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華大智造聯(lián)合多個(gè)單位發(fā)布《2023海洋基因組學(xué)白皮書(shū)》,提供高效eDNA測(cè)序工具

時(shí)間:2023-11-01作者:華大智造閱讀數(shù):4624分享

10月28日-29日,2023年海洋基因組學(xué)會(huì)議暨海洋生物資源學(xué)術(shù)會(huì)議在青島召開(kāi)。會(huì)議上,華大智造聯(lián)合深圳國(guó)家基因庫(kù)、中德生態(tài)園以及華大生命科學(xué)研究院重磅發(fā)布《2023海洋基因組學(xué)白皮書(shū)》,助力全球海洋生態(tài)的保護(hù)和可持續(xù)發(fā)展。


本次會(huì)議以“海洋生物組學(xué):科技驅(qū)動(dòng)的海洋生物遺傳資源研究與應(yīng)用”為主題,交流海洋科技創(chuàng)新、基因科技未來(lái)產(chǎn)業(yè)發(fā)展的現(xiàn)狀并探索未來(lái)發(fā)展趨勢(shì),分享海洋基因組學(xué)領(lǐng)域國(guó)際合作的實(shí)踐經(jīng)驗(yàn),為基因科技未來(lái)產(chǎn)業(yè)發(fā)展蓄勢(shì)聚能。



圖1:《2023海洋基因組學(xué)白皮書(shū)》


相比2018年發(fā)布的首期白皮書(shū),此次發(fā)布的《2023海洋基因組學(xué)白皮書(shū)》增加了近兩倍的數(shù)據(jù),微生物數(shù)據(jù)達(dá)到237Tb,基因組超24000個(gè),全面描繪了現(xiàn)今海洋基因組學(xué)的發(fā)展趨勢(shì)和研究方向,海洋生物基因組破譯貢獻(xiàn)度占全球28%、中國(guó)49%,研究成果將為相關(guān)科學(xué)研究及產(chǎn)業(yè)發(fā)展提供助益。


值得一提的是,由華大智造提供核心工具支撐的“千種海洋生物測(cè)序項(xiàng)目”在會(huì)議上宣布正式啟動(dòng),該項(xiàng)目將開(kāi)展千種海洋生物基因測(cè)序,為全球海洋生物資源的研究和保護(hù)貢獻(xiàn)重要力量。華大智造將為該項(xiàng)目提供全流程的技術(shù)與設(shè)備支持,從樣本保存、核酸提取、文庫(kù)構(gòu)建、高通量測(cè)序、到數(shù)據(jù)分析及存儲(chǔ)所需的軟硬件及試劑耗材等,為海洋生物基因組學(xué)研究全面賦能。


華大智造環(huán)境DNA宏條形碼測(cè)序組合產(chǎn)品

為海洋基因組學(xué)研究提供高效工具


近年來(lái),華大智造助力科研工作人員在海洋生物基因組學(xué)研究方面積極開(kāi)展了多項(xiàng)項(xiàng)目,包括生物進(jìn)化與發(fā)育、生物多樣性與環(huán)境保護(hù)、海洋資源挖掘、海洋基因組與發(fā)育等,并取得了一系列突破性的成果。為了更加高效便捷地進(jìn)行海洋的生物多樣性發(fā)現(xiàn)和監(jiān)測(cè),助力環(huán)境污染和生態(tài)系統(tǒng)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估,華大智造開(kāi)發(fā)出了一套基于環(huán)境DNA宏條形碼(eDNA metabarcoding)測(cè)序的組合產(chǎn)品。



圖2:華大智造環(huán)境DNA宏條形碼測(cè)序組合產(chǎn)品


環(huán)境DNA技術(shù)是20 世紀(jì)以來(lái)生態(tài)環(huán)境領(lǐng)域最重要的革命性技術(shù)之一,它通過(guò)從環(huán)境介質(zhì)(水、土壤、沉積物等)中提取DNA,對(duì)基因組的特定DNA片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增和高通量測(cè)序,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)生物群落的定性、定量分析。高通量測(cè)序的靈敏度優(yōu)勢(shì)可以實(shí)現(xiàn)環(huán)境中痕量DNA的檢測(cè)。采用基于高通量測(cè)序的環(huán)境DNA技術(shù),研究人員可以在一個(gè)樣本中同時(shí)分析數(shù)千個(gè)物種。高通量測(cè)序與eDNA序列相關(guān)聯(lián)的技術(shù)也被稱(chēng)為環(huán)境DNA宏條形碼。


華大智造基于ATOPlex多重PCR技術(shù)和DNBSEQ測(cè)序開(kāi)發(fā)環(huán)境DNA宏條形碼測(cè)序組合產(chǎn)品,搭配自主研發(fā)的自動(dòng)化樣本制備系統(tǒng)與分析軟件,可覆蓋從樣本存儲(chǔ)到數(shù)據(jù)分析全流程,實(shí)現(xiàn)環(huán)境DNA一站式監(jiān)測(cè)。華大智造獨(dú)有的DNBSEQ測(cè)序技術(shù),能夠?yàn)閑DNA的生信分析提供高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù)。


ATOPlex多重PCR 技術(shù),是華大智造自主研發(fā)的超高重 PCR 核心專(zhuān)利技術(shù),可針對(duì)目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行引物設(shè)計(jì),并提供Panel和建庫(kù)試劑等一整套方案,實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)高效的環(huán)境DNA宏條形碼測(cè)序。華大智造環(huán)境DNA宏條形碼測(cè)序組合產(chǎn)品可實(shí)現(xiàn)識(shí)別環(huán)境樣本(水體、土壤和沉積物等)中的微生物、植物、藻類(lèi)和動(dòng)物種類(lèi),具有不損害生物機(jī)體、不受生物發(fā)育時(shí)期限制、靈敏度高、物種覆蓋廣、分析功能強(qiáng)大等特點(diǎn),為生態(tài)環(huán)境基因組學(xué)研究和生物多樣性監(jiān)測(cè)提供強(qiáng)大工具支撐。






圖3:DNBSEQ測(cè)序平臺(tái)助力發(fā)布的海洋生物基因組學(xué)研究成果(部分)

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