2022年7月12日,由深圳華大生命科學(xué)研究院Lars研究所羅永倫教授和丹麥奧胡斯大學(xué)林琳教授聯(lián)合國內(nèi)外多個研究團隊,于近日發(fā)表在Nature Communications(影響因子17.694)的首個家豬組織器官單細胞轉(zhuǎn)錄圖譜論文“Endothelial cell heterogeneity and microglia regulons revealed by a pig cell landscape at single-cell level”作為Editors’ Highlights入選《自然通訊》雜志 “From molecules and cells to organisms” 專題。
圖1《自然通訊》近期50佳亮點論文部分截圖
家豬(Sus scrofa domesticus)是生物醫(yī)藥研究、新藥開發(fā)、研究人類復(fù)雜疾病機理的的關(guān)鍵模式大動物之一。同小型模式動物相比,豬大腦結(jié)構(gòu)與人類更加接近,因此也是被認為研究人類大腦和退行性神經(jīng)疾病的重要大動物模型。由于豬器官在大小、結(jié)構(gòu)、生理功能、和遺傳學(xué)等方面都與人類器官非常接近,也是被公認為解決器官緊缺醫(yī)學(xué)問題的最佳異種器官移植供體[1,2]。通過基因編輯和克隆技術(shù),疾病模型豬已經(jīng)被成功應(yīng)用于杜氏肌營養(yǎng)不良癥(Duchenne muscular dystrophy)、亨廷頓?。℉untington’s disease)、糖尿?。―iabetes)等[3-5]。
圖2 研究技術(shù)路線
01 研究亮點:家豬多器官組織單細胞轉(zhuǎn)錄組圖譜

圖3 家豬單細胞轉(zhuǎn)錄組圖譜
(圖源:WangF,et al., Nat Commun, 2022)
02 研究亮點:TGF-β2信號通路在EndMT轉(zhuǎn)分化中起關(guān)鍵作用

圖4 豬組織中內(nèi)皮細胞的單細胞轉(zhuǎn)錄組分析
(圖源:WangF,et al., Nat Commun, 2022)
03 研究亮點:跨物種小膠質(zhì)細胞單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)對比

圖5基于單細胞轉(zhuǎn)錄分析大腦小膠質(zhì)細胞在進化過程中的保守性轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
(圖源:WangF,et al., Nat Commun, 2022)
高通量測序平臺助力單細胞組學(xué)
進入規(guī)?;芯繒r代
隨著單細胞測序技術(shù)的發(fā)展,單細胞組學(xué)研究也已經(jīng)進入了超高通量、超大規(guī)模的研究階段。華大智造自主可控的國產(chǎn)化單細胞建庫平臺DNBelab C4搭配DNBSEQ-T7高通量測序平臺打破了單細胞研究門檻高的瓶頸,提供了穩(wěn)定、經(jīng)濟、便攜的一站式產(chǎn)品組合(圖6)。