冬去春來(lái),溫度起伏,正是呼吸道傳染病高發(fā)的季節(jié)。
近日,銅陵市疾控中心(以下簡(jiǎn)稱(chēng)“銅陵疾控”)微生物實(shí)驗(yàn)室通過(guò)華大智造呼吸道微生物基因組測(cè)序產(chǎn)品組合完成對(duì)流感病例樣本的全基因組測(cè)序,成功獲取了流感病毒的全基因組序列信息,對(duì)樣本進(jìn)行了精準(zhǔn)的流感病毒亞型識(shí)別并揭示其內(nèi)在遺傳變異規(guī)律和可能影響傳播力、毒力的重要突變位點(diǎn)。借助于全基因組測(cè)序技術(shù)在流感病毒中的應(yīng)用,極大地提升了銅陵市應(yīng)對(duì)季節(jié)性流感及潛在流感病毒變異株的防控能力。
在安徽省,不僅在銅陵市,馬鞍山、亳州以及宣城等多地疾控中心均已使用華大智造提供的呼吸道微生物基因組測(cè)序產(chǎn)品組合加強(qiáng)流行性感冒的監(jiān)測(cè)和研究。銅陵疾控自2022年部署華大智造呼吸道微生物基因組測(cè)序產(chǎn)品組合以來(lái),已利用MGISEQ-200測(cè)序儀對(duì)新冠病毒基因進(jìn)行測(cè)序,并在近年進(jìn)一步啟動(dòng)宏基因組測(cè)序與流感病毒測(cè)序工作,持續(xù)提升傳染病防控和各類(lèi)病原體監(jiān)測(cè)能力。
華大智造MGISEQ-200測(cè)序儀在銅陵疾控
作為較易發(fā)生突變、而且傳染性較強(qiáng)的高發(fā)病率病毒,流感病毒不僅難以辨別于普通感冒,還會(huì)與新型冠狀病毒的交叉流行帶來(lái)疊加效應(yīng)負(fù)擔(dān)。因此,利用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)流感病毒變異進(jìn)行追蹤,對(duì)新型流感病毒做出預(yù)警,優(yōu)化流感疫苗接種策略及流感流行趨勢(shì)進(jìn)行監(jiān)測(cè)非常重要。
銅陵疾控工作人員處理流感病毒樣本
華大智造開(kāi)發(fā)的呼吸道微生物基因組測(cè)序產(chǎn)品組合,能夠?qū)颖具M(jìn)行精準(zhǔn)的流感病毒亞型識(shí)別,獲得完整的流感病毒基因組序列,有助于疾控部門(mén)或科研機(jī)構(gòu)對(duì)流感病毒的追蹤和溯源等工作的高效開(kāi)展和快速推動(dòng)。
此組合產(chǎn)品中的MGIEasy呼吸道微生物基因組建庫(kù)試劑盒套裝采用華大智造ATOPlex多重PCR技術(shù)開(kāi)發(fā)而成,能夠?qū)仔土鞲泻鸵倚土鞲胁《救蚪M8個(gè)片段進(jìn)行高效地?cái)U(kuò)增和文庫(kù)制備;搭配華大智造不同通量的DNBSEQ測(cè)序儀平臺(tái)以及裝載在華大智造生信分析加速模塊MegaBOLT服務(wù)器上的MGI FluTrack基礎(chǔ)分析系統(tǒng),能夠快速準(zhǔn)備地實(shí)現(xiàn)對(duì)流感病毒的分型、基因組組裝和溯源。此外,華大智造還開(kāi)發(fā)了一系列高質(zhì)量的MGISP自動(dòng)化系統(tǒng)可搭配ATOPlex試劑盒進(jìn)行建庫(kù),極大地提升通量和效率,進(jìn)一步解放科研人員雙手。
華大智造呼吸道微生物基因組測(cè)序產(chǎn)品組合提供多種通量方案
華大智造呼吸道微生物基因組測(cè)序產(chǎn)品組合
華大智造呼吸道微生物基因組測(cè)序產(chǎn)品組合,自動(dòng)化程度高,數(shù)據(jù)質(zhì)量?jī)?yōu)異,軟件功能強(qiáng)大,能夠?yàn)榱鞲械淖儺惐O(jiān)測(cè)和流行病學(xué)調(diào)查提供強(qiáng)大的工具支撐。通過(guò)對(duì)流感病毒全基因組序列的實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)與動(dòng)態(tài)分析,可以更精確地捕捉到流感疫情的發(fā)展趨勢(shì),針對(duì)可能出現(xiàn)新的或高致病性變異株及時(shí)發(fā)出預(yù)警,進(jìn)而制定出更為科學(xué)、精準(zhǔn)的防控策略。因此,它能夠進(jìn)一步助力我國(guó)流感監(jiān)測(cè)工作,提高全國(guó)流感監(jiān)測(cè)能力和水平,并提升全國(guó)流感監(jiān)測(cè)網(wǎng)絡(luò)對(duì)呼吸道傳染病的防控能力。
在公共衛(wèi)生領(lǐng)域,華大智造已形成病原微生物宏基因組測(cè)序、靶向測(cè)序、全基因組測(cè)序等應(yīng)用場(chǎng)景的全流程產(chǎn)品組合。未來(lái),秉承“創(chuàng)新智造引領(lǐng)生命科技”的理念,華大智造將持續(xù)研發(fā)創(chuàng)新,為公共衛(wèi)生事件的監(jiān)測(cè)和預(yù)警提供更自動(dòng)、更便捷、更高效的自主核心工具。