9月10日以來,福建省莆田市、泉州市、廈門市先后出現(xiàn)多例本土新冠病毒感染病例,29日福建本土病例實現(xiàn)零新增,這意味著當(dāng)?shù)匾咔橐呀?jīng)得到基本控制。10月7日21時起,廈門市中高風(fēng)險地區(qū)已實現(xiàn)“清零”。
另據(jù)《廈門日報》10月12日報道,截至10月10日24時,廈門市疾控中心新冠病毒核酸檢測已累計超87.5萬管。回顧本次廈門疫情,仿佛整個城市被按下了“快進(jìn)鍵”,在短短時間內(nèi)就實現(xiàn)了零新增。這一成果得益于當(dāng)?shù)毓残l(wèi)生體系工作人員的辛勞付出,同時也受益于此次抗疫中采用的一系列先進(jìn)的自動化設(shè)備和高通量基因測序儀。
華大智造DNBSEQ雙平臺聯(lián)合出擊
為病毒傳播鏈提供科學(xué)依據(jù)
在新冠病毒鑒定及診斷中,高通量測序不僅能提高陽性檢出率,還能進(jìn)行并發(fā)檢測,提供更多可能感染的病原信息。更為重要的是,它還可以對病毒序列進(jìn)行組裝,獲得病毒全長基因組信息,為追溯病毒來源、監(jiān)測病毒變異趨勢、探究致病機理提供研究基礎(chǔ)。
據(jù)《廈門日報》10月12日報道,當(dāng)?shù)卦谕瓿煞敝氐暮怂釞z測任務(wù)之余,還加班加點獨立開展了新冠病毒測序工作,對廈門境外輸入病例和本地疫情中的首發(fā)或早期病例做基因測序,迅速開展了病毒比對和傳播鏈判定。目前已檢測新冠病毒基因序列500多份,為動態(tài)檢測病毒變異情況,研究病毒變異對病原能檢測、調(diào)整防控政策提供了科學(xué)依據(jù)。
作為全球少數(shù)幾家擁有自主研發(fā)能力,并能量產(chǎn)臨床級基因測序儀的制造商之一,華大智造在此次廈門疫情中使用了DNBSEQ雙平臺,包括小巧靈活、性能強勁的高通量測序儀MGISEQ-200,以及另一款小型便攜式DNBSEQ測序儀,它們?nèi)鏉M足了當(dāng)?shù)夭煌康臏y序需求,為廈門疫情防控提供了核心工具支撐。
華大智造MGISEQ-200小巧靈活的桌面型基因測序儀在廈門疾控中心運行中
華大智造MGISEQ-200作為一款小巧、靈活的桌面型基因測序儀,已成為小型化高通量測序?qū)嶒炇业摹皹?biāo)配”。它不僅可以支持高低兩種通量的載片,還可搭載3-4種讀長,同時可支持單端/雙端測序,并實現(xiàn)從10Gb-150Gb全覆蓋的數(shù)據(jù)產(chǎn)出,完美適配病毒鑒定到溯源的不同測序方案。更重要的是,其測序質(zhì)量穩(wěn)定,可以為疫情防控提供可靠的數(shù)據(jù)支持。
MGISEQ-200以其靈活的特點,解決微生物測序應(yīng)用中的種種難題。從快速鑒定到病毒全基因組組裝再到病毒變異的溯源和進(jìn)化分析,疫情發(fā)生以來,MGISEQ-200走在疫情最前線,支援全國乃至全球疫情防控。此前,MGISEQ-200平臺助力山東省濟南市疾控中心破解了進(jìn)口冷鏈新冠病毒全基因組測序難題,還曾助力佛山市疾控中心成功搭建首個常態(tài)化市級測序技術(shù)平臺,幫助河北、廣東、黑龍江等多地疫情快速溯源。這些過往實戰(zhàn)都為廈門疫情防控提供了寶貴的經(jīng)驗。
除了MGISEQ-200之外,華大智造還快速部署了三臺小型便攜DNBSEQ測序儀至廈門疾控,這些儀器體積小、占地少、操作簡便,專為緊急現(xiàn)場測序打造,運送至實驗室后可快速完成部署開始測序工作。該儀器與ATOPlex平臺技術(shù)組成的新冠測序產(chǎn)品組合,可將新冠病毒測序溯源全流程壓縮至約14個小時。
廈門疾控中心采用的一站式平臺將新冠病毒測序溯源全流程壓縮至約14個小時
廈門疫情期間,華大智造DNBSEQ雙平臺聯(lián)合出擊,既保證了大批量樣本及時穩(wěn)定處理,又進(jìn)一步壓縮了個別關(guān)鍵樣品測序周期,為新冠測序分析、疫情防控決策提供了關(guān)鍵依據(jù)。