2019年5月20-22日,華大智造受邀參加由日本理化學研究所(RIKEN)在日本東京主辦的歐洲分子生物組織(EMBO)單細胞生物學研討會。5月21日,華大智造聯合RIKEN獻上了一場精彩的衛(wèi)星會。會議期間,華大智造宣布將與10x Genomics 公司共同致力于為用戶提供單細胞測序的完整平臺。
華大智造利用其全新的文庫轉換技術與10x Genomics 的 Chromium系統相配合,最終達成了10x Genomics 公司的單細胞測序技術與MGISEQ平臺及BGISEQ平臺完美兼容。
目前,基于華大智造測序平臺產出的單細胞RNA數據已分別被英國Wellcome Sanger研究所和位于澳大利亞悉尼的Garvan醫(yī)學研究所所驗證。兩項研究均旨在評估華大智造與市面其他同類產品在單細胞RNA測序技術方面的表現。分析結果表明,華大智造產出的測序數據具有可比性,且成本更低。華大智造獨有的DNBSEQTM技術具有高準確性、低重復序列率、低標簽跳躍的重要特性,可始終擴增原版DNA,避免錯誤積累,并兼具測序信號強度和準確性,以實現最高效準確的大規(guī)模并行測序。
華大智造首席運營官蔣慧表示:“基于DNBSEQTM的測序技術,單細胞RNA測序在華大智造平臺上的數據表現十分出色,相信與10x Genomics 公司的合作將為客戶提供更有價值的技術平臺解決方法。我們的文庫轉換技術也將在未來有更廣闊的應用,現在僅僅是個開始?!?/span>
在5月21日的智造衛(wèi)星會議上,來自英國Wellcome Sanger 研究所的Sarah Teichmann 博士和 Kedar Natarajan博士也展示了今年4月份發(fā)表在Genome Biology 的研究成果【1】。該項研究分析基于DNBSEQTM技術的華大智造測序平臺數據表現優(yōu)異,與Illumina 相當。
早在今年2月份,另外一項研究也得出了類似的結論。Garvan 醫(yī)學研究所與華大團隊共同分析了在10x Genomics 平臺上的7萬多個單細胞,并使用MGISEQ-2000,Illumina NextSeq 500和NovaSeq 6000進行測序。研究結果表明,MGISEQ-2000和NovaSeq的數據具有可比性,而MGISEQ-2000的表現優(yōu)于NextSeq 500,可以識別更多的細胞、基因和UMI,該項研究結果已于今年2月份公開發(fā)布在BioRxiv上【2】。
2018年1月,華大智造在10x Genomics公司的Compatible Certification Program中共同探索單細胞測序技術。一年多的時間過去,越來越多的實驗結論已經證實了華大智造測序平臺的表現,我們也能十分清晰地看到,MGISEQ與BGISEQ 測序平臺已展示出其開放性與兼容性,同樣的,10x Genomics平臺也是如此。
華大智造提供的單細胞生物學兼容解決平臺證明了其 DNBSEQ文庫與市面上現有的測序應用可以兼容,相信未來華大智造也絕不會止步于此,將持續(xù)推動創(chuàng)新,不僅對其他的單細胞生物技術兼容,而且通過其通用轉換技術為腫瘤檢測、外顯子測序和傳染感染疾病檢測提供有效且經濟實惠的平臺。
參考文獻
[1] Kedar Nath Natarajan etal. Comparative analysis of sequencing technologies for single-cell transcriptomics【J】Genome Biology,2019
[2] Anne Senabouth etal.Comparative performance of the BGI and Illumina sequencing technology for single-cell RNA-sequencing[J]bioRxiv,2019