國務(wù)院聯(lián)防聯(lián)控機(jī)制指出,今年10月以來,我國流感、肺炎支原體感染活動(dòng)逐步增強(qiáng),預(yù)計(jì)流感將出現(xiàn)全國冬春季流行高峰,肺炎支原體感染未來一段時(shí)間在部分地區(qū)仍將持續(xù)高發(fā)。各地要統(tǒng)籌做好新冠、流感和諾如病毒胃腸炎等重點(diǎn)傳染病監(jiān)測,密切跟蹤疫情形勢變化。
近日,廣州醫(yī)科大學(xué)附屬市八醫(yī)院傳染病研究所基于華大智造呼吸道微生物基因組測序產(chǎn)品組合,對(duì)樣本進(jìn)行精準(zhǔn)的流感病毒亞型識(shí)別,獲得了完整的流感病毒基因組序列,成功對(duì)流感病毒進(jìn)行測序和溯源。
此次流感溯源研究采用MGIEasy呼吸道微生物基因組建庫試劑盒套裝對(duì)40例流感陽性樣本進(jìn)行文庫構(gòu)建,在MGISEQ-2000上進(jìn)行測序,搭配華大智造自主研發(fā)的FluTrack軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)處理,對(duì)樣本全基因組的8個(gè)片段進(jìn)行比對(duì)。結(jié)果表明,40例樣本中,36例樣本(占比90%)的流感基因片段比對(duì)率超過95%,表現(xiàn)出優(yōu)異的基因組測序覆蓋度。
作為較易發(fā)生突變、而且傳染性較強(qiáng)的高發(fā)病率病毒,流感病毒不僅難以辨別于普通感冒,還會(huì)與新型冠狀病毒的交叉流行帶來疊加效應(yīng)負(fù)擔(dān)。利用高通量測序技術(shù)對(duì)流感病毒變異進(jìn)行追蹤,對(duì)新型流感病毒做出預(yù)警,對(duì)流感流行趨勢進(jìn)行監(jiān)測非常重要。
采用華大智造推出的呼吸道微生物基因組測序產(chǎn)品組合,能夠?qū)颖具M(jìn)行精準(zhǔn)的流感病毒亞型識(shí)別,獲得完整的流感病毒基因組序列,有助于疾控部門或科研機(jī)構(gòu)對(duì)流感病毒的追蹤和溯源等工作的高效開展和快速推動(dòng)。
圖1:華大智造呼吸道微生物基因組測序產(chǎn)品組合
其中,MGIEasy呼吸道微生物基因組建庫試劑盒套裝是華大智造采用ATOPlex多重PCR技術(shù)開發(fā)而成,能夠?qū)仔土鞲泻鸵倚土鞲胁《救蚪M進(jìn)行高效地?cái)U(kuò)增和文庫制備;搭配華大智造DNBSEQ測序平臺(tái)完成測序,并使用MGI FluTrack基礎(chǔ)分析系統(tǒng),可實(shí)現(xiàn)對(duì)流感病毒的分型、基因組組裝和溯源研究。
圖2:華大智造呼吸道微生物基因組測序產(chǎn)品組合提供多種通量方案
華大智造呼吸道微生物基因組測序產(chǎn)品組合,自動(dòng)化程度高,數(shù)據(jù)質(zhì)量優(yōu)異,軟件功能強(qiáng)大,能夠?yàn)榱鞲械淖儺惐O(jiān)測和流行病學(xué)調(diào)查提供強(qiáng)大的工具支撐。
未來,秉承“創(chuàng)新智造引領(lǐng)生命科技”的理念,在公共衛(wèi)生應(yīng)用領(lǐng)域,華大智造將持續(xù)致力于滿足病原微生物全基因組測序、靶向測序和宏基因組測序全流程等應(yīng)用場景的需求,為公共衛(wèi)生事件的監(jiān)測和預(yù)警提供更自動(dòng)、更便捷、更高效的國產(chǎn)化核心工具。