單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)解決了細(xì)胞異質(zhì)性問(wèn)題,極大地提升我們對(duì)生命系統(tǒng)認(rèn)知的分辨率,已經(jīng)成為生命科學(xué)研究的常規(guī)手段。華大智造單細(xì)胞平臺(tái)在科研應(yīng)用方面已經(jīng)積累了一定的實(shí)踐基礎(chǔ),涵蓋多個(gè)研究和應(yīng)用領(lǐng)域,如腫瘤研究、細(xì)胞圖譜繪制、腦科學(xué)等。
截至目前,基于華大智造單細(xì)胞DNBelab C系列產(chǎn)品(3’RNA及ATAC),累計(jì)發(fā)表SCI論文65篇。其中,2022年發(fā)表36篇(包含2篇Nature主刊文章),2023年發(fā)表21篇(包括2篇Cell主刊文章),2024年2篇,累計(jì)影響因子超過(guò)1000分,是國(guó)產(chǎn)單細(xì)胞平臺(tái)中可以在Nature、Science和Cell(簡(jiǎn)稱CNS)主刊上發(fā)表多篇科研論文的平臺(tái)。
華大智造的單細(xì)胞平臺(tái)在科研應(yīng)用方面涵蓋廣泛領(lǐng)域,尤其在腫瘤研究、細(xì)胞圖譜繪制、腦科學(xué)、免疫學(xué)等領(lǐng)域貢獻(xiàn)突出。文章研究的物種,除了最多的人和鼠分別占比33.8%和22.1%外,還涉及其他14個(gè)物種的研究(如猴、斑馬魚、螞蟻、擬南芥等)。文章不止涉及單組學(xué)(RNA或ATAC)應(yīng)用,還涉及多組學(xué)聯(lián)合分析,包括多組學(xué)單細(xì)胞技術(shù)DNBelab C-3’RNA和DNBelab C-ATAC聯(lián)合分析的文章有9篇,DNBelab C-3’RNA和時(shí)空組學(xué)技術(shù)Stereo-seq聯(lián)合分析的文章8篇,相關(guān)研究具有多模態(tài)化、精細(xì)化、立體化的趨勢(shì),表明DNBelab C系列產(chǎn)品在單細(xì)胞領(lǐng)域的科研中發(fā)揮了關(guān)鍵作用,助力科學(xué)家們?cè)谙嚓P(guān)科研領(lǐng)域的深入探索。
創(chuàng)新智造工具助力單細(xì)胞組學(xué)
進(jìn)入標(biāo)準(zhǔn)化、規(guī)?;瘯r(shí)代
華大智造自2019年推出國(guó)內(nèi)首個(gè)DNBelab C4單細(xì)胞便攜式平臺(tái)以來(lái),已經(jīng)成功推出了三代單細(xì)胞3’RNA建庫(kù)試劑盒產(chǎn)品。目前,第四代單細(xì)胞3’RNA-V3.0產(chǎn)品正在接受合作伙伴的試用,并已收獲了廣泛的好評(píng),最新版本的產(chǎn)品是經(jīng)過(guò)五年的精心研發(fā)和改進(jìn),采用了獨(dú)特的多磁珠捕獲細(xì)胞系統(tǒng),性能卓越。
該產(chǎn)品的捕獲效率穩(wěn)定在50%以上,不使用樣本標(biāo)簽情況下最多單張載片可以捕獲2萬(wàn)個(gè)細(xì)胞,使用樣本標(biāo)簽產(chǎn)品標(biāo)記可進(jìn)行混樣測(cè)序,最多單通道可以捕獲4.5萬(wàn)個(gè)細(xì)胞,以人類外周血單核細(xì)胞(PBMC)和小鼠腦細(xì)胞核樣本為例,兩個(gè)樣本類型的平均每個(gè)細(xì)胞基因中位數(shù)檢均可以達(dá)到2000個(gè)以上;這些突破性的優(yōu)化,標(biāo)志著華大智造在單細(xì)胞領(lǐng)域的技術(shù)和應(yīng)用已達(dá)到新的高度,為生物醫(yī)學(xué)研究提供了強(qiáng)大的工具,尤其在精準(zhǔn)醫(yī)療和復(fù)雜生物系統(tǒng)的研究中展現(xiàn)出巨大的潛力。
人PBMC,投入細(xì)胞20,000,基因中位數(shù)2763個(gè)
小鼠腦細(xì)胞核,投入細(xì)胞核20,000,基因中位數(shù)2657個(gè)
此外華大智造在單細(xì)胞組學(xué)建庫(kù)產(chǎn)品上還布局了單細(xì)胞ATAC建庫(kù)試劑盒,單細(xì)胞CUT&Tag建庫(kù)試劑盒,在硬件上基于液滴微流控技術(shù)推出了便攜的C4系統(tǒng)和獨(dú)立多通道的TaiM 4(泰山)單細(xì)胞液滴生成儀器可供選擇;
便攜C4和獨(dú)立多通道TaiM 4、單細(xì)胞建庫(kù)試劑盒
華大智造憑借具備原材料生產(chǎn)及加工的規(guī)?;芰Γ瑯O大的降低了單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的成本,使得科研學(xué)者都能夠更低門檻的進(jìn)入單細(xì)胞研究時(shí)代,加上華大智造的高通量測(cè)序、自動(dòng)化樣本處理和建庫(kù)、BIT數(shù)據(jù)處理產(chǎn)品的布局和華大時(shí)空組學(xué)的領(lǐng)先技術(shù),對(duì)于細(xì)胞組學(xué)的布局形成了完整、全面的一站式平臺(tái)和實(shí)驗(yàn)室前沿技術(shù)方案,促進(jìn)更多科研學(xué)者能夠規(guī)?;蜆?biāo)準(zhǔn)化的產(chǎn)出單細(xì)胞數(shù)據(jù)。
MGI全流程單細(xì)胞產(chǎn)品
DCS多組學(xué)實(shí)驗(yàn)室
此外,華大智造注重單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)普及應(yīng)用的生態(tài)鏈建設(shè),2023年新增哈爾濱星云生物信息技術(shù)有限公司、武漢愛(ài)基百客生物科技有限公司和華智生物技術(shù)有限公司三家認(rèn)證服務(wù)商,國(guó)內(nèi)累計(jì)完成認(rèn)證的單細(xì)胞DNBelab C系列產(chǎn)品服務(wù)的公司達(dá)到12家。
2023年新增的三家單細(xì)胞DNBelab C系列產(chǎn)品認(rèn)證服務(wù)商
2023年基于華大智造DNBelab C系列
單細(xì)胞平臺(tái)發(fā)表的科研論文
附加:歷年DNBelab C系列單細(xì)胞平臺(tái)發(fā)表文章