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上新 | 提速10小時(shí)?MGISEQ-2000升級(jí)大揭秘

時(shí)間:2022-08-05作者:華大智造閱讀數(shù):7488分享

近日,華大智造對(duì)旗下中高通量基因測(cè)序儀MGISEQ-2000進(jìn)行了全面升級(jí),以提供更穩(wěn)定的性能和更佳的使用體驗(yàn)。作為一款全能型桌面測(cè)序儀,MGISEQ-2000能夠?yàn)橛脩籼峁┤?、靈活、高效的測(cè)序選擇,是大中型高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)室的優(yōu)選機(jī)型。


MGISEQ-2000自發(fā)布以來,已經(jīng)廣泛應(yīng)用于科學(xué)研究、疾病防控、環(huán)境、農(nóng)業(yè)等多種領(lǐng)域,累計(jì)發(fā)表文章560余篇,助力科研領(lǐng)域高通量測(cè)序技術(shù)的全面普及。華大智造深耕生命科學(xué)工具研究和平臺(tái)建設(shè),近期對(duì)MGISEQ-2000 的控制軟件、算法軟件及配套腳本進(jìn)行了升級(jí),給客戶帶來更快速,更簡單,更靈活的測(cè)序體驗(yàn)!


更快速大載片提速20%


PE150測(cè)序模式下,MGISEQ-2000運(yùn)行2張F(tuán)CL載片可產(chǎn)生>1 Tb堿基數(shù)據(jù),這個(gè)夏季,MGISEQ-2000重磅升級(jí),搭配新版本測(cè)序試劑即可提速!在保質(zhì)保量的基礎(chǔ)上FCL 載片PE100的測(cè)序時(shí)間*從48h縮短至38h,F(xiàn)CL 載片PE150則從原來的66h縮短至56h,分別實(shí)現(xiàn)了20%左右的提速。


圖1  FCL提速(PE100和PE150)

注:運(yùn)行時(shí)間根據(jù)雙載片進(jìn)行統(tǒng)計(jì),包括:樣本加載、測(cè)序和寫FastQ時(shí)間


更簡單堿基不再需要如此“Balance”


通過算法優(yōu)化,MGISEQ-2000對(duì)堿基不平衡文庫更加友好,即使單個(gè)barcode也能實(shí)現(xiàn)很好的拆分。如下圖2所示,采用NA12878樣本,進(jìn)行PCR-Free WGS建庫,文庫在升級(jí)后的MGISEQ-2000上進(jìn)行測(cè)序,數(shù)據(jù)顯示單個(gè)barcode樣本和兩個(gè)barcode樣本的SplitRate均達(dá)到98%以上,滿足少數(shù)樣本的靈活測(cè)序和拆分。


圖2 MGISEQ-2000升級(jí)前后SplitRate(%)對(duì)比


甲基化文庫是典型的不平衡文庫,測(cè)序時(shí)為了實(shí)現(xiàn)更準(zhǔn)確的堿基信號(hào)識(shí)別往往需要添加一定比例的平衡文庫進(jìn)行堿基平衡。MGISEQ-2000升級(jí)后,在不添加平衡文庫的基礎(chǔ)上進(jìn)行WGBS測(cè)序,拆分率可達(dá)96%,相較升級(jí)前(60.39%)提升了將近60%,詳見下圖3;同時(shí),對(duì)比分析了添加25%平衡文庫和不添加平衡文庫的測(cè)序表現(xiàn)情況,可以看出是否添加平衡文庫對(duì)MGISEQ-2000測(cè)序產(chǎn)出的數(shù)據(jù)量沒有顯著影響(圖4)。


圖3  MGISEQ-2000升級(jí)前后甲基化文庫(不加平衡文庫)的SplitRate(%)對(duì)比


\圖4 MGISEQ-2000升級(jí)后甲基化文庫(不同比例平衡文庫)的數(shù)據(jù)量對(duì)比


更靈活雙模測(cè)序,隨時(shí)上機(jī)


MGISEQ-2000搭載雙載臺(tái),每次運(yùn)行支持1-2張載片上機(jī),升級(jí)后更可實(shí)現(xiàn)雙模測(cè)序*——即AB邊單獨(dú)測(cè)序,間隔時(shí)間隨意,在測(cè)序中途亦可添加第2張載片變?yōu)殡p載片運(yùn)行模式;雙載片獨(dú)立運(yùn)行,測(cè)序數(shù)據(jù)獨(dú)立下機(jī),進(jìn)一步縮短TAT(turn around time),使測(cè)序無需等待,只等“樣”來,隨來隨測(cè),一臺(tái)儀器可當(dāng)“兩臺(tái)”使用,提高測(cè)序儀的使用效率。


圖5 單雙載片測(cè)序模式切換示意圖

注:目前雙模功能僅針對(duì)RUO 儀器(MGISEQ-2000RS)開放,不適用于IVD 儀器(MGISEQ-2000)


預(yù)告關(guān)于此次升級(jí),如有任何問題可聯(lián)系當(dāng)?shù)劁N售或撥打4000-966-988客服熱線!


此外,華大智造PE300快速測(cè)序試劑套裝即將上市,升級(jí)后的MGISEQ-2000搭配PE300快速測(cè)序試劑套裝可用于微生物16S/18S/ITS測(cè)序。


更多精彩,敬請(qǐng)期待!

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