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DNBSEQ-G99如何全力釋放你的測(cè)序速度?深度解讀中小通量測(cè)序儀中的“速度王者”

時(shí)間:2022-09-20作者:華大智造閱讀數(shù):8206分享

近日,華大智造發(fā)布了最新款的中小通量基因測(cè)序儀DNBSEQ-G99。此次推出的DNBSEQ-G99又一次進(jìn)行了全方位的突破性嘗試,是全球同等通量測(cè)序儀中速度最快的機(jī)型之一,特別適用于靶向基因測(cè)序和小型基因組測(cè)序,數(shù)據(jù)產(chǎn)出速度快、質(zhì)量高。與此同時(shí),DNBSEQ-G99平臺(tái)的性能優(yōu)勢(shì)也引發(fā)了業(yè)內(nèi)的廣泛關(guān)注,為了讓大家能夠更深入地了解G99,華大智造特別整理了G99最值得關(guān)注的9個(gè)熱點(diǎn)話(huà)題,讓我們一探究竟!




Q1:G99測(cè)序速度究竟有多快?


在中小通量機(jī)型中,G99是唯一一款具備雙載片測(cè)序平臺(tái)的機(jī)型,這使得G99可以在一天之內(nèi)滿(mǎn)跑4張測(cè)序載片、兩輪PE150,實(shí)測(cè)通量甚至最高可以達(dá)到99Gb,所以命名G99。通常來(lái)講,G99可在12小時(shí)內(nèi)完成PE150測(cè)序流程,從上機(jī)測(cè)序到下機(jī)數(shù)據(jù)只需半天時(shí)間。與此同時(shí),G99支持多時(shí)點(diǎn)數(shù)據(jù)輸出,最快可在測(cè)序開(kāi)始后的2.5小時(shí)內(nèi)獲得第一批下機(jī)數(shù)據(jù)(SE35),是全球目前中小通量測(cè)序儀中速度最快的機(jī)型之一。


Q2:G99為何如此快?


DNBSEQ-G99通過(guò)對(duì)載片、生化、流體、光學(xué)、溫控等多個(gè)核心系統(tǒng)進(jìn)行全面優(yōu)化,實(shí)現(xiàn)了對(duì)測(cè)序效率、質(zhì)量和交付能力的極致提升。圍繞“DNBSEQ 測(cè)序技術(shù)”、“規(guī)則陣列芯片技術(shù)”、“測(cè)序儀光機(jī)電系統(tǒng)技術(shù)” 這三大源頭性核心技術(shù),華大智造G99平臺(tái)的技術(shù)創(chuàng)新點(diǎn)的具體體現(xiàn)是:


首先,在DNBSEQ測(cè)序技術(shù)方面,G99通過(guò)試劑優(yōu)化首次達(dá)到了10s極速熒光反應(yīng),同時(shí)生化孵育進(jìn)程由分鐘級(jí)跨入秒級(jí),全面降低單循環(huán)的測(cè)序時(shí)間;


其次,在規(guī)則陣列芯片技術(shù)方面,G99的測(cè)序載片首次采用了三角形矩陣式信號(hào)位點(diǎn),信號(hào)密度提升68%,在更小面積的載片上實(shí)現(xiàn)了更高密度的數(shù)據(jù)產(chǎn)出;


最后,在光機(jī)電系統(tǒng)技術(shù)方面,G99通過(guò)對(duì)溫控系統(tǒng)的升降溫算法進(jìn)行不斷改進(jìn),最終實(shí)現(xiàn)升降溫速率大于7℃/s,甚至比PCR儀還要快2倍;與此同時(shí),G99配備了華大智造自研的超高分辨率物鏡,突破了光學(xué)衍射極限,使得信號(hào)捕捉效率提升,縮短了單位面積的載片拍照時(shí)間,從而使得測(cè)序速度更快。


Q3:G99為何如此簡(jiǎn)單?


DNBSEQ-G99配備了超簡(jiǎn)易的卡式測(cè)序載片和一體化的測(cè)序試劑盒,上機(jī)實(shí)驗(yàn)操作簡(jiǎn)單,無(wú)需手工配制試劑,一步按壓即可完成測(cè)序試劑的配制。此外,通過(guò)生信計(jì)算的一體化集成,G99可實(shí)現(xiàn)對(duì)原始下機(jī)數(shù)據(jù)的自動(dòng)分析和結(jié)果輸出,同時(shí)支持測(cè)序數(shù)據(jù)的本地化產(chǎn)出,安全有保障。與此同時(shí),DNBSEQ-G99提供行之有效的數(shù)據(jù)安全保護(hù)。


Q4:G99為何如此靈活?


DNBSEQ-G99配備雙載片測(cè)序平臺(tái),且雙載片運(yùn)行流程相互獨(dú)立,能夠讓用戶(hù)在一臺(tái)測(cè)序儀上實(shí)現(xiàn)靈活的數(shù)據(jù)產(chǎn)出,支持單載片上機(jī)、雙載片同時(shí)上機(jī)、雙載片滾動(dòng)上機(jī),以及混合讀長(zhǎng)的雙載片混動(dòng)上機(jī)測(cè)序等多種測(cè)序模式,能夠讓測(cè)序?qū)嶒?yàn)人員可以根據(jù)樣本數(shù)量和到樣情況,通過(guò)調(diào)整上機(jī)運(yùn)行的載片個(gè)數(shù)和測(cè)序策略,靈活掌控自己的工作節(jié)奏。


Q5:G99測(cè)序的數(shù)據(jù)質(zhì)量如何?


G99不僅擁有出色的測(cè)序速度,在數(shù)據(jù)質(zhì)量方面的高準(zhǔn)確性和高可靠性同樣出色。根據(jù)華大智造的早期內(nèi)測(cè)數(shù)據(jù)顯示:在12臺(tái)G99上對(duì)92個(gè)標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行了測(cè)試,下機(jī)數(shù)據(jù)質(zhì)量Q30≥90%,數(shù)據(jù)產(chǎn)量>80Mb/載片。通過(guò)對(duì)腫瘤Panel檢測(cè)、未知病原體測(cè)序、小型基因組測(cè)序和甲基化測(cè)序等早期客戶(hù)試用結(jié)果的評(píng)價(jià)來(lái)看:96%以上的下機(jī)數(shù)據(jù)質(zhì)量Q30≥85%,數(shù)據(jù)產(chǎn)量>80Mb/載片。




Q6:G99的應(yīng)用場(chǎng)景及相關(guān)推薦?


G99單張載片通量為80M,最多可同時(shí)運(yùn)行兩張載片。測(cè)序讀長(zhǎng)從SE35到PE150,G99的快速可以助力生育健康、傳感染、腫瘤檢測(cè)等臨床科研的多種應(yīng)用場(chǎng)景。



Q7:G99機(jī)型提供哪些型號(hào)?


G99可以提供DNBSEQ-G99RS和DNBSEQ-G99ARS兩種不同版本的型號(hào),其中:

① DNBSEQ-G99RS:無(wú)生信模塊,下機(jī)能夠穩(wěn)定輸出FASTQ報(bào)告,適用于有生信流程和分析集群的用戶(hù),這部分用戶(hù)可以選擇不含生信模塊的標(biāo)準(zhǔn)配置版。

② DNBSEQ-G99ARS:內(nèi)置生信模塊,能夠自動(dòng)啟動(dòng)高級(jí)分析,兼容基礎(chǔ)的生信分析流程,如華大智造PFI,MetargetCOVID,MGAP,F(xiàn)lu track等。


Q8:G99適配的讀長(zhǎng)具體有哪些?


目前,G99適配讀長(zhǎng)有SE50、SE100、PE100、PE150,涵蓋SE100/PE50兼容試劑盒,APP-C PE150/ SE100試劑盒。此外,DNBSEQ-G99還有更長(zhǎng)讀長(zhǎng)試劑的研發(fā)規(guī)劃,將會(huì)在2023年發(fā)布PE300和SE400讀長(zhǎng)。




Q9:G99平臺(tái)的兼容性與適配性如何?


首先,在兼容性方面,DNBSEQ-G99對(duì)堿基不平衡文庫(kù)具有優(yōu)異的兼容性,與MGISEQ-2000的表現(xiàn)高度一致。


其次,在適配性方面,G99平臺(tái)開(kāi)發(fā)了一體化的APP-C SE100和APP-C PE150試劑盒,可以進(jìn)行轉(zhuǎn)化測(cè)序,且引物序列已經(jīng)內(nèi)置在試劑盒中,無(wú)需手動(dòng)加入。同時(shí),測(cè)序人員若用常規(guī)試劑盒測(cè)雙barcode,不需要和其他平臺(tái)一樣額外購(gòu)買(mǎi)雙barcode測(cè)序盒子。



通過(guò)對(duì)以上9個(gè)問(wèn)題可以對(duì)華大智造今年的年度新品DNBSEQ-G99有一個(gè)更全面的深入了解。作為華大智造推出的第九款測(cè)序儀,G99是中小通量基因測(cè)序儀中的“速度王者”,足夠簡(jiǎn)單、靈活,足以全力釋放大家的測(cè)序速度,期待大家的關(guān)注!




備注:僅供研究使用,不得用于診斷或治療。

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