第十六屆國(guó)際基因組學(xué)大會(huì)(ICG-16)于10月25-31日在山東青島隆重舉辦。在今年ICG大會(huì)上,華大智造聚焦“組學(xué)領(lǐng)域的創(chuàng)新思路與工具”,對(duì)其核心業(yè)務(wù)基因測(cè)序儀進(jìn)行了全面的性能升級(jí)。
DNBSEQ-T7:正式推出高通量測(cè)序試
劑套裝V2.0,數(shù)據(jù)產(chǎn)出更高、更穩(wěn)定
基于日通量超高的測(cè)序儀DNBSEQ-T7,華大智造對(duì)其測(cè)序試劑進(jìn)行了重要升級(jí),正式推出高通量測(cè)序試劑套裝V2.0,在生化反應(yīng)和算法等方面進(jìn)行了優(yōu)化,錯(cuò)誤率和重復(fù)率進(jìn)一步降低,數(shù)據(jù)有效利用率更高,數(shù)據(jù)產(chǎn)出更穩(wěn)定,變異檢測(cè)精確度和靈敏度提升,旨在提供產(chǎn)量更高、質(zhì)量更好的數(shù)據(jù)產(chǎn)出。
華大智造對(duì)來(lái)自3家客戶121個(gè)Run的下機(jī)數(shù)據(jù)進(jìn)行了統(tǒng)計(jì),結(jié)果顯示:在不同實(shí)驗(yàn)室、不同樣本類型以及不同程度的復(fù)雜文庫(kù)的情況下,采用高通量測(cè)序試劑套裝V2.0,DNBSEQ-T7均能保有高穩(wěn)定性和高質(zhì)量數(shù)據(jù)的產(chǎn)出。該試劑盒現(xiàn)已全面投產(chǎn),即日起即可訂購(gòu)。
MGISEQ-2000:正式推出長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序
試劑盒(FCS,PE300),Q30>80%
在中高通量測(cè)序儀MGISEQ-2000上,華大智造推出了基于DNBSEQ平臺(tái)的首個(gè)PE300長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序試劑盒。該產(chǎn)品采用了最新的DNA納米球生成和加載技術(shù)——MLG技術(shù)(Make DNB、Load DNB and Grow),能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)于DNA納米球更加精準(zhǔn)的控制,增加拷貝數(shù)并增強(qiáng)信號(hào),支持更長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序和更高質(zhì)量的數(shù)據(jù)產(chǎn)出。
在組學(xué)研究領(lǐng)域,對(duì)于需要進(jìn)行基因組拼接的應(yīng)用,往往希望讀長(zhǎng)越長(zhǎng)越好,但讀長(zhǎng)越長(zhǎng)測(cè)序質(zhì)量越難把控。此次華大智造創(chuàng)新性地采用了一種全新的滾環(huán)擴(kuò)增和加載DNB(DNA Nano Ball,DNA納米球)的方式——MLG(Make DNB、Load DNB and Grow)。不同于以往DNB制備后直接加載到載片上進(jìn)行測(cè)序的方式,MLG會(huì)先進(jìn)行少量的滾環(huán)擴(kuò)增,形成較小的DNB(即Make DNB),并在其加載到載片上后繼續(xù)對(duì)其進(jìn)行滾環(huán)擴(kuò)增(Load DNB and Grow)。這一點(diǎn)有效確保了長(zhǎng)讀長(zhǎng)的DNB信號(hào)可以更強(qiáng)。除此之外,華大智造在此基礎(chǔ)上,對(duì)該試劑盒的試劑組分進(jìn)行了優(yōu)化和升級(jí),并采用指數(shù)孵育等措施,促進(jìn)生化反應(yīng)更充分,提高了反應(yīng)效率。目前,來(lái)自早期客戶236個(gè)文庫(kù)的下機(jī)數(shù)據(jù)顯示,基于MGISEQ-2000的長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序試劑盒(FCS,PE300),數(shù)據(jù)產(chǎn)出高達(dá)180-360Gb,Q30>80%,檢出結(jié)果平臺(tái)間高度一致。
PE300讀長(zhǎng)尤其適用于微生物16S/18S/ITS測(cè)序,特別是對(duì)于16S rRNA中的V3+V4區(qū)域,PE300讀長(zhǎng)不僅可以完整覆蓋V3+V4區(qū)域460bp的基因序列及建庫(kù)過(guò)程中融合的引物序列,還能通過(guò)雙端測(cè)序重疊的部分來(lái)進(jìn)行更好的拼接。基于MGISEQ-2000平臺(tái)的PE300讀長(zhǎng)上市,為廣大16S/18S/ITS測(cè)序用戶,以及相關(guān)的微生物功能基因研究提供了通量更大、數(shù)據(jù)質(zhì)量更優(yōu)的選擇。
另外,為了更好地適配多樣本靶向測(cè)序,華大智造正式開(kāi)放ATOPlex多重PCR定制化平臺(tái),以幫助用戶個(gè)性化開(kāi)發(fā)基于多重PCR技術(shù)的靶向測(cè)序建庫(kù)試劑盒,在微生物、農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域上都可以支持多樣本數(shù)據(jù)產(chǎn)出。
MGISEQ-200:正式推出BBS測(cè)序
功能,與中疾控傳染病所展開(kāi)科研攻關(guān)
在小通量的測(cè)序儀MGISEQ-200上,華大智造與中國(guó)疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所聯(lián)合開(kāi)展科研攻關(guān),針對(duì)一線用戶在傳染病防控中對(duì)快速測(cè)序和精準(zhǔn)測(cè)序的雙重需求,推出了多時(shí)點(diǎn)測(cè)序數(shù)據(jù)輸出及序列分析(簡(jiǎn)稱BBS技術(shù))。該技術(shù)能夠在測(cè)序過(guò)程中實(shí)現(xiàn)多時(shí)點(diǎn)抽取數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,同時(shí)提前啟動(dòng)序列分析,既能夠快速識(shí)別又能夠精準(zhǔn)溯源。
目前,該項(xiàng)技術(shù)已在雙方橫向課題項(xiàng)目中開(kāi)展第一階段的測(cè)試和驗(yàn)證,結(jié)果表明:這一技術(shù)分時(shí)點(diǎn)進(jìn)行測(cè)序數(shù)據(jù)輸出及分析,可在公共衛(wèi)生防控中更及時(shí)響應(yīng)病原微生物快速鑒定及精準(zhǔn)溯源。該技術(shù)將率先在MGISEQ-200上應(yīng)用,并將作為創(chuàng)新技術(shù)支持我國(guó)公共衛(wèi)生體系中的病原微生物基因組學(xué)分析。
結(jié) 語(yǔ)