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華大“全讀長(zhǎng)”測(cè)序儀系列助力中國(guó)疾控中心預(yù)防控制艾滋病

時(shí)間:2024-12-01作者:華大智造閱讀數(shù):6468分享

據(jù)新華社報(bào)道,在第37個(gè)世界艾滋病日前夕,中共中央政治局委員、國(guó)務(wù)院副總理劉國(guó)中到中國(guó)疾控中心調(diào)研艾滋病防治工作,看望慰問(wèn)一線防治工作者和相關(guān)科研人員。他強(qiáng)調(diào),要深入學(xué)習(xí)貫徹習(xí)近平總書記重要指示精神,落實(shí)黨中央、國(guó)務(wù)院決策部署,創(chuàng)新醫(yī)防協(xié)同、醫(yī)防融合機(jī)制,壓實(shí)各方責(zé)任,健全服務(wù)體系,扎實(shí)做好艾滋病防治各項(xiàng)工作,持續(xù)提升防治成效,為增進(jìn)人民群眾健康福祉提供有力保障。


不久之前,中國(guó)疾病預(yù)防控制中心性病艾滋病預(yù)防控制中心(以下簡(jiǎn)稱“中國(guó)疾控艾防中心”)病毒免疫室使用華大智造MGISEQ-2000高通量測(cè)序儀和華大序風(fēng)CycloneSEQ-WT02納米孔測(cè)序儀,對(duì)HIV病毒近全長(zhǎng)擴(kuò)增子進(jìn)行了測(cè)序分析,鑒定出新的HIV-1CRF分枝CRF172 0755,并提供了該重組型的詳細(xì)信息。這對(duì)于制定有效的艾滋病防控策略至關(guān)重要,并為理解HIV-1在中國(guó)MSM(男男性行為)群體中的傳播和進(jìn)化提供了新的洞察。值得一提的是,通過(guò)將CycloneSEQ納米孔測(cè)序儀與DNBSEQ高通量測(cè)序儀結(jié)合使用,研究團(tuán)隊(duì)組裝了完整的HIV近全長(zhǎng)基因組,為鑒定HIV超感染或新型重組病毒提供了可靠的方法學(xué)支撐。



HIV-1CRF分枝CRF172 0755近全長(zhǎng)基因組


HIV超感染是指HIV感染者再次感染了一種新的、在系統(tǒng)發(fā)生學(xué)上與可檢測(cè)到的病毒毒株不同的病毒毒株, 兩種不同的HIV毒株可以進(jìn)入同一細(xì)胞,通過(guò)交換基因片段形成新的重組病毒。這種情況可能與初次感染一樣常見(jiàn),并且不限于高風(fēng)險(xiǎn)人群。多重感染即使在之前已經(jīng)控制了HIV感染的人群中也會(huì)發(fā)生,它可能會(huì)降低治療的臨床療效,加快病情發(fā)展,并增加HIV抗藥性。通過(guò)檢測(cè)超感染患者體內(nèi)HIV毒株的基因序列,可以了解HIV毒株的來(lái)源重組情況、傳播路線等,這對(duì)理解HIV的傳播模式、毒株的變異和進(jìn)化具有重要意義,也為艾滋病耐藥監(jiān)測(cè)和感染溯源提供支撐。



HIV超感染傳播模式示意圖


基因測(cè)序技術(shù)能夠提供大量的核酸序列信息,可以覆蓋HIV基因組的近全長(zhǎng),能更準(zhǔn)確地識(shí)別和區(qū)分HIV的不同亞型和準(zhǔn)種以及多種藥物的耐藥位點(diǎn)。相比于傳統(tǒng)的PCR產(chǎn)物克隆法和終點(diǎn)有限稀釋PCR法,基因測(cè)序技術(shù)操作更為簡(jiǎn)便、檢測(cè)成本較低。不僅如此,基因測(cè)序技術(shù)還具有高靈敏度,能夠檢測(cè)到低豐度的病毒變異,對(duì)于監(jiān)測(cè)病毒的變異和演化具有重要價(jià)值,有助于病毒的溯源調(diào)查、耐藥監(jiān)測(cè)以及輔助臨床診斷和治療。


HIV超感染的鑒定之外,HIV-1耐藥監(jiān)測(cè)也是全球艾滋病防控的重要組成部分,隨著抗病毒治療的廣泛實(shí)施,HIV耐藥性問(wèn)題逐漸成為影響治療效果的關(guān)鍵挑戰(zhàn)?;驕y(cè)序設(shè)備的應(yīng)用能夠使耐藥突變檢測(cè)更加高效精準(zhǔn),為艾滋病抗病毒治療提供有力支持;同時(shí),結(jié)合自動(dòng)化建庫(kù)設(shè)備的使用,可實(shí)現(xiàn)樣本處理全流程自動(dòng)化,大幅減少人工操作時(shí)間,提升一致性和效率,為耐藥檢測(cè)在各級(jí)疾控中心的日常應(yīng)用和臨床普及奠定基礎(chǔ)。


去年,華大智造基于自主研發(fā)的文庫(kù)制備試劑、自動(dòng)化樣本制備系統(tǒng)、DNBSEQ測(cè)序儀以及分析軟件發(fā)布了HIV-1耐藥測(cè)序組合產(chǎn)品,實(shí)現(xiàn)從病毒RNA到報(bào)告全流程覆蓋,可對(duì)樣本中的HIV-1病毒進(jìn)行快速、精準(zhǔn)的耐藥檢測(cè)和分型,賦能艾滋病耐藥監(jiān)測(cè)與流行病學(xué)研究。截至目前,該組合相關(guān)設(shè)備已陸續(xù)被引入國(guó)家疾控及廣東、廣西、四川、貴州、上海等多個(gè)地方疾控中心。



HIV-1耐藥測(cè)序組合產(chǎn)品全流程


同時(shí),華大智造已展開(kāi)研發(fā)基于CycloneSEQ平臺(tái)的HIV全長(zhǎng)基因組測(cè)序組合產(chǎn)品,將充分結(jié)合納米孔基因測(cè)序儀長(zhǎng)讀長(zhǎng)的優(yōu)勢(shì),實(shí)現(xiàn)更準(zhǔn)確地識(shí)別不同亞型和準(zhǔn)種,更深入地理解HIV的遺傳多樣性和病毒變異,為識(shí)別HIV超感型別提供更靈敏、更準(zhǔn)確、更全面的工具支撐。


華大智造是全球少數(shù)幾家能夠自主研發(fā)并量產(chǎn)從Gb級(jí)至Tb級(jí)低中高不同通量的臨床級(jí)基因測(cè)序儀企業(yè)之一, 也是全世界唯一擁有激發(fā)光、自發(fā)光、不發(fā)光三種不同技術(shù)路徑測(cè)序儀的公司。在公共衛(wèi)生領(lǐng)域,華大智造已形成病原微生物宏基因組測(cè)序、靶向測(cè)序、全基因組測(cè)序等應(yīng)用場(chǎng)景的全流程產(chǎn)品組合,通過(guò)研發(fā)創(chuàng)新持續(xù)為公共衛(wèi)生事件的監(jiān)測(cè)和預(yù)警提供更自動(dòng)、更便捷、更高效的自主核心工具。


未來(lái),華大智造將繼續(xù)發(fā)揮工具的創(chuàng)新力量,在改善人類健康之路上與全球生態(tài)伙伴緊密合作,提供覆蓋長(zhǎng)短讀長(zhǎng)的完整測(cè)序解決方案,持續(xù)推動(dòng)基因測(cè)序速度、讀長(zhǎng)、準(zhǔn)確率及測(cè)序成本等各個(gè)關(guān)鍵指標(biāo)突破,讓基因測(cè)序更可及、讓生命皆可測(cè),讓科技創(chuàng)新實(shí)實(shí)在在服務(wù)于人類的健康和福祉。

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