近日,在第16屆國際基因組學(xué)大會上,華大智造ATOPlex多重PCR定制化平臺正式發(fā)布?;谧灾餮邪l(fā)的單管超高重PCR技術(shù),華大智造針對目標(biāo)基因序列推出的ATOPlex平臺可提供個性化的多重PCR引物池,以及包括對應(yīng)的擴(kuò)增體系在內(nèi)的一整套靶向建庫試劑。
基于ATOPlex平臺的定制化方案,能夠滿足粗樣本(如血斑裂解液)直接進(jìn)行特異性擴(kuò)增目標(biāo)基因的需求,支持檢測點突變、小的插入缺失、拷貝數(shù)變異、STR和固定Fusion,適用于分子育種、遺傳病研究、公共衛(wèi)生等多種方向的應(yīng)用。

優(yōu)勢1 單管超高重PCR技術(shù),簡化實驗流程
超高重PCR技術(shù)能同時兼容上萬重的引物對,但隨著檢測重數(shù)的增加,引物二聚體或多聚體形成的可能也會大幅上升。引物二聚體由引物分子相互雜交形成,在超高重PCR中,極高濃度的引物對同時擴(kuò)增大大增加了引物二聚體甚至多聚體形成的機(jī)會,從而導(dǎo)致二聚體和非特性擴(kuò)增的出現(xiàn),干擾靶向基因的擴(kuò)增。當(dāng)PCR體系中二聚體和非特異性擴(kuò)增占據(jù)主導(dǎo)時,目標(biāo)基因的擴(kuò)增就會失敗,從而造成假陽性或假陰性,影響檢測的準(zhǔn)確性。
為克服這一問題,絕大多數(shù)超高重PCR技術(shù)都不得不將不同的引物對和模板分散于相對獨立的空間,在不同的反應(yīng)管中進(jìn)行擴(kuò)增。這增加了實驗操作的復(fù)雜性,提高了污染的風(fēng)險及人工轉(zhuǎn)管失誤的概率。華大智造ATOPlex平臺采用自主研發(fā)的單管超高重PCR技術(shù),通過獨特的引物設(shè)計方法能夠有效減少引物二聚體和非特異性靶標(biāo)的生成,讓實驗結(jié)果更可靠;該技術(shù)可實現(xiàn)在同一個反應(yīng)管中同時完成對微量樣本近2萬個靶標(biāo)的擴(kuò)增,整個擴(kuò)增過程僅需2步PCR,無需轉(zhuǎn)管,讓實驗操作更簡單;最后,華大智造ATOPlex技術(shù)能夠兼容復(fù)雜的擴(kuò)增體系,支持直接用裂解產(chǎn)物進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增,大大拓展了檢測樣本的范圍。因此,基于華大智造ATOPlex平臺進(jìn)行開發(fā)的定制化建庫試劑盒,具有性能佳、操作簡單、適應(yīng)性廣的優(yōu)勢。
優(yōu)勢2 核心算法支持引物在線設(shè)計
華大智造ATOPlex平臺提供自助式的引物在線設(shè)計(ATOPlex.mgi-tech.com),可以更好地滿足專業(yè)人員在靶向測序過程中對建庫試劑盒的多元化需求和個性化需求:您只需要登錄ATOPlex平臺在線頁面,根據(jù)頁面提示就可以完成定制化需求的提交,10-20000x的Panel定制結(jié)果可以在線收到反饋,而且還可以直接下載該定制化的引物序列。在這個過程中,不需要專業(yè)的引物開發(fā)背景和技術(shù)門檻,極大簡化了多重引物的定制流程。
與此同時,針對復(fù)雜Panel的定制,ATOPlex平臺還會提供線下技術(shù)顧問和輔導(dǎo)。通過線上+線下的需求輸入雙模式,在ATOPlex平臺,引物設(shè)計和定制化開發(fā)的工作,可以說干就干。
優(yōu)勢3 涵蓋三大靶向捕獲方向
針對DNA/RNA和甲基化靶向捕獲三個方向,華大智造ATOPlex平臺現(xiàn)已全面覆蓋。不同于競品的局限性,華大智造ATOPlex平臺可以幫您建立多重PCR技術(shù)平臺,并且提供專業(yè)的技術(shù)指導(dǎo)服務(wù),目前已交付的“客定”版本有石斑魚選育Panel、個體特征檢測Panel、結(jié)核分枝桿菌檢測Panel、動物類多病原共檢Panel等等。
結(jié)語
隨著基因?qū)用娴纳钊胙芯吭絹碓截S富多樣,應(yīng)用領(lǐng)域也愈發(fā)廣泛,超高重PCR技術(shù)以其低成本高靈敏度的優(yōu)勢得到了越來越多科研人員的青睞。針對多種樣本的靈活性和特異性測序,等你在ATOPlex平臺一一開啟!

