用性、成本等方面達到了很好的均衡,已經(jīng)成為相關(guān)科學(xué)研究的基礎(chǔ)手段。


華大智造超高通量測序儀作為“全球日生產(chǎn)能力最強”的基因測序儀,DNBSEQ-T7自發(fā)布就擁有多個“光環(huán)”:“首個4聯(lián)芯片的測序平臺”、“滿負荷PE150不超過24小時”、“日產(chǎn)數(shù)據(jù)量高達6T”、“1天最多可完成60例個人全基因組測序”等等,堪稱“超級生命計算機”。


韓國基因組學(xué)中心(KOGIC)等機構(gòu)在BioRxiv發(fā)布了基于DNBSEQ-T7的多平臺測序性能對比研究,結(jié)果表明:華大智造DNBSEQ測序平臺和其他平臺在測序質(zhì)量、覆蓋均勻性、GC覆蓋度和變異準(zhǔn)確性方面均有可比性,且相較之下更具成本優(yōu)勢。


DNBSEQ-T7作為科技抗疫利器強力支援病毒研究,監(jiān)測病毒變異。疫情初期,華大智造前期緊急部署2臺DNBSEQ-T7運達武漢,用于應(yīng)急檢測病原。協(xié)助新冠肺炎防控以及病毒變異追蹤。


2020年3月,華大智造與瑞典卡羅琳卡醫(yī)學(xué)院(Karolinska Institutet,KI)宣布在瑞典首都斯德哥爾摩共建萬人級別新冠檢測多組學(xué)檢測實驗室。華大智造研制的超高通量基因測序儀DNBSEQ-T7先后運抵瑞典,用于支撐病毒研究。

 

倫敦帝國理工學(xué)院傳染病流行病研究中心,濰坊疾控中心等單位基于DNBSEQ-T7的基因組數(shù)據(jù)用于對濰坊市28例新冠病毒陽性樣本進行測序,基于數(shù)據(jù)分析建立了流行病學(xué)系統(tǒng)模型,對基因組流行病學(xué)的研究提供了地域依據(jù)。

(以上內(nèi)容部分摘自環(huán)球網(wǎng))



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