今天的這篇文章來自哥倫比亞Catalina Lopez-Correa博士,目前擔(dān)任加拿大研究所Genome Canada的首席科學(xué)官,致力于基因組學(xué)研究。2012 年,她被評(píng)為100名在海外職業(yè)生涯取得巨大成功的哥倫比亞人之一;2017年,她獲得加拿大參議院150周年紀(jì)念獎(jiǎng)?wù)拢?013年,她榮獲哥倫比亞共和國(guó)榮譽(yù)總統(tǒng)任命的國(guó)家軍官勛章。2023年4月她被診斷出乳腺癌,在世界乳腺癌宣傳日之際,她作為親歷者,講述了她的抗癌之路。
Catalina Lopez-Correa博士在其領(lǐng)英賬號(hào)分享對(duì)基因組學(xué)的感悟和對(duì)華大智造的認(rèn)可
“華大智造這樣的企業(yè)在做的事——將全基因組測(cè)序的單例成本降低至100美元以下非常重要,這將加速基因組學(xué)在腫瘤學(xué)和所有醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的臨床實(shí)施和廣泛使用,具有里程碑式的意義?!盋atalina Lopez-Correa博士
作為醫(yī)學(xué)博士和基因組學(xué)科學(xué)家,我擁有在全球從事科研工作超過20年的經(jīng)驗(yàn),但我從沒想過自己有一天會(huì)成為研究主題本身,從臨床醫(yī)生、研究人員和投資人的身份到成為患者,這是我一生中最困難的轉(zhuǎn)變之一。
2023年4月,我被診斷出患有乳腺癌,這無疑超出了我的人生計(jì)劃。多年來,我一直在國(guó)內(nèi)外各種學(xué)術(shù)論壇上談?wù)撃[瘤、基因組學(xué)、精準(zhǔn)醫(yī)學(xué),但我自己根本沒有準(zhǔn)備好成為腫瘤患者,抗癌之旅是令人恐懼的,也是充滿挑戰(zhàn)的。
收到診斷結(jié)果后,我立刻投入到科學(xué)文獻(xiàn)、報(bào)告和在線論壇中,開始更新我的知識(shí)并全面了解乳腺癌。這就是科學(xué)家的本質(zhì)——我們好奇,我們閱讀,我們學(xué)習(xí),我們探索。同時(shí),我試圖掌控我的治療過程,從診斷到手術(shù)、化療和放療,來試圖看看自己對(duì)病情的判斷是否與臨床醫(yī)生保持一致。不過,最大的挑戰(zhàn)還是在于如何平衡這個(gè)多重的角色:科學(xué)家、醫(yī)生,以及現(xiàn)在更復(fù)雜的患者角色。
我之前在比利時(shí)接受過基因組學(xué)領(lǐng)域相關(guān)的培訓(xùn),獲得了1型神經(jīng)纖維瘤病(neurofibromatosis type 1, NF1) 博士學(xué)位,還繪制出了嚴(yán)重表型患者大片的 DNA 缺失的大小和結(jié)構(gòu)圖。我們使用的繪圖技術(shù)之一是 FISH(熒光原位雜交),它能夠精確描繪缺失邊界并識(shí)別該區(qū)域內(nèi)的重復(fù)基因。巧合的是,F(xiàn)ISH是我的醫(yī)生要求確定我的腫瘤HER2狀態(tài)的第一個(gè)測(cè)試,這是我作為患者第一次接受精準(zhǔn)醫(yī)療。
在收到我的HER2 FISH結(jié)果和其他兩個(gè)生物標(biāo)志物(ER+和PR+)后,我詢問我的外科醫(yī)生是否可以針對(duì)我的腫瘤的進(jìn)行額外基因組檢測(cè)。我知道這三種生物標(biāo)志物或許可以指導(dǎo)治療決策,我希望對(duì)我的腫瘤進(jìn)行全面檢測(cè),并與我的constitutional DNA進(jìn)行比較,以發(fā)現(xiàn)所有突變。然而,事實(shí)證明事情比想象中更復(fù)雜,由于全基因組檢測(cè) (WGS) 的成本高昂,我所在的加拿大不列顛哥倫比亞省規(guī)定只有晚期或轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者才能接受全基因組測(cè)序。幸好我可以參加一項(xiàng)臨床試驗(yàn),該試驗(yàn)可以提供21個(gè)關(guān)鍵基因的基因組分析。
雖然不是全基因組測(cè)序,但我接受了進(jìn)行部分基因組分析的機(jī)會(huì)。結(jié)果出來后,我的腫瘤科醫(yī)生根據(jù)這21個(gè)基因的概況和相關(guān)的“評(píng)分”建議進(jìn)行化療。我很矛盾,一方面因我必須接受化療而感到沮喪,另一方面則很高興看到基因組學(xué)在我的腫瘤精準(zhǔn)治療上提供了有效的輔助和建議。
然而,腫瘤測(cè)序成本高昂,很高興得知像華大智造這樣的測(cè)序公司正在將WGS的價(jià)格降低至100美元以下,我可以想象,將來所有乳腺癌患者都可以從中受益。而不是僅依靠對(duì)21個(gè)基因組測(cè)序來指導(dǎo)治療。這一進(jìn)步可以促進(jìn)基因組學(xué)在臨床環(huán)境中的廣泛整合,從而實(shí)現(xiàn)獲取更全面的患者特異性腫瘤表征,為每位患者提供精細(xì)和精確的診斷。
WGS還可以指導(dǎo)其他治療決策,從在靶向治療受益的患者中,確定癌癥復(fù)發(fā)的風(fēng)險(xiǎn)以及判斷每位患者的整體結(jié)果和預(yù)測(cè)。
過去在作為科學(xué)家的職業(yè)生涯中,我經(jīng)常提到安吉麗娜·朱莉的故事,她的母親死于乳腺癌,通過基因檢測(cè),安吉麗娜發(fā)現(xiàn)她有BRCA1基因突變,該突變顯著增加了她患乳腺癌和卵巢癌的風(fēng)險(xiǎn),這促使她選擇預(yù)防性雙乳切除術(shù)。
作為一名科學(xué)家,更作為一名患者,我也想研究遺傳性癌癥基因的潛在突變。遺憾的是,就我而言,這項(xiàng)檢測(cè)不屬于加拿大醫(yī)療保健系統(tǒng)的承保范圍。盡管如此,我個(gè)人還是承擔(dān)了檢測(cè)費(fèi)用,該檢測(cè)證實(shí)了我在BRCA1、BRCA2和其他遺傳性癌癥基因不存在突變。同樣,測(cè)序的高成本和僅覆蓋少量基因是限制基因組學(xué)和精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)在腫瘤學(xué)中廣泛實(shí)施的重要原因。
最后,作為臨床醫(yī)生、科學(xué)家和乳腺癌患者,這段經(jīng)歷給了我一些思考:基因組學(xué)徹底改變了臨床實(shí)踐,使精準(zhǔn)醫(yī)療成為現(xiàn)實(shí)。乳腺癌不是單一的,它包括許多不同的類型,要根據(jù)腫瘤的生物標(biāo)志物和基因組譜來進(jìn)行鑒別診斷和治療決策。基因組學(xué)正在指導(dǎo)乳腺癌進(jìn)行更加精細(xì)和精確的診斷,并使治療更具針對(duì)性和個(gè)性化。
今年是“人類基因組計(jì)劃”宣告完成的20周年,曾經(jīng)來自六個(gè)國(guó)家的科學(xué)家歷時(shí)約13年,耗資達(dá)38億美元,完成了第一個(gè)人的全基因組測(cè)序。這二十年間,伴隨著技術(shù)的不斷進(jìn)步,基因測(cè)序通量及成本以“超摩爾定律”的速度發(fā)展,但全基因組測(cè)序的成本仍然很高。因此,華大智造這樣的企業(yè)在做的事——將全基因組測(cè)序的單例成本降低至100美元以下非常重要,這將加速基因組學(xué)在腫瘤學(xué)和所有醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的臨床實(shí)施和廣泛使用,具有里程碑式的意義。
基因組學(xué)的普及很有必要。對(duì)于臨床醫(yī)生來說,要了解何時(shí)對(duì)病人進(jìn)行基因組檢測(cè)以及如何根據(jù)檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行治療;對(duì)于患者來說,有權(quán)了解基因組學(xué)在乳腺癌診斷和治療中發(fā)揮的關(guān)鍵作用。我鼓勵(lì)每一位確診乳腺癌的女性對(duì)其腫瘤進(jìn)行基因組檢測(cè),并對(duì)遺傳性乳腺癌基因進(jìn)行分析。
精準(zhǔn)醫(yī)療的時(shí)代即將到來,但確?;颊吖将@取基因組治療仍然充滿挑戰(zhàn)。我很幸運(yùn)能夠通過加拿大的醫(yī)療保健系統(tǒng)進(jìn)行基因組檢測(cè),并且有經(jīng)濟(jì)能力進(jìn)行額外的遺傳性乳腺癌檢測(cè)。
然而,當(dāng)前全球許多患者并不能獲得這些檢測(cè)的機(jī)會(huì),也無法承擔(dān)基因組檢測(cè)的費(fèi)用,這凸顯了將單個(gè)人全基因測(cè)序成本降低至100美元以下、panel(包括分析和報(bào)告)成本降低到50美元以下的緊迫性。在未來,基因組學(xué)測(cè)序成本的降低,以及在科普教育中提升人們對(duì)基因組學(xué)在乳腺癌診斷和治療的認(rèn)知,對(duì)于確保全世界所有乳腺癌患者從基因組學(xué)革命中獲益至關(guān)重要。