近期,南非最新發(fā)現(xiàn)的超強(qiáng)新冠病毒變異株Omicron(B.1.1.529)在全球迅速蔓延,為疫情防控監(jiān)測系統(tǒng)帶來了巨大挑戰(zhàn)。11 月 29 日 16 時(shí),瑞典斯科納地區(qū)報(bào)告一例新冠確診病例為Omicron變異株。該變異株是在一周多前從一名居住在斯科納地區(qū)的人身上采集的樣本中檢測到的,該公民一周以前剛從南非回國。
在此背景下,瑞典公共衛(wèi)生署合作的卡羅林斯卡醫(yī)學(xué)院國家疫情中心使用了華大智造ATOPlex建庫試劑盒和MGISP高通量自動(dòng)化建庫平臺(tái)在第一時(shí)間發(fā)現(xiàn)了Omicron變異株,100X基因組覆蓋度超過98%。
ATOPlex平臺(tái)助力瑞典第一時(shí)間發(fā)現(xiàn)Omicron變異株
據(jù)了解,南非發(fā)現(xiàn)的新冠病毒變異株Omicron(B.1.1.529)含有大量突變,很可能具有更強(qiáng)的傳染性和免疫逃逸性。世衛(wèi)組織建議各國采取多項(xiàng)行動(dòng),包括加強(qiáng)病例監(jiān)測和測序,在公開可用的數(shù)據(jù)庫(例如 GISAID)上共享基因組序列,以更好地了解Omicron是否具有不同的傳播或疾病特征,或是否影響疫苗、治療、診斷或公共衛(wèi)生和社會(huì)措施的有效性。
針對此次新發(fā)現(xiàn)的變異毒株,華大智造以超高重PCR技術(shù)為核心的ATOPlex平臺(tái)開發(fā)的建庫試劑盒助力瑞典第一時(shí)間發(fā)現(xiàn)Omicron變異株。同時(shí),它還能夠獲取毒株全基因組序列,為新型毒株監(jiān)測提供強(qiáng)有力的工具支撐。
瑞典新增一例新冠確診病例為Omicron變異毒株(圖片來源:“最瑞典”微信公眾號(hào))
通過數(shù)據(jù)分析結(jié)果證實(shí),ATOPlex平臺(tái)開發(fā)的建庫試劑盒(高通量測序法V1.1/V2.0/V3.0)針對Omicron變異株均可以進(jìn)行有效的變異和溯源監(jiān)測。華大智造一直在對新型變異株進(jìn)行分析,持續(xù)開展對突變毒株的能力評估,保證ATOPlex試劑盒性能,助力全球疫情監(jiān)測!
此外,ATOPlex平臺(tái)還涵蓋了DNA、RNA和DNA甲基化方向,可以滿足科研、醫(yī)藥、食品安全、農(nóng)業(yè)、DTC等相關(guān)領(lǐng)域的個(gè)性化基因檢測產(chǎn)品定制需求。在微生物研究領(lǐng)域,ATOPlex技術(shù)不僅可以有效對Omicron和其他新型毒株進(jìn)行分型和監(jiān)測,還能針對其他威脅人類健康的病原微生物提供個(gè)性化的監(jiān)測方案,滿足公共衛(wèi)生領(lǐng)域?qū)τ诓煌⑸锏臋z測和監(jiān)測需求。