高通量測序技術(shù)在發(fā)現(xiàn)新病原、識別已知病原和鑒定未知病原等方面發(fā)揮了關(guān)鍵的作用,現(xiàn)已成為常態(tài)化疫情防控的必要手段之一。根據(jù)《廣東省疾病預防控制中心關(guān)于進一步做好全省疾控機構(gòu)新冠病毒基因測序的通知》精神要求,為加強病原檢測及溯源能力建設(shè),華大智造聯(lián)合佛山市疾病預防控制中心高通量測序技術(shù)創(chuàng)新應用聯(lián)合研究中心發(fā)起的“病原靶向測序新方案-ADE自動化高通量測序技術(shù)培訓班”于2022年9月7日-8日在廣東佛山順利舉行!
來自廣州、湛江、肇慶、潮州、河源、云浮等地疾病預防控制中心的10余名技術(shù)人員齊聚禪城,學習新技術(shù)、新知識、新方法,提高自身理論和專業(yè)水平。華大智造作為聯(lián)合研究中心共建單位全程提供技術(shù)支持。
理論培訓:ADE新方案彌合基層測序
能力建設(shè)“最后1公里”
佛山市疾病預防控制中心梁景濤老師闡述了舉辦此次培訓的初衷:“佛山市疾病預防控制中心在2020年5月便具備了自主測序能力,并依托中心實驗室成立全國首個公共衛(wèi)生領(lǐng)域‘高通量測序技術(shù)創(chuàng)新應用聯(lián)合研究中心’,為測序能力建設(shè)和人才培養(yǎng)提供平臺支撐。但是,實驗操作時間長,建庫流程和儀器維護繁瑣等問題成為了阻礙基層測序能力建設(shè)的‘最后1公里’。希望通過此次培訓以新技術(shù)、新知識的講解討論,為這一問題的解決提供新方法、新思路!”
9月7日全天的理論培訓涵蓋病原測序應用場景、ADE自動化高通量測序產(chǎn)品組合以及病原生信分析策略的詳細介紹。微生物高通量測序通常采用宏基因組/轉(zhuǎn)錄組測序、靶向測序、全基因組測序三種策略,廣泛應用于感染性疾病診斷、公共衛(wèi)生、腸道微生物、食品安全、動物疫病和環(huán)境健康等領(lǐng)域。
華大智造ADE自動化高通量測序產(chǎn)品組合是ATOPlex多重PCR建庫定制平臺、DNBelab-D4數(shù)字化樣本制備系統(tǒng)和DNBSEQ-E系列測序儀三款產(chǎn)品的組合,突破性地解決了測序建庫步驟繁瑣、TAT時間長的痛點,一體化試劑盒即用即拋避免了繁瑣的儀器維護。
基于ADE自動化高通量測序產(chǎn)品組合最快可在12小時*左右完成新冠病毒溯源分型,應對快速發(fā)現(xiàn)、準確變異跟蹤的疫情防控需求。
實操體驗:
上手無門檻開箱即用,高度自動化解放雙手和時間
9月8日為實操體驗培訓,參會學員現(xiàn)場操作,全流程體驗華大智造ADE自動化高通量測序產(chǎn)品組合。
DNBelab-D4與DNBSEQ-E系列大小相當30厘米見方,插電即可搭配使用。DNBelab-D4開創(chuàng)性地實現(xiàn)“一卡建庫,集成定量”,在一張樣本制備卡上即可完成DNA到DNB的全流程制備過程,并且系統(tǒng)集成自動定量功能,可在DNB制備完成后進行自動定量,無需手工定量。參會學員上午進行了DNBelab-D4實操體驗,從核酸樣本到測序文庫構(gòu)建完成,只有20分鐘左右的手工操作,當天16時左右4個樣本的文庫定量結(jié)果自動出現(xiàn)在DNBelab-D4的屏幕上,全部成功!
DNBSEQ-E系列基因測序儀采用獨有的自發(fā)光測序技術(shù),可實現(xiàn)堿基序列的快速讀取,最大支持25M數(shù)據(jù)通量,一體化試劑盒即用即拋,內(nèi)置集成生信分析流程,從上機測序到報告輸出一鍵直達。
華大智造ADE自動化高通量測序產(chǎn)品組合極大降低了測序技術(shù)門檻,解放操作人員的雙手和時間,減少空間的占用,解決移動部署的問題,能夠真正助力更多疾病預防控制中心具備本地化“一錘定音”的病原檢測、溯源能力。
參訓反饋“以往的建庫方案都比較繁瑣且容易出錯,這次培訓使用的DNBelab-D4相比起來實驗流程簡單很多,感謝佛山市疾控中心同仁組織的這次培訓?!?/span>
——廣州市疾病預防控制中心 侯水平
“參加這次培訓受益匪淺,最大的驚喜是DNBSEQ-E5竟然不需要清洗維護,這相對于MGISEQ-200的流程確實簡單了很多?!?
——肇慶市疾病預防控制中心 譚翰清
關(guān)于“高通量測序技術(shù)創(chuàng)新應用聯(lián)合研究中心”
2020年8月6日,佛山市疾病預防控制中心與深圳華大智造科技股份有限公司簽訂合作備忘錄,依托本中心成立全國首個公共衛(wèi)生領(lǐng)域“高通量測序技術(shù)創(chuàng)新應用聯(lián)合研究中心”。首個公共衛(wèi)生領(lǐng)域創(chuàng)新應用聯(lián)合研究中心落地佛山疾控
*因操作熟練程度和樣本量不同,實際完成時間可能會有差異。