2023年5月9日,華大智造等機(jī)構(gòu)共同參與研制的國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)ISO/TS 8392:2023“Genomics informatics — Description rules for genomic data for genetic detection products and services(基因組信息學(xué) 基因檢測(cè)產(chǎn)品及服務(wù)的基因組數(shù)據(jù)描述規(guī)則)”正式發(fā)布。該標(biāo)準(zhǔn)由深圳華大生命科學(xué)研究院與中國(guó)標(biāo)準(zhǔn)化研究院聯(lián)合提出,并由國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)化組織健康信息學(xué)技術(shù)委員會(huì)(ISO/TC 215)組織制定,是全球首個(gè)關(guān)于基因檢測(cè)產(chǎn)品及服務(wù)數(shù)據(jù)描述的國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)。
基因組數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化
是基因組數(shù)據(jù)資產(chǎn)管理前提
生命科學(xué)已進(jìn)入基因大數(shù)據(jù)時(shí)代,伴隨基因測(cè)序技術(shù)的發(fā)展和基因測(cè)序成本的不斷下降,產(chǎn)生了海量基因組數(shù)據(jù)。但在基因組數(shù)據(jù)質(zhì)量上,存在著完整性不足、醫(yī)學(xué)信息語(yǔ)義不統(tǒng)一等問題,嚴(yán)重阻礙了基因組數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)、交換、共享和應(yīng)用及產(chǎn)業(yè)化。因此,開展基因組數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化是有效開展基因組數(shù)據(jù)資產(chǎn)管理的前提。
在此背景下,華大智造積極參與到國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)研制工作中,2021年6月,多機(jī)構(gòu)提交了《基因組信息學(xué) 基因檢測(cè)產(chǎn)品及服務(wù)的基因組數(shù)據(jù)描述規(guī)則》國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)提案,同年10月經(jīng)ISO/TC 215正式成員國(guó)投票通過立項(xiàng)。加拿大、美國(guó)、韓國(guó)、奧地利及尼日利亞等國(guó)家指派注冊(cè)專家參與該國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)提案的研制。在研制期間,項(xiàng)目組多次組織各國(guó)專家進(jìn)行線上會(huì)議研討,征求并匯總了ISO/TC 276等相關(guān)國(guó)際聯(lián)絡(luò)組織的意見,推動(dòng)該國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)于2023年5月9日正式發(fā)布。
該國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)主要針對(duì)基因檢測(cè)產(chǎn)品及服務(wù)中所產(chǎn)生的基因組數(shù)據(jù)實(shí)際情況及其上下游相關(guān)方的需求,規(guī)定了基因檢測(cè)產(chǎn)品及服務(wù)中基因組數(shù)據(jù)的類別和描述規(guī)則,明確了基因組數(shù)據(jù)描述的構(gòu)成規(guī)則、標(biāo)識(shí)符及名稱,給出了數(shù)據(jù)元值域的編碼方法。
其次,標(biāo)準(zhǔn)適用于所有基因檢測(cè)產(chǎn)品和服務(wù)的基因組數(shù)據(jù)處理、分析及質(zhì)量評(píng)估,有助于從數(shù)據(jù)完整性和有效性等方面提升數(shù)據(jù)質(zhì)量。因此,該國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)的制定和發(fā)布,為促進(jìn)基因組數(shù)據(jù)在臨床診療和精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究中的應(yīng)用奠定了良好的標(biāo)準(zhǔn)化基礎(chǔ),對(duì)生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展和精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究也具有重要的意義。
華大智造作為測(cè)序設(shè)備的生產(chǎn)商,在基因組數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)制定上的深度參與,將進(jìn)一步加速規(guī)范基因組數(shù)據(jù)形式、數(shù)據(jù)范圍及數(shù)據(jù)規(guī)則,全面提升數(shù)據(jù)產(chǎn)出質(zhì)量;另一方面,也將賦能中下游用戶,為其在數(shù)據(jù)共享、數(shù)據(jù)存儲(chǔ)與應(yīng)用等方面提供基礎(chǔ)支撐,推動(dòng)行業(yè)健康有序發(fā)展。
華大智造BIT平臺(tái)
助力推進(jìn)基因組數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化
要實(shí)現(xiàn)海量基因組數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)化,高質(zhì)量、高密度、高擴(kuò)展、高性價(jià)比的技術(shù)和平臺(tái)必不可少。
針對(duì)萬(wàn)級(jí)、十萬(wàn)級(jí)和百萬(wàn)級(jí)海量數(shù)據(jù),華大智造提供一站式ZTRON基因數(shù)據(jù)中心一體機(jī),能夠全面加速基因組數(shù)據(jù)的處理能力,最大程度降低成本。值得一提的是,ZTRON基因數(shù)據(jù)中心一體機(jī)此前獲得了歐盟EuroPriSe認(rèn)證,符合GDPR要求。
華大智造ZTRON基因數(shù)據(jù)中心一體機(jī)
目前,華大智造ZTRON基因數(shù)據(jù)中心一體機(jī)曾支撐深圳華大生命科學(xué)研究院在10天完成了萬(wàn)人的測(cè)序數(shù)據(jù)分析;同時(shí)也為全球第一個(gè)全民基因組計(jì)劃——阿聯(lián)酋全民基因組計(jì)劃提供了多平臺(tái)支持,整體效率提升30%;也曾助力國(guó)內(nèi)上市公司客戶達(dá)到管理目標(biāo),實(shí)現(xiàn)百萬(wàn)基因測(cè)序?qū)嶒?yàn)室自動(dòng)化。
截至2022年12月31日,華大智造已參與制修訂并發(fā)布的標(biāo)準(zhǔn)累計(jì)48項(xiàng),此次參與國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)的研制中,也將進(jìn)一步推動(dòng)中國(guó)技術(shù)和中國(guó)標(biāo)準(zhǔn)“走出去”。
未來,華大智造將持續(xù)為建設(shè)生命科學(xué)領(lǐng)域數(shù)字化、信息化、標(biāo)準(zhǔn)化提供核心工具支撐,夯實(shí)高質(zhì)量創(chuàng)新基石,以高標(biāo)準(zhǔn)引領(lǐng)行業(yè)發(fā)展。
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