近日,由21個機構和10多個參與國家共同努力的全球最大國際微生態(tài)研究計劃——“百萬微生態(tài)” (Million Microbiome of Humans Project,MMHP)披露最新進展,基于華大智造測序平臺已完成樣本量測序超13萬例,較過去半年翻倍增長。
MMHP于2019年在國際基因組學會議(ICG-14)上正式啟動,目標是在三到五年內(nèi)對100萬份人類樣本的微生物DNA進行測序和分析,重點是糞便和唾液,旨在構建世界上最大的人類微生物組數(shù)據(jù)庫。據(jù)了解,項目主要創(chuàng)始成員和聯(lián)盟所在的核心實驗室,如卡羅林斯卡研究所的AmbioGen、丹麥哥本哈根大學和法國國家農(nóng)業(yè)科學院宏基因組研究所MetaGenoPolis將承擔樣本核心測序工作,而其他支持實驗室,如德國ALACRiS Theranostics和法國Nahibu生物技術公司則發(fā)揮輔助支持作用。
MMHP聯(lián)盟聯(lián)合主席、瑞典卡羅林斯卡醫(yī)學院微生物轉(zhuǎn)化研究中心主任Lars Engstrand教授表示:“MMHP旨在利用高通量測序技術的進步,加速和推進宏基因組學研究,這其中一項重點工作就是如何創(chuàng)新和應用可大規(guī)模部署的最佳工作流程。這樣所有的參與方都可以使用簡化的流程,產(chǎn)生有價值的數(shù)據(jù)以促進高質(zhì)量、全面的腸道微生物組圖譜開發(fā)。”
在樣品收集的同時,MMHP聯(lián)盟基于華大智造測序和自動化產(chǎn)品,進行標準化技術工作流程的最終優(yōu)化工作。這套完整的工作流程將適配測序?qū)嶒炛猩婕暗乃嘘P鍵點,確保數(shù)據(jù)的質(zhì)量與可靠性。
MMHP聯(lián)盟聯(lián)合主席、倫敦大學學院教授Stanislav Dusko Ehrlich教授表示:“一旦認識到人類微生物組組成對健康的重要性,微生物組分析在現(xiàn)代醫(yī)療實踐的高結合度是很容易理解的。因此,加強對這個復雜的微生物世界的理解變得勢在必行。通過傳播這項技術并加速這一新興領域的采用,我們的目標就是釋放微生物組學在創(chuàng)新醫(yī)療解決方案的巨大潛力。”
與傳統(tǒng)技術相比,隨著宏基因組學的速度和精度越來越受到科學界的歡迎,MMHP聯(lián)盟致力于通過向參考實驗室轉(zhuǎn)移技術來分享領域?qū)I(yè)知識。在華大智造先進的測序技術、完善的實驗工作流程及各項目成員的支持下,MMHP的目標是在2024年繼續(xù)增強參考實驗室矩陣的能力,使宏基因組學能夠惠及人人。
MMHP前10,000個樣本的性能分析結果證實了華大智造DNBSEQ測序平臺具有高度一致性的表現(xiàn)。與常規(guī)DNA陣列相比,DNBSEQ測序技術具備低重復序列、低標簽跳躍、信號密度高、平衡高通量和高質(zhì)量數(shù)據(jù)的技術優(yōu)勢。借助DNBSEQ測序技術,參與機構能夠擴展宏基因組學的應用和能力,有助于進一步開展相關研究和精準醫(yī)療。
除了可以接入標準化的微生物組分析協(xié)議和基于華大智造測序平臺的鳥槍法宏基因組測序外,參與MMHP的其他好處還包括可以提前獲取聯(lián)盟生成的數(shù)據(jù),并可成為相關研究論文的共同作者。該項目最終將實現(xiàn)100萬份樣本的測序和分析。當前,項目組歡迎醫(yī)學、科學及業(yè)界機構的積極參與,共同為研究人類健康和疾病中的微生物組學作出貢獻,改善全球健康。