10月中旬以來(lái),新一輪疫情再度來(lái)襲,全國(guó)多地出現(xiàn)了疫情反彈和零星病例,由于傳播速度快且處于北京冬奧會(huì)即將來(lái)臨之際,各級(jí)政府高度關(guān)注,疫情防控工作再次進(jìn)入緊張狀態(tài)。華大智造測(cè)序平臺(tái)也積極投身疫情防控工作中,成功助力多地監(jiān)測(cè)病毒變異工作。
11月6日,在呼和浩特市新冠肺炎疫情防控工作新聞發(fā)布會(huì)中,官方表示,呼和浩特市已于10月27日完成本次疫情3個(gè)確診病例樣本的病毒基因測(cè)序,結(jié)果顯示,本次新冠肺炎確診病例為21A—德?tīng)査局辍?/span>
本輪疫情發(fā)生以來(lái),呼和浩特市共報(bào)告3例本土新冠肺炎確診病例、1例疑似病例。10月31日,對(duì)報(bào)告疑似病例予以排除;11月4日,1例確診病例治愈出院?,F(xiàn)有2例本土確診病例,在內(nèi)蒙古自治區(qū)第四醫(yī)院接受治療,病情平穩(wěn)。
華大智造MGISEQ-2000高通量基因測(cè)序儀
在本輪疫情防控中,呼和浩特市疾控中心使用了華大智造MGISEQ-2000高通量基因測(cè)序儀。作為一款高準(zhǔn)確率、低成本的全能型桌面測(cè)序儀,其高效靈活的特性為呼和浩特市疫情實(shí)現(xiàn)快速溯源和防控提供了有力支撐。
10月24日,在四川省自貢市疾控中心實(shí)驗(yàn)室,微生物檢驗(yàn)所王斌副所長(zhǎng)一邊操作設(shè)備,一邊通過(guò)顯示器展示由堿基組成的全基因序列,“這個(gè)堿基序列就是新冠病毒的堿基序列——也是此次我市富順確診病例病毒的‘原形’,將其與數(shù)據(jù)庫(kù)中的其他新冠病毒堿基序列比對(duì),就能分析出該病毒與哪里的病毒同源、是否發(fā)生了變異……”
在華大智造測(cè)序平臺(tái)的支持下,自貢疾控實(shí)驗(yàn)室繼榮縣復(fù)陽(yáng)患者后,再一次成功檢測(cè)出富順縣確診病例“德?tīng)査蓖蛔冎?。這標(biāo)志著自貢市成為除四川省疾控、成都疾控外,省內(nèi)能獨(dú)立通過(guò)新冠病毒基因測(cè)序進(jìn)行病毒溯源的地市級(jí)疾控中心。
華大智造MGISEQ-200高通量基因測(cè)序儀
華大智造MGISP-100高通量自動(dòng)化樣本制備系統(tǒng)
據(jù)了解,在10月23日晚,自貢市富順發(fā)生一例輸入性可疑新冠陽(yáng)性病例后,中心李群主任第一時(shí)間作出指示,出動(dòng)現(xiàn)場(chǎng)應(yīng)急檢測(cè)車(chē)、調(diào)派核酸檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室人員趕赴富順,開(kāi)展疫情現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)及復(fù)核工作,最終在凌晨確定了該病例為新冠核酸陽(yáng)性無(wú)癥狀感染者。同時(shí)立即啟動(dòng)了測(cè)序工作,25日凌晨1點(diǎn)測(cè)序結(jié)果分析為德?tīng)査―elta)毒株,與省疾控中心測(cè)序結(jié)果一致,經(jīng)中國(guó)疾控中心比對(duì)分析,自貢市感染者基因組完整度高(96.8%),為“德?tīng)査蓖蛔冎辏c內(nèi)蒙古額濟(jì)納旗疫情關(guān)聯(lián)其他病例毒株高度同源,成功溯源為疫情處置提供了精準(zhǔn)的科學(xué)依據(jù)。
近期,在阿拉善盟疾控中心生物安全二級(jí)實(shí)驗(yàn)室,專(zhuān)業(yè)技術(shù)人員在華大智造工程師的指導(dǎo)下,開(kāi)展了第一例新冠肺炎病例陽(yáng)性標(biāo)本基因測(cè)序工作,經(jīng)過(guò)多日實(shí)驗(yàn),測(cè)序結(jié)果為德?tīng)査儺愔辍?/span>此次阿盟疾控中心生物安全二級(jí)實(shí)驗(yàn)室啟用華大智造高通量測(cè)序技術(shù),為阿左旗和額濟(jì)納旗新型冠狀病毒疫情病原體的鑒定和溯源,以及對(duì)疫情防控工作等提供了強(qiáng)大的技術(shù)支撐。下一步,阿盟疾控中心將對(duì)額濟(jì)納旗新冠肺炎病例和環(huán)境陽(yáng)性標(biāo)本進(jìn)行測(cè)序工作。
截止到11月8日12點(diǎn),共完成122例新冠樣品的溯源工作,詳實(shí)且一致的測(cè)序結(jié)果再次支持了本輪阿拉善相關(guān)疫情的源頭來(lái)自于中蒙邊界策克口岸這一科學(xué)論斷。
病毒基因測(cè)序能在第一時(shí)間獲取病毒的基因組序列信息,已成為研究疾病暴發(fā)、追蹤病毒變異的重要工具。通過(guò)檢測(cè)新冠病毒的全基因組序列,再將這個(gè)序列通過(guò)軟件分析與數(shù)據(jù)庫(kù)中的序列進(jìn)行比對(duì),可以準(zhǔn)確地判斷其地域來(lái)源及這些病例是否來(lái)自同一傳播鏈或傳染源。
基因測(cè)序需要經(jīng)過(guò)核酸提取、目的基因的捕獲、擴(kuò)增、純化、建庫(kù)等步驟,這些看似簡(jiǎn)單的流程,卻需要十分精細(xì)的操作和計(jì)算。從新冠病毒爆發(fā)以來(lái),在抗擊新冠疫情的戰(zhàn)場(chǎng)上,先進(jìn)的病毒基因測(cè)序技術(shù)一直沖在最前線,為疫情防控提供了重要的工具支撐。
華大智造作為全球范圍內(nèi)少數(shù)幾家具有自主研發(fā)能力并量產(chǎn)臨床級(jí)測(cè)序儀的制造商之一,自疫情發(fā)生以來(lái),一直依托其測(cè)序平臺(tái)對(duì)病毒進(jìn)行基因測(cè)序,先后為廈門(mén)、瑞麗、???、濟(jì)南、石家莊等近百家疾控中心和相關(guān)機(jī)構(gòu)提供工具支撐,為其疫情防控工作提供有效依據(jù),全面助力各地新冠病毒鑒定與溯源工作。