2024年6月5日至7日，亞洲動植物基因組學大會 PAG Asia 2024在深圳大梅沙召開，本次大會專家云集，華大智造以 "What if genome sequencing technologies become a revolution in the field of agriculture？"為參會主題亮相現(xiàn)場，正式推出大規(guī)模農(nóng)業(yè)基因組學Low-pass WGS全流程產(chǎn)品。

大規(guī)模農(nóng)業(yè)基因組學Low-pass WGS全流程產(chǎn)品是一套專為農(nóng)業(yè)科研和育種應用而開發(fā)的全流程組合產(chǎn)品，包括硬件、軟件和試劑，涵蓋“核酸提取-建庫-測序-生信分析”流程，配備靈活組合的自動化方案，可滿足不同的通量需求。通過全新的板式建庫試劑盒搭配Low-pass WGS技術(shù)，以高通量、低成本、靈活快捷、自動化友好為特點，能夠?qū)崿F(xiàn)畜禽基因組的大規(guī)模測序與高效分析，為畜禽遺傳改良和分子育種提供了強有力的工具支撐。

相較于傳統(tǒng)芯片分型，這款組合產(chǎn)品無需提前篩選育種相關信息位點、無需定制個性化芯片、無需最低訂購量，以幾乎相同的成本即可獲得接近全基因組范疇位點數(shù)據(jù)，助力育種計算模型的升級迭代，大幅提升育種值測算準確率。同時，用戶可選擇非標定制方案，廣大農(nóng)業(yè)基因組學專家對不同物種、不同通量、不同交付時效的需求，都可以通過這套組合產(chǎn)品的靈活方案來完成。

當前，華大智造推出的農(nóng)業(yè)基因組學大規(guī)模Low-pass WGS全流程組合產(chǎn)品包括標準版和基礎版兩個版本，其中標準版基于高通量基因測序儀DNBSEQ-T7（年樣本量在100k-1000k），基礎版基于中高通量基因測序儀MGISEQ-2000（年樣本量10K-50K)。

基于MGISEQ-2000打造的中通量全流程方案 (192樣本/天)，均一化和制備DNB共用同一臺MGISP-100

基于DNBSEQ-T7打造的高通量全流程方案 (1536樣本/天)

高通量Low-pass WGS全流程組合產(chǎn)品

有哪些“秘密武器”？

01無需純化，建庫僅需3步

傳統(tǒng)的PCR-FREE建庫過程需要經(jīng)歷打斷、純化、連接反應、純化、定量、均一化/pooling過程。華大智造在這套全流程組合產(chǎn)品中全新推出的MGIEasy Large-scale PCR-FREE 全基因組低深度文庫制備模塊（板式）試劑盒專為Low-pass WGS應用而設計, 僅需三步（打斷、連接反應、等體積pooling），即可實現(xiàn)無純化建庫過程，大大縮短大規(guī)模建庫中所需的時間。

02全流程高度自動化

華大智造自研的實驗室自動化平臺，Low-pass WGS組合產(chǎn)品突破了大規(guī)模建庫通量的限制，能夠以最少的自動化設備靈活匹配超高通量的實驗室需求，從而在短時間內(nèi)低成本、高度自動化地完成大規(guī)模提取、建庫、均一化和Pooling，最多只需要5臺自動化設備就能滿足DNBSEQ-T7的滿通量運行的需求。

03通量靈活，效率領先

該組合產(chǎn)品基于DNBSEQ-T7標準版方案，日通量可達1536個樣本，周通量7680個樣本，年通量可達38.4萬個樣本；基于MGISEQ-2000中通量方案日通量可達192個樣本，周通量480個樣本，年通量為2.4萬個樣本（以豬的1x測序深度為例，單個樣本數(shù)據(jù)量為3G，以一周6天，每年50周計算）。

04簡易操作，極速享受

組合方案中使用華大智造自主研發(fā)的生物信息分析加速器和自研Low-pass WGS分析加速軟件，其中MegaBOLT可以處理192 個樣本/24 h，ZBOLT Pro可以處理1536 個樣本/24 h，其SNP位點信息與微陣列/50x WGS分析結(jié)果的一致性高達98%（以豬的1x測序深度為例）。

目前，華大智造推出的農(nóng)業(yè)大規(guī)模Low-pass WGS全流程產(chǎn)品已提供部分物種的參考基因組集合，用戶無需自行構(gòu)建數(shù)據(jù)庫即可進行豬的基因分型, 還可為已擁有豬參考基因組集合的用戶提供免費格式轉(zhuǎn)換服務。

組學專家齊聚，共話學術(shù)前沿

在6月6日和7日的兩場專業(yè)論壇上，來自產(chǎn)業(yè)界的組學服務商代表和學術(shù)界的組學專家對業(yè)內(nèi)組學技術(shù)的應用展開了充分的探討。

博瑞迪應用科學家周靖航博士、華智生物分子育種技術(shù)智創(chuàng)中心總監(jiān)唐順學博士強調(diào)了DNBSEQ平臺在基因組學研究和農(nóng)業(yè)育種中的重要作用。周靖航博士分享了GBTS技術(shù)與DNBSEQ平臺結(jié)合在基因分型方面的卓越性能，在動植物品種鑒定、功能基因檢測、全基因組選擇等應用方向上具有出色表現(xiàn)。唐順學博士則強調(diào)了DNBSEQ平臺在推動生物技術(shù)(BT)、數(shù)據(jù)技術(shù)(DT)和人工智能(AI)方向融合驅(qū)動育種工作中的關鍵作用，可為智能和精準農(nóng)業(yè)育種提供強有力的支持。

來自中國農(nóng)業(yè)大學的胡曉湘教授，聯(lián)邦水產(chǎn)與漁業(yè)研究所的Mugue教授以及西北農(nóng)林科技大學的姜雨教授、澳大利亞阿德萊德大學Lloyd Low等人共同強調(diào)了 DNBSEQ 平臺在動物育種領域的應用。胡曉湘教授突出了大規(guī)模平行測序技術(shù)在豬和其他畜禽基因組選擇中的重要作用，指出了其在加速優(yōu)良遺傳特性識別和推動產(chǎn)業(yè)可持續(xù)發(fā)展方面的貢獻。

Mugue 教授強調(diào)了DNBSEQ平臺在虹鱒和三文魚基因組研究中的重要作用，對這些魚類基因組的深入研究，可以使科學家們能夠識別出與生長速度、抗病性和適應性等重要經(jīng)濟性狀相關的基因標記，進而指導育種計劃，提高養(yǎng)殖效率和產(chǎn)品質(zhì)量；姜雨教授表示基于機器學習算法的荷斯坦牛繁殖性狀基因組選擇方法搭配DNBSEQ平臺，能夠深入挖掘大規(guī)模測序數(shù)據(jù)下的基因與性狀的復雜關聯(lián)，為精準預測基因組估計育種值（GEBV）提供新的途徑。Lloyd Low展示了low-pass WGS以及TCS 70K panel 搭配DNBSEQ平臺對?；蚪M進行分析的成功案例，并表示有望拓展到其他更多物種。

針對本次重磅推出的農(nóng)業(yè)基因組學 Low-pass WGS 全流程組合產(chǎn)品，胡曉湘教授表示，“所測即所得，所得即所用，華大智造測序平臺和 Low-pass WGS 應用結(jié)合，將助力農(nóng)業(yè)動物育種大模型，提升育種效率?！?

此外，與會專家指出：“利用DNBSEQ平臺進行全基因組測序，我們成功識別了影響肉雞母系生產(chǎn)性能的關鍵SNP位點。這一發(fā)現(xiàn)不僅優(yōu)化了基因組選擇和全基因組關聯(lián)分析的策略，而且，隨著DNBSEQ-T7測序儀的引入，大規(guī)?；蚪M學研究的成本也得到了有效降低。”

華大智造產(chǎn)品市場中心胡豆博士參加工業(yè)論壇

參會人員合影

結(jié)語

PAG Asia 2024作為一場專注于動植物基因組學研究的國際性盛會，成功匯聚了全球動植物基因組學領域的專家學者，提供了一個交流最新科研成果和技術(shù)創(chuàng)新的絕佳平臺。

華大智造全新推出的農(nóng)業(yè)高通量Low-pass WGS全流程組合產(chǎn)品，旨在解決全球人口增長、氣候變化和環(huán)境壓力下的農(nóng)業(yè)挑戰(zhàn)。通過降低測序成本和技術(shù)創(chuàng)新，為農(nóng)業(yè)領域提供從核酸提取到數(shù)據(jù)分析的全流程組合產(chǎn)品，縮短育種周期，提升育種效率，促進農(nóng)民、育種者和研究人員培育性能優(yōu)越的品種，減少資源消耗，促進農(nóng)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。  

推薦訂購信息

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