7月15日中午，市委市政府向華大智造發(fā)出對(duì)核酸檢測(cè)陽(yáng)性樣本進(jìn)行新冠溯源分析的邀請(qǐng)。受領(lǐng)任務(wù)后，華大智造緊急調(diào)運(yùn)最新款DNBSEQ-E5測(cè)序儀、新冠溯源ATOPlex建庫(kù)試劑和技術(shù)支持人員馳援益陽(yáng)市疾控中心。

基因測(cè)序設(shè)備于7月15日夜間運(yùn)抵市疾控中心，技術(shù)支持人員現(xiàn)場(chǎng)裝機(jī)、連夜奮戰(zhàn)，市疾控中心檢測(cè)檢驗(yàn)人員于當(dāng)日22時(shí)開(kāi)始對(duì)資陽(yáng)區(qū)疾控中心在7月15日早晨采集的樣本進(jìn)行處理、建庫(kù)、上機(jī)測(cè)序，7月16日11時(shí)許獲得測(cè)序結(jié)果。病毒序列全長(zhǎng)覆蓋率99.5%，確定分型為BA.2.2毒株。

圖1：益陽(yáng)市疾控裝機(jī)的DNBSEQ-E5首次新冠病毒測(cè)序過(guò)程

此前，國(guó)家發(fā)改委等四部門聯(lián)合印發(fā)了《“十四五”優(yōu)質(zhì)高效醫(yī)療衛(wèi)生服務(wù)體系建設(shè)實(shí)施方案》，方案中指出，國(guó)家和重點(diǎn)區(qū)域疾病預(yù)防控制機(jī)構(gòu)需具備新發(fā)傳染病病原體、健康危害因素“一錘定音”檢測(cè)能力和重特大公共衛(wèi)生事件處置能力。

此次益陽(yáng)市疾控中心在華大智造基因測(cè)序設(shè)備加持下，快速準(zhǔn)確完成新冠溯源分析，標(biāo)志著益陽(yáng)市疾控中心初步具備了對(duì)新冠病毒進(jìn)行基因測(cè)序的能力，為益陽(yáng)市新冠肺炎疫情以及其他傳染病的病原體鑒定溯源、應(yīng)急處置提供了強(qiáng)大的技術(shù)支撐。

華大智造基于DNBSEQ技術(shù)的新冠病毒靶向測(cè)序產(chǎn)品組合，已幫助全國(guó)十余省近百家疾控中心進(jìn)行新冠溯源病毒，為疫情防控工作提供有效依據(jù)，全面助力各地新冠病毒鑒定與溯源工作。而采用了微流控測(cè)序載片和集成信號(hào)采集模塊的DNBSEQ-E5快速測(cè)序儀，攜同ATOPlex RNA多重PCR建庫(kù)試劑盒套裝V3.1緊急響應(yīng)，已連續(xù)部署至超過(guò)10個(gè)新冠疫情熱點(diǎn)地區(qū)，測(cè)序結(jié)果表現(xiàn)優(yōu)異，高效完成新冠溯源。

圖2：華大智造DNBSEQ-E5助力多地新冠溯源工作

目前，基于全新優(yōu)化加速的DNBSEQ-E5及其快速測(cè)序試劑進(jìn)行SE100測(cè)序，最快可在3.5小時(shí)內(nèi)完成從DNB加載至FASTQ文件輸出的全流程。測(cè)序完成10分鐘內(nèi)輸出新冠病毒變異位點(diǎn)基因注釋、變異支系鑒別、全長(zhǎng)序列，支持移動(dòng)部署，能夠即時(shí)響應(yīng)特殊樣本的緊急測(cè)序需求，適用于一線海關(guān)、疾控等機(jī)構(gòu)。